MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pMT1

Total Repeats: 355

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005815	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005815	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005815	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005815	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005815	CTAC	2	8	2009	2016	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005815	CCAA	2	8	2706	2713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005815	AAAG	2	8	5885	5892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005815	CTT	2	6	11178	11183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005815	ATA	2	6	13299	13304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005815	AG	3	6	18651	18656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005815	TA	3	6	19493	19498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005815	GGC	2	6	22089	22094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005815	GCC	2	6	22098	22103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_005815	TTAC	2	8	22831	22838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_005815	AAC	2	6	28222	28227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_005815	TA	3	6	28306	28311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005815	TAA	2	6	28314	28319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005815	TA	4	8	28333	28340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005815	TA	3	6	31797	31802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005815	TACT	3	12	31805	31816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_005815	ATA	2	6	31817	31822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005815	TAA	2	6	34727	34732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005815	TTA	2	6	34747	34752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005815	AT	3	6	34808	34813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005815	ATTT	2	8	34837	34844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005815	GAA	2	6	34897	34902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005815	T	8	8	34905	34912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005815	A	6	6	34924	34929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005815	ATAA	3	12	34990	35001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005815	ATTTT	2	10	35749	35758	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005815	T	6	6	35755	35760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005815	T	6	6	36027	36032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005815	TTG	2	6	36064	36069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005815	T	6	6	36075	36080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005815	TG	3	6	36149	36154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005815	A	6	6	36180	36185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005815	TGTCG	2	10	36220	36229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_005815	CCG	2	6	36513	36518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_005815	CT	3	6	36563	36568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005815	TGG	2	6	36598	36603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005815	AAAG	2	8	36608	36615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005815	CCCCT	2	10	36628	36637	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_005815	TAA	2	6	37699	37704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005815	TCC	2	6	37708	37713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_005815	TTG	2	6	38287	38292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005815	A	7	7	38410	38416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005815	TGG	2	6	38417	38422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005815	CCA	2	6	38431	38436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_005815	AT	3	6	38483	38488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005815	GAT	2	6	39352	39357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005815	TCT	2	6	39381	39386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_005815	CAG	2	6	39423	39428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_005815	CTCAA	2	10	40668	40677	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_005815	A	6	6	43036	43041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005815	ACCT	2	8	43080	43087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_005815	AAC	2	6	47706	47711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_005815	ACA	2	6	47716	47721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_005815	AGA	2	6	47728	47733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005815	TAAG	2	8	47767	47774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005815	CGTCA	2	10	47828	47837	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_005815	CAG	2	6	47870	47875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_005815	TAT	2	6	49145	49150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005815	TCT	2	6	49204	49209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005815	ACT	2	6	49214	49219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_005815	GTC	2	6	49601	49606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005815	TCT	2	6	49657	49662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_005815	GCA	2	6	49702	49707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_005815	GAT	2	6	49754	49759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005815	GAT	2	6	49865	49870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005815	CAG	2	6	49886	49891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_005815	ACGTA	2	10	49896	49905	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_005815	CGT	2	6	49956	49961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_005815	TGTT	2	8	50030	50037	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005815	GCGT	2	8	50094	50101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_005815	ATT	2	6	50198	50203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005815	AAT	2	6	50218	50223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005815	AG	3	6	50233	50238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005815	AGA	2	6	50246	50251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005815	AG	3	6	50342	50347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005815	ATA	2	6	50349	50354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005815	CT	3	6	50378	50383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_005815	AGG	2	6	50414	50419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005815	AT	3	6	50481	50486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005815	GTTT	2	8	50509	50516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005815	CCA	2	6	50517	50522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_005815	CA	3	6	50521	50526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_005815	AG	3	6	50704	50709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005815	ACCA	2	8	50734	50741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_005815	AG	3	6	50746	50751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005815	TGA	2	6	50787	50792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005815	CCA	2	6	50822	50827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_005815	AG	3	6	51934	51939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005815	AAC	3	9	52009	52017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_005815	AATG	2	8	52058	52065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005815	CT	3	6	52136	52141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_005815	GTT	2	6	52312	52317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005815	TGAA	2	8	52323	52330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005815	CT	3	6	52341	52346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_005815	CAC	2	6	52371	52376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_005815	CG	4	8	52448	52455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_005815	TGGT	2	8	52478	52485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005815	TA	3	6	53232	53237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005815	TTG	2	6	53540	53545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005815	TTAT	2	8	53554	53561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005815	CTT	2	6	54373	54378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_005815	TTG	2	6	54452	54457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005815	ATA	2	6	54461	54466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005815	A	6	6	54474	54479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005815	ATA	2	6	55580	55585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005815	AGTA	2	8	55586	55593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005815	TA	3	6	55596	55601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005815	CGAG	2	8	59091	59098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_005815	ATA	2	6	59103	59108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005815	TACT	2	8	59115	59122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_005815	ATC	2	6	59124	59129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_005815	GAAA	2	8	59613	59620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005815	GAAG	2	8	59639	59646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005815	GGGGT	2	10	59654	59663	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005815	TGA	2	6	59672	59677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005815	GGA	2	6	59783	59788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005815	TGGGTT	2	12	59851	59862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005815	CAG	2	6	59864	59869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_005815	GCTGC	2	10	59895	59904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_005815	CAC	2	6	59932	59937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_005815	A	6	6	60034	60039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005815	TAG	2	6	60040	60045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005815	GCC	2	6	60061	60066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_005815	CCG	2	6	60685	60690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_005815	TTG	3	9	61308	61316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005815	GTC	2	6	61517	61522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_005815	CAT	2	6	61555	61560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_005815	GTC	2	6	61625	61630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_005815	GCC	2	6	61647	61652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_005815	TCA	2	6	61660	61665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_005815	ACACGC	2	12	61856	61867	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_005815	GCC	2	6	61913	61918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_005815	ATG	2	6	61938	61943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005815	AGC	2	6	61963	61968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_005815	AACG	2	8	61979	61986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_005815	TGG	2	6	63888	63893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005815	CGT	2	6	63919	63924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_005815	CAG	2	6	63934	63939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_005815	TGG	2	6	64016	64021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005815	GCA	2	6	64095	64100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_005815	CAG	2	6	64111	64116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_005815	TTG	2	6	64179	64184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005815	TTC	2	6	64200	64205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_005815	CAG	2	6	64273	64278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_005815	CTT	2	6	64309	64314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_005815	CG	3	6	64355	64360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_005815	GTG	2	6	64374	64379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005815	ACG	2	6	64422	64427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_005815	GTC	2	6	64643	64648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_005815	AGC	2	6	64746	64751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_005815	CT	3	6	64869	64874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_005815	CGA	2	6	65035	65040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_005815	CGC	2	6	65093	65098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_005815	TCC	2	6	65181	65186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_005815	GCA	2	6	65220	65225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_005815	CGCAG	2	10	65253	65262	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_005815	TTCA	2	8	65321	65328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_005815	TGA	2	6	65404	65409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_005815	AGA	2	6	65421	65426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_005815	CCA	2	6	65470	65475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_005815	TCA	2	6	65536	65541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_005815	GTA	2	6	65664	65669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_005815	TCA	2	6	65701	65706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_005815	TCG	2	6	65718	65723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_005815	TGG	2	6	65744	65749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_005815	GTT	2	6	65796	65801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_005815	TGG	2	6	65898	65903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_005815	TCG	2	6	66426	66431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_005815	TGG	2	6	66721	66726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_005815	TA	3	6	68087	68092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_005815	AT	3	6	68094	68099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_005815	ATT	2	6	94990	94995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_005815	CAT	2	6	95009	95014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_005815	TGG	2	6	95072	95077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_005815	TTG	2	6	95129	95134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_005815	CAA	2	6	95135	95140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_005815	ACT	2	6	95911	95916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_005815	AACGG	2	10	97903	97912	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
297	NC_005815	GAC	2	6	98044	98049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_005815	A	7	7	98097	98103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_005815	T	6	6	98120	98125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_005815	TA	3	6	98200	98205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_005815	TATG	2	8	98262	98269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
302	NC_005815	A	6	6	98312	98317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_005815	AAG	2	6	98381	98386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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308	NC_005815	CAT	2	6	100300	100305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
309	NC_005815	TAA	2	6	100308	100313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_005815	ATG	2	6	100316	100321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_005815	TCT	2	6	100418	100423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
315	NC_005815	TAA	2	6	100441	100446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.