MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 chromosome

Total Repeats: 18119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006155	CAT	2	6	1095251	1095256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_006155	ATGG	2	8	1095262	1095269	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_006155	A	6	6	1095345	1095350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_006155	A	6	6	1095392	1095397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_006155	TC	3	6	1095422	1095427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_006155	TGG	2	6	1095989	1095994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_006155	TAA	2	6	1095995	1096000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_006155	TA	3	6	1096025	1096030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_006155	AT	3	6	1096032	1096037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_006155	TAT	2	6	1096041	1096046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_006155	TTG	2	6	1096072	1096077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_006155	ATTT	2	8	1096086	1096093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_006155	TGC	2	6	1096123	1096128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_006155	TC	3	6	1096164	1096169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_006155	TAT	2	6	1096180	1096185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_006155	AAT	2	6	1096188	1096193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_006155	A	6	6	1096451	1096456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_006155	ATAA	2	8	1096464	1096471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_006155	ACA	2	6	1096482	1096487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_006155	G	6	6	1096494	1096499	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_006155	TACT	2	8	1096558	1096565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_006155	TCA	2	6	1096566	1096571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_006155	TAAT	2	8	1096618	1096625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_006155	GAG	2	6	1096690	1096695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_006155	TAT	2	6	1097334	1097339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_006155	ACT	2	6	1097366	1097371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_006155	GCG	2	6	1097398	1097403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_006155	GTA	2	6	1097413	1097418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_006155	AAT	2	6	1097436	1097441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_006155	CGGT	2	8	1097444	1097451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_006155	T	6	6	1097451	1097456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_006155	GAA	2	6	1098031	1098036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_006155	TG	3	6	1098056	1098061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_006155	TG	3	6	1098065	1098070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_006155	TG	3	6	1098074	1098079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_006155	CTGA	2	8	1098087	1098094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_006155	TAAT	2	8	1098099	1098106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_006155	ATT	2	6	1098135	1098140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_006155	T	6	6	1098151	1098156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_006155	ATT	2	6	1098217	1098222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_006155	T	6	6	1098295	1098300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_006155	GCC	2	6	1098324	1098329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_006155	T	7	7	1098337	1098343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_006155	ATC	2	6	1098350	1098355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_006155	ATA	2	6	1098450	1098455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_006155	CT	3	6	1098844	1098849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_006155	ATC	2	6	1098869	1098874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_006155	TACT	2	8	1098884	1098891	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_006155	GATGT	2	10	1098962	1098971	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_006155	GC	3	6	1099966	1099971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_006155	GC	3	6	1099977	1099982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_006155	GGC	2	6	1099999	1100004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_006155	GC	3	6	1100019	1100024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_006155	A	8	8	1100036	1100043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_006155	A	6	6	1100048	1100053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_006155	TAT	2	6	1100066	1100071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_006155	TTG	2	6	1100072	1100077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_006155	ATA	2	6	1100175	1100180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_006155	TCAC	2	8	1101217	1101224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_006155	TGC	2	6	1101267	1101272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_006155	TCAC	2	8	1101341	1101348	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_006155	AATA	2	8	1101378	1101385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_006155	TGC	2	6	1101408	1101413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_006155	TCAC	2	8	1101482	1101489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_006155	AATA	2	8	1101519	1101526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_006155	TCA	2	6	1101530	1101535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_006155	TGT	2	6	1101584	1101589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_006155	CCGA	2	8	1101602	1101609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_006155	TGC	2	6	1101623	1101628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_006155	GAT	2	6	1106611	1106616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_006155	AAAT	2	8	1106683	1106690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_006155	A	8	8	1106729	1106736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_006155	CAAC	2	8	1110020	1110027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_006155	AAT	2	6	1110031	1110036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_006155	TGC	2	6	1110075	1110080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_006155	ATA	2	6	1110138	1110143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_006155	CAT	2	6	1110177	1110182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_006155	GAT	2	6	1110210	1110215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_006155	GTT	2	6	1110272	1110277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_006155	T	6	6	1110410	1110415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_006155	A	6	6	1111824	1111829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_006155	T	6	6	1113305	1113310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_006155	AAT	2	6	1113333	1113338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_006155	TCT	2	6	1113357	1113362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_006155	CT	3	6	1113370	1113375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_006155	GTGA	2	8	1113430	1113437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_006155	TTC	2	6	1113463	1113468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_006155	TG	3	6	1113477	1113482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_006155	CGA	2	6	1113524	1113529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_006155	CGG	2	6	1113542	1113547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_006155	ATT	2	6	1113583	1113588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_006155	TATC	2	8	1113596	1113603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_006155	AATA	2	8	1113618	1113625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_006155	TAA	2	6	1113634	1113639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_006155	AGC	2	6	1115695	1115700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_006155	T	7	7	1115733	1115739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_006155	ATA	2	6	1115751	1115756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_006155	ATA	2	6	1116562	1116567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_006155	CGC	2	6	1116581	1116586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_006155	TTAA	2	8	1116636	1116643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_006155	CTTAAT	2	12	1116654	1116665	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4102	NC_006155	TAA	2	6	1116666	1116671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_006155	GATT	2	8	1116678	1116685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_006155	AGT	2	6	1116686	1116691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_006155	CCTG	2	8	1118485	1118492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_006155	GCA	2	6	1118521	1118526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_006155	GCT	2	6	1118535	1118540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_006155	A	6	6	1118556	1118561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_006155	AC	3	6	1118598	1118603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_006155	TAAT	2	8	1118610	1118617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_006155	ATT	3	9	1118624	1118632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_006155	T	6	6	1118649	1118654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_006155	ATG	2	6	1118750	1118755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_006155	A	8	8	1118784	1118791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_006155	ACTG	2	8	1118806	1118813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_006155	TGA	2	6	1119533	1119538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_006155	AATA	2	8	1119546	1119553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_006155	CAC	2	6	1120400	1120405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_006155	CAGC	2	8	1120425	1120432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_006155	GCC	2	6	1120452	1120457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_006155	GCA	2	6	1120528	1120533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_006155	T	6	6	1121673	1121678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_006155	ACA	2	6	1121708	1121713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_006155	ATT	2	6	1122876	1122881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_006155	AG	4	8	1122896	1122903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_006155	ACT	2	6	1122946	1122951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_006155	ATC	2	6	1126180	1126185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_006155	T	7	7	1126227	1126233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_006155	AATT	2	8	1126285	1126292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_006155	CCA	2	6	1126307	1126312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_006155	TTC	2	6	1126315	1126320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_006155	TAT	2	6	1126335	1126340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_006155	TAA	2	6	1126353	1126358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_006155	TAAA	2	8	1126385	1126392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_006155	TGT	2	6	1127752	1127757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_006155	T	6	6	1128278	1128283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_006155	TCTA	2	8	1128318	1128325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4138	NC_006155	ATT	2	6	1129527	1129532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_006155	GCGG	2	8	1129591	1129598	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4142	NC_006155	TGC	2	6	1130706	1130711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_006155	TA	3	6	1130774	1130779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_006155	AATT	2	8	1132280	1132287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4147	NC_006155	A	6	6	1132375	1132380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_006155	CAT	2	6	1134322	1134327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4156	NC_006155	AAACG	2	10	1139039	1139048	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4165	NC_006155	TAG	2	6	1141380	1141385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4169	NC_006155	AGGGT	2	10	1141514	1141523	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4173	NC_006155	ATTT	2	8	1141605	1141612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4244	NC_006155	TA	3	6	1161632	1161637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_006155	T	7	7	1165314	1165320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_006155	ACTGAA	2	12	1165392	1165403	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4252	NC_006155	TCAT	2	8	1165459	1165466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4253	NC_006155	AT	4	8	1165478	1165485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_006155	A	6	6	1166589	1166594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_006155	CTT	2	6	1166610	1166615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_006155	AATT	2	8	1166633	1166640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_006155	A	6	6	1167128	1167133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_006155	AC	3	6	1167177	1167182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4259	NC_006155	TTAT	2	8	1170832	1170839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_006155	ACTC	5	20	1170842	1170861	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4261	NC_006155	ACTT	2	8	1170862	1170869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4262	NC_006155	TCC	2	6	1170877	1170882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4263	NC_006155	ATC	2	6	1170938	1170943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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