MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYptb32953

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006154	TA	5	10	30	39	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006154	TGT	2	6	52	57	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006154	TTTG	2	8	62	69	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006154	TTGAT	2	10	140	149	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006154	A	6	6	170	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006154	AGG	2	6	188	193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006154	TGGAA	2	10	1194	1203	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006154	ATTGA	2	10	1215	1224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006154	CAA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006154	AGG	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006154	T	7	7	1663	1669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006154	TG	3	6	1690	1695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006154	CAAT	2	8	1724	1731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006154	A	7	7	1741	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006154	TAA	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006154	ATGTAT	2	12	1773	1784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006154	AT	3	6	1803	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006154	TG	3	6	2149	2154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006154	ACTA	2	8	2166	2173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006154	T	8	8	2226	2233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006154	ATT	2	6	2236	2241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006154	TAAT	2	8	2331	2338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006154	AT	3	6	2500	2505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006154	GCC	2	6	2522	2527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_006154	GAG	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006154	G	6	6	3493	3498	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006154	TCC	2	6	7610	7615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_006154	TAAA	2	8	7623	7630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006154	ACGT	2	8	7661	7668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006154	ATA	2	6	7699	7704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006154	AT	3	6	7708	7713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006154	TCT	2	6	9038	9043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006154	TGT	2	6	9090	9095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006154	CCG	2	6	9131	9136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_006154	TTG	2	6	12072	12077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006154	TTG	2	6	12081	12086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006154	TTG	2	6	12090	12095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006154	TGT	2	6	12103	12108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006154	ATT	2	6	12151	12156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006154	T	7	7	12192	12198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006154	ATT	2	6	12218	12223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006154	TTA	2	6	12237	12242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006154	GCG	2	6	13696	13701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006154	T	6	6	13943	13948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006154	GCCTT	2	10	13976	13985	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_006154	T	8	8	14490	14497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006154	GGC	2	6	15785	15790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006154	TTA	2	6	15806	15811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006154	A	6	6	17692	17697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006154	CT	3	6	17740	17745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006154	TAA	2	6	17747	17752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006154	TTC	2	6	17770	17775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006154	TTA	2	6	17800	17805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006154	T	8	8	17837	17844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006154	TTA	2	6	17914	17919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006154	TA	3	6	17952	17957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006154	GA	3	6	17968	17973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006154	TAC	2	6	18021	18026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006154	GCG	2	6	18054	18059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006154	CGG	2	6	18185	18190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006154	A	10	10	18205	18214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006154	C	6	6	18235	18240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_006154	AGA	2	6	18266	18271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006154	CCCA	2	8	18276	18283	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_006154	A	6	6	18461	18466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006154	AATA	2	8	21052	21059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006154	A	6	6	23445	23450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006154	A	6	6	23672	23677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006154	ACCC	2	8	23691	23698	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_006154	TTGAG	2	10	23735	23744	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006154	ACC	2	6	24008	24013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_006154	GGT	2	6	24020	24025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006154	TC	3	6	25021	25026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006154	TG	3	6	25032	25037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006154	GGGA	2	8	25181	25188	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006154	GTG	2	6	25234	25239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006154	ATT	2	6	25280	25285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006154	AAT	2	6	25308	25313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006154	TTTA	2	8	26265	26272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006154	GGC	2	6	26817	26822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006154	ATCAAA	2	12	26826	26837	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_006154	ATTTAA	2	12	26847	26858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006154	CGC	2	6	26935	26940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_006154	T	6	6	27103	27108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006154	TAT	2	6	27225	27230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006154	GTGA	2	8	27401	27408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006154	TGA	2	6	27446	27451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006154	T	9	9	27594	27602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.