MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003143	AATA	2	8	1013497	1013504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_003143	TCC	2	6	1013505	1013510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_003143	ACG	2	6	1013518	1013523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_003143	CCA	2	6	1013549	1013554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_003143	CGTT	2	8	1015456	1015463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_003143	TTG	2	6	1016043	1016048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_003143	A	8	8	1016166	1016173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_003143	TCA	2	6	1016216	1016221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_003143	CGT	2	6	1016251	1016256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_003143	CTT	2	6	1016315	1016320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_003143	AAT	2	6	1018409	1018414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_003143	GGC	2	6	1018429	1018434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_003143	AGC	2	6	1018487	1018492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_003143	ACA	2	6	1018519	1018524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_003143	CAA	2	6	1018577	1018582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_003143	ATAG	2	8	1018615	1018622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_003143	ATG	2	6	1018625	1018630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_003143	ATG	2	6	1018636	1018641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_003143	GGT	2	6	1018652	1018657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_003143	TGA	2	6	1018688	1018693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_003143	TGA	2	6	1018705	1018710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_003143	TAA	2	6	1018722	1018727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_003143	CTG	2	6	1018736	1018741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_003143	A	6	6	1018783	1018788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_003143	GAA	2	6	1018803	1018808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_003143	CTG	2	6	1019621	1019626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_003143	TC	3	6	1019749	1019754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_003143	ATT	3	9	1020192	1020200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_003143	ACG	2	6	1020201	1020206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_003143	CAC	2	6	1020251	1020256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_003143	A	7	7	1020280	1020286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_003143	CGC	2	6	1022514	1022519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_003143	AGG	2	6	1022629	1022634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_003143	G	6	6	1022642	1022647	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_003143	ACG	2	6	1022661	1022666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_003143	TTG	2	6	1022670	1022675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_003143	GCA	2	6	1022680	1022685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_003143	ACC	2	6	1022713	1022718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_003143	CATG	2	8	1022721	1022728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_003143	TTA	2	6	1022755	1022760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_003143	CTT	2	6	1022768	1022773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_003143	T	6	6	1022800	1022805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_003143	CTCA	2	8	1022806	1022813	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_003143	TCA	2	6	1022835	1022840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_003143	TCT	2	6	1023045	1023050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_003143	TCA	2	6	1023058	1023063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_003143	CG	4	8	1023081	1023088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_003143	A	7	7	1023154	1023160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_003143	GGCT	2	8	1023202	1023209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_003143	AAC	2	6	1023283	1023288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_003143	CAACA	2	10	1023426	1023435	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4052	NC_003143	GCTCT	2	10	1023445	1023454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4053	NC_003143	CTG	2	6	1023457	1023462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_003143	GAA	2	6	1024717	1024722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_003143	GGT	2	6	1024749	1024754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_003143	AACCC	2	10	1024809	1024818	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4057	NC_003143	GTG	2	6	1024819	1024824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_003143	TTC	2	6	1024858	1024863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_003143	CCAT	2	8	1025422	1025429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_003143	TGA	2	6	1026261	1026266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_003143	TGA	2	6	1026282	1026287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_003143	GGT	2	6	1026288	1026293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_003143	GCT	2	6	1026356	1026361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_003143	TATT	2	8	1026362	1026369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_003143	CG	3	6	1026382	1026387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_003143	TCA	2	6	1026392	1026397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_003143	GTG	2	6	1028171	1028176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_003143	TA	3	6	1028260	1028265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_003143	GCG	2	6	1029360	1029365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_003143	CAG	2	6	1029374	1029379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_003143	T	7	7	1029409	1029415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_003143	GCC	2	6	1031455	1031460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_003143	ATC	2	6	1031473	1031478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_003143	ATT	2	6	1032649	1032654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_003143	CT	3	6	1033429	1033434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_003143	ATT	2	6	1033445	1033450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_003143	GCG	2	6	1034348	1034353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_003143	T	6	6	1034426	1034431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_003143	GCT	2	6	1034514	1034519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_003143	AAC	2	6	1034568	1034573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_003143	AC	3	6	1034576	1034581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_003143	TCC	2	6	1035482	1035487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_003143	TAA	2	6	1037305	1037310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_003143	CAAC	2	8	1037388	1037395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_003143	AC	3	6	1037394	1037399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_003143	CT	3	6	1037452	1037457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_003143	TAT	2	6	1046836	1046841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_003143	ATTA	2	8	1046860	1046867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_003143	AAAAAT	2	12	1046886	1046897	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_003143	TAA	2	6	1046929	1046934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_003143	A	7	7	1046949	1046955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_003143	ATTT	2	8	1046982	1046989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_003143	AAT	2	6	1047006	1047011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_003143	AAT	2	6	1047031	1047036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_003143	AT	3	6	1047040	1047045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_003143	ATAATT	2	12	1047053	1047064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_003143	AGG	2	6	1047067	1047072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_003143	TCG	2	6	1047092	1047097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_003143	GGC	2	6	1047148	1047153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_003143	AT	3	6	1047259	1047264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_003143	C	12	12	1047293	1047304	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4102	NC_003143	TTA	2	6	1047307	1047312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_003143	GCT	2	6	1047339	1047344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_003143	TCCTGC	2	12	1047395	1047406	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_003143	CATT	2	8	1047413	1047420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_003143	CTG	2	6	1047430	1047435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_003143	ATT	2	6	1047472	1047477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_003143	ACT	2	6	1047481	1047486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_003143	CTG	2	6	1047544	1047549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_003143	TGG	2	6	1047592	1047597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_003143	CTG	2	6	1047639	1047644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_003143	CGT	2	6	1047663	1047668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_003143	CTG	2	6	1047688	1047693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_003143	TGC	2	6	1047751	1047756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_003143	GC	3	6	1047755	1047760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_003143	CTG	2	6	1047813	1047818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_003143	TGA	2	6	1047926	1047931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_003143	CAT	2	6	1047935	1047940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_003143	GCCTGC	2	12	1047970	1047981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_003143	CAG	2	6	1047983	1047988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_003143	CAA	2	6	1047996	1048001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_003143	TTTTA	2	10	1048026	1048035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_003143	TGC	2	6	1048073	1048078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_003143	AGA	3	9	1048140	1048148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_003143	GTTG	2	8	1050253	1050260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_003143	TA	3	6	1050344	1050349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_003143	CGC	2	6	1050457	1050462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_003143	GCG	2	6	1050464	1050469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_003143	TGC	2	6	1050521	1050526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_003143	ATTT	2	8	1050539	1050546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4361	NC_003143	TAT	2	6	1095997	1096002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4387	NC_003143	G	7	7	1098683	1098689	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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