MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_003143	TGG	2	6	3652454	3652459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_003143	ACC	2	6	3652476	3652481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15503	NC_003143	ACC	2	6	3652511	3652516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15504	NC_003143	CAA	2	6	3652530	3652535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_003143	TG	3	6	3652601	3652606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_003143	AGG	2	6	3652635	3652640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_003143	CTAC	2	8	3652733	3652740	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15508	NC_003143	GT	3	6	3652776	3652781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_003143	GT	3	6	3652945	3652950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_003143	ATG	2	6	3652970	3652975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_003143	TCC	2	6	3652996	3653001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15512	NC_003143	CCA	2	6	3653032	3653037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15513	NC_003143	CAA	2	6	3653049	3653054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_003143	GAC	2	6	3653110	3653115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_003143	GCA	2	6	3653122	3653127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_003143	TTC	2	6	3653198	3653203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15517	NC_003143	GCC	2	6	3653441	3653446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15518	NC_003143	TCC	2	6	3653461	3653466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15519	NC_003143	C	6	6	3653505	3653510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15520	NC_003143	TGCG	2	8	3653593	3653600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15521	NC_003143	GCT	2	6	3653651	3653656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_003143	CTT	2	6	3653676	3653681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15523	NC_003143	TCC	2	6	3653725	3653730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15524	NC_003143	CTT	2	6	3653760	3653765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15525	NC_003143	CA	3	6	3653766	3653771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15526	NC_003143	CTG	2	6	3653819	3653824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_003143	TCG	2	6	3653894	3653899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15528	NC_003143	CTA	2	6	3653922	3653927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_003143	AGT	2	6	3654019	3654024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_003143	CCG	2	6	3654068	3654073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15531	NC_003143	AGT	2	6	3654085	3654090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_003143	ACT	2	6	3654093	3654098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_003143	GCC	2	6	3654133	3654138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15534	NC_003143	CGTT	2	8	3654382	3654389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15535	NC_003143	GCG	2	6	3654403	3654408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15536	NC_003143	ATA	2	6	3654434	3654439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_003143	TTTC	2	8	3654474	3654481	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15538	NC_003143	GT	3	6	3654520	3654525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_003143	GTT	2	6	3654529	3654534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_003143	A	6	6	3654592	3654597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_003143	CAT	2	6	3654619	3654624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_003143	AT	3	6	3654632	3654637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_003143	GAA	2	6	3654638	3654643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_003143	A	7	7	3654642	3654648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_003143	CAA	2	6	3654649	3654654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_003143	A	6	6	3654653	3654658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_003143	AAT	2	6	3657353	3657358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_003143	CTT	2	6	3659112	3659117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15549	NC_003143	T	6	6	3660044	3660049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_003143	A	8	8	3660239	3660246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_003143	AG	3	6	3660312	3660317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_003143	T	6	6	3660782	3660787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_003143	TTC	2	6	3660842	3660847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_003143	T	6	6	3660854	3660859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_003143	TCG	2	6	3660884	3660889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_003143	AATA	2	8	3660912	3660919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_003143	TCC	2	6	3660920	3660925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15558	NC_003143	TTG	2	6	3661499	3661504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_003143	CAA	2	6	3661621	3661626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_003143	T	7	7	3661649	3661655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_003143	ATT	2	6	3661715	3661720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_003143	TCAT	2	8	3661731	3661738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15563	NC_003143	TGC	2	6	3661783	3661788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_003143	CTG	2	6	3661818	3661823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15565	NC_003143	AGC	2	6	3661873	3661878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_003143	CAT	2	6	3661881	3661886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15567	NC_003143	TTA	2	6	3661920	3661925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_003143	ATT	2	6	3661995	3662000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_003143	CAG	2	6	3662019	3662024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15570	NC_003143	CT	3	6	3662061	3662066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15571	NC_003143	CCTT	2	8	3662077	3662084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15572	NC_003143	GCA	2	6	3662127	3662132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15574	NC_003143	ATG	2	6	3662257	3662262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15576	NC_003143	AACC	2	8	3662309	3662316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15578	NC_003143	GCGG	2	8	3662523	3662530	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15579	NC_003143	CAA	2	6	3662577	3662582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15580	NC_003143	ACC	2	6	3662649	3662654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15581	NC_003143	GCA	2	6	3662672	3662677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15582	NC_003143	AACG	2	8	3662698	3662705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15583	NC_003143	TGG	2	6	3664607	3664612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15585	NC_003143	AG	3	6	3664671	3664676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_003143	GCT	2	6	3664834	3664839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15589	NC_003143	TGA	2	6	3664973	3664978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15591	NC_003143	T	7	7	3667307	3667313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_003143	A	6	6	3667399	3667404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_003143	GAAT	2	8	3668146	3668153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_003143	CAT	2	6	3668163	3668168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15596	NC_003143	ATT	2	6	3668279	3668284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_003143	A	6	6	3668311	3668316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_003143	ATTTCA	2	12	3668361	3668372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15599	NC_003143	TACT	2	8	3668390	3668397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15600	NC_003143	TTTA	2	8	3668402	3668409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_003143	TAAA	2	8	3668416	3668423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_003143	CAA	2	6	3668516	3668521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_003143	TCAT	2	8	3668537	3668544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15604	NC_003143	CAT	2	6	3668560	3668565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15605	NC_003143	TATAAT	2	12	3668581	3668592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_003143	TAA	2	6	3668640	3668645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_003143	TTAT	2	8	3668657	3668664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_003143	ACC	2	6	3668698	3668703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15609	NC_003143	TAC	2	6	3668751	3668756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15610	NC_003143	ATG	2	6	3668780	3668785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_003143	ATT	2	6	3668800	3668805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_003143	CGC	2	6	3668807	3668812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15613	NC_003143	TTA	2	6	3668831	3668836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_003143	ACG	2	6	3668846	3668851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15615	NC_003143	CTTT	2	8	3668863	3668870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15616	NC_003143	A	6	6	3668927	3668932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_003143	ATT	2	6	3669032	3669037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_003143	TTGG	2	8	3669107	3669114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_003143	CGC	2	6	3669124	3669129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15620	NC_003143	A	7	7	3669182	3669188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_003143	AGC	2	6	3669201	3669206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15622	NC_003143	TA	5	10	3669212	3669221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15623	NC_003143	GTC	2	6	3669307	3669312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15624	NC_003143	TTG	2	6	3669313	3669318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_003143	GAT	3	9	3669396	3669404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15626	NC_003143	TCT	2	6	3669497	3669502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15627	NC_003143	CTT	2	6	3669534	3669539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15629	NC_003143	CAG	2	6	3669724	3669729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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