MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis KIM 10 chromosome

Total Repeats: 17447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004088	CTT	2	6	290470	290475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_004088	GC	3	6	290501	290506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_004088	TTG	2	6	290600	290605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_004088	GTC	2	6	290627	290632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_004088	CAA	2	6	290703	290708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_004088	CCA	2	6	290713	290718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_004088	CCG	2	6	290728	290733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_004088	ACCA	2	8	290736	290743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_004088	AAT	2	6	290751	290756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_004088	ACC	2	6	290844	290849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_004088	TCA	2	6	300479	300484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_004088	CAG	2	6	302908	302913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_004088	TG	3	6	302935	302940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_004088	TGG	2	6	305422	305427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_004088	CGT	2	6	305453	305458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_004088	TTG	2	6	305539	305544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_004088	G	6	6	305720	305725	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_004088	GCCAAT	2	12	305771	305782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_004088	ATC	2	6	305840	305845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_004088	TAAA	2	8	305899	305906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_004088	A	6	6	309352	309357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_004088	ATT	2	6	309408	309413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_004088	T	6	6	309431	309436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_004088	ATT	2	6	309437	309442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_004088	TTG	2	6	309457	309462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004088	GAA	2	6	309483	309488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_004088	TA	3	6	309505	309510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004088	ATT	2	6	309824	309829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_004088	AGT	2	6	309831	309836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_004088	ATT	2	6	309863	309868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004088	A	6	6	310098	310103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_004088	CTT	2	6	310137	310142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_004088	T	6	6	310225	310230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_004088	AAC	2	6	310242	310247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_004088	GC	3	6	310255	310260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_004088	GGT	2	6	310278	310283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_004088	TAT	2	6	310298	310303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_004088	TAT	2	6	310312	310317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_004088	ATTC	2	8	310362	310369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_004088	TGA	2	6	310376	310381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_004088	T	6	6	310384	310389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_004088	GCT	2	6	310401	310406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_004088	GTA	2	6	310416	310421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_004088	GAA	2	6	311027	311032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_004088	CAGA	2	8	311068	311075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_004088	TAT	2	6	311076	311081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_004088	ATC	2	6	311641	311646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_004088	TAA	2	6	312719	312724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_004088	A	6	6	312737	312742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004088	ATA	2	6	312779	312784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_004088	GAT	2	6	312838	312843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_004088	ATT	2	6	314204	314209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_004088	TGTAC	2	10	314237	314246	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_004088	ATTA	2	8	314247	314254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_004088	A	6	6	314845	314850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_004088	GGA	2	6	314882	314887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004088	CGT	2	6	315757	315762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_004088	ATG	2	6	315764	315769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_004088	GC	3	6	316872	316877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_004088	GTT	2	6	316898	316903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_004088	A	6	6	316971	316976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_004088	T	6	6	316992	316997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_004088	AGG	2	6	317015	317020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_004088	GTG	2	6	317036	317041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_004088	ATG	2	6	319389	319394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004088	A	7	7	319424	319430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_004088	CGC	2	6	319505	319510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_004088	TTAT	2	8	319561	319568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_004088	GTG	2	6	319576	319581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_004088	T	6	6	319883	319888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_004088	ACC	2	6	319901	319906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_004088	GAT	3	9	319936	319944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_004088	GAT	2	6	319956	319961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_004088	GAT	2	6	319973	319978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004088	TCG	2	6	319982	319987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_004088	GTC	2	6	319994	319999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_004088	GAT	2	6	320075	320080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_004088	ATAA	2	8	320086	320093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_004088	TAAA	2	8	320094	320101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_004088	TAA	2	6	320104	320109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_004088	TAA	2	6	320112	320117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_004088	GA	3	6	320147	320152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_004088	TTA	3	9	320177	320185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_004088	GAT	2	6	320206	320211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_004088	A	6	6	320228	320233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_004088	T	6	6	320263	320268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_004088	T	6	6	320859	320864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_004088	AGTG	2	8	320872	320879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_004088	AAT	2	6	320912	320917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_004088	ATA	2	6	320931	320936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_004088	ATA	2	6	320941	320946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_004088	T	6	6	320950	320955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_004088	AAG	2	6	321048	321053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_004088	ATA	2	6	321077	321082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_004088	GGT	2	6	321160	321165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_004088	TAAA	2	8	321569	321576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_004088	GTT	2	6	321624	321629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_004088	GCT	2	6	321630	321635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_004088	CTCG	2	8	321640	321647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_004088	TGCTA	2	10	321676	321685	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1101	NC_004088	TTA	2	6	321749	321754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_004088	AAG	2	6	321778	321783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_004088	TGG	2	6	321856	321861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_004088	CAA	2	6	321886	321891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_004088	ATG	2	6	321913	321918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_004088	C	6	6	321941	321946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1107	NC_004088	CGCA	2	8	321993	322000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_004088	CGT	2	6	322011	322016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_004088	TGT	2	6	322034	322039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_004088	G	7	7	322065	322071	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_004088	CAG	2	6	322088	322093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_004088	GTG	2	6	322210	322215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_004088	TTG	2	6	322231	322236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_004088	TTGA	2	8	322293	322300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_004088	GTT	2	6	322326	322331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_004088	GCC	2	6	322338	322343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_004088	GCC	2	6	322353	322358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_004088	TGC	2	6	322361	322366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_004088	CAG	2	6	322413	322418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_004088	CT	5	10	322420	322429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_004088	GTG	2	6	322443	322448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_004088	TGG	2	6	322486	322491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004088	TGG	2	6	322539	322544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004088	ATA	2	6	322549	322554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_004088	TGC	2	6	322568	322573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_004088	CAC	2	6	322615	322620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_004088	CAG	2	6	322632	322637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_004088	ATC	2	6	322696	322701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_004088	TGA	2	6	322787	322792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_004088	G	7	7	322850	322856	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_004088	GGC	2	6	322903	322908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_004088	TTG	2	6	322943	322948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004088	TTCTG	2	10	325486	325495	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1134	NC_004088	ATC	2	6	325562	325567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_004088	ATAA	2	8	325647	325654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_004088	T	6	6	326585	326590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_004088	G	6	6	326594	326599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_004088	TGG	2	6	326617	326622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_004088	TGG	2	6	326625	326630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_004088	TGG	2	6	326633	326638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_004088	TGG	2	6	326641	326646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_004088	GTT	2	6	326670	326675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1152	NC_004088	GCT	2	6	328336	328341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1162	NC_004088	CTTA	2	8	331584	331591	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1163	NC_004088	CTTA	2	8	331603	331610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1171	NC_004088	TAAT	2	8	334326	334333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_004088	ATT	2	6	335231	335236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1175	NC_004088	GTAA	2	8	335303	335310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1198	NC_004088	AT	3	6	340002	340007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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