MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_003143	GCG	2	6	3547294	3547299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_003143	CTT	2	6	3547338	3547343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_003143	TTC	2	6	3547396	3547401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_003143	ACCA	2	8	3547422	3547429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15005	NC_003143	TTTA	2	8	3547431	3547438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_003143	TCA	2	6	3547456	3547461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_003143	ACTCA	2	10	3547482	3547491	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15008	NC_003143	ATTT	2	8	3547517	3547524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_003143	TGA	2	6	3547542	3547547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_003143	CT	3	6	3547579	3547584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15011	NC_003143	TTA	2	6	3547627	3547632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_003143	T	7	7	3547642	3547648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_003143	TGA	2	6	3547704	3547709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_003143	TCT	2	6	3547719	3547724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_003143	AGT	2	6	3547732	3547737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_003143	T	7	7	3547754	3547760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_003143	CAA	2	6	3547864	3547869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15018	NC_003143	T	6	6	3548016	3548021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_003143	T	6	6	3548051	3548056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_003143	ATTT	2	8	3548057	3548064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_003143	CA	3	6	3548068	3548073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15022	NC_003143	TGA	2	6	3548084	3548089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_003143	AT	3	6	3548091	3548096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_003143	ATTT	2	8	3548179	3548186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_003143	TC	3	6	3548187	3548192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15026	NC_003143	CTC	2	6	3548323	3548328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15027	NC_003143	TAAC	2	8	3548337	3548344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15028	NC_003143	TATTT	2	10	3548376	3548385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_003143	TTA	2	6	3548413	3548418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_003143	ATA	2	6	3548431	3548436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_003143	GAA	2	6	3548451	3548456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_003143	TGG	2	6	3548459	3548464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_003143	TAAT	2	8	3548478	3548485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_003143	ATAAA	2	10	3548536	3548545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_003143	TCC	2	6	3548548	3548553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15036	NC_003143	TTG	2	6	3549127	3549132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_003143	A	6	6	3549250	3549255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15039	NC_003143	AGT	2	6	3552531	3552536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_003143	CT	4	8	3552579	3552586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15041	NC_003143	AAT	2	6	3552601	3552606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_003143	TGT	2	6	3553769	3553774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_003143	A	6	6	3553804	3553809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_003143	TGC	2	6	3554949	3554954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15045	NC_003143	GGC	2	6	3555025	3555030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_003143	GCTG	2	8	3555050	3555057	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15047	NC_003143	GTG	2	6	3555077	3555082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_003143	TATT	2	8	3555889	3555896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_003143	TCA	2	6	3555904	3555909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15050	NC_003143	CAGT	2	8	3556629	3556636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15051	NC_003143	T	7	7	3556651	3556657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_003143	CAA	2	6	3556775	3556780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_003143	GGA	2	6	3557354	3557359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_003143	TATT	2	8	3557360	3557367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_003143	ATA	2	6	3557522	3557527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_003143	ATTA	2	8	3557536	3557543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_003143	AGT	2	6	3557893	3557898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_003143	G	10	10	3557924	3557933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_003143	TTA	2	6	3557972	3557977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_003143	A	8	8	3558116	3558123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_003143	CCGATA	2	12	3558200	3558211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_003143	ACC	2	6	3558220	3558225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15063	NC_003143	AGC	2	6	3558399	3558404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15064	NC_003143	ACTG	2	8	3558426	3558433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15065	NC_003143	CCG	2	6	3558434	3558439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15066	NC_003143	CCG	2	6	3558517	3558522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15067	NC_003143	GCC	2	6	3558721	3558726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15068	NC_003143	TCG	2	6	3558743	3558748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15069	NC_003143	CAA	2	6	3558750	3558755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_003143	GAC	2	6	3558810	3558815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15072	NC_003143	TCG	2	6	3558827	3558832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15073	NC_003143	GGT	2	6	3558888	3558893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_003143	CTT	2	6	3558912	3558917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15080	NC_003143	TAT	2	6	3559210	3559215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_003143	CTG	2	6	3559367	3559372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15082	NC_003143	ATG	2	6	3559412	3559417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15085	NC_003143	ACT	2	6	3559464	3559469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15086	NC_003143	AATC	2	8	3559470	3559477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15088	NC_003143	ATTAAG	2	12	3559490	3559501	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_003143	ATTA	2	8	3559511	3559518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_003143	CGG	2	6	3559567	3559572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_003143	A	7	7	3560416	3560422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_003143	GCT	2	6	3560455	3560460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15093	NC_003143	CGC	2	6	3562435	3562440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15094	NC_003143	TTA	2	6	3562482	3562487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_003143	TATT	2	8	3562496	3562503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_003143	GATA	2	8	3562518	3562525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_003143	AAT	2	6	3562533	3562538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_003143	CCG	2	6	3562574	3562579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15099	NC_003143	TCG	2	6	3562592	3562597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15101	NC_003143	GAA	2	6	3562653	3562658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_003143	TCAC	2	8	3562684	3562691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15103	NC_003143	GA	3	6	3562745	3562750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_003143	TAT	2	6	3562782	3562787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15107	NC_003143	A	6	6	3565706	3565711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_003143	CAA	2	6	3565843	3565848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_003143	ATC	2	6	3565906	3565911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15111	NC_003143	TAT	2	6	3565978	3565983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_003143	GCA	2	6	3566041	3566046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_003143	ATT	2	6	3566085	3566090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_003143	GTTG	2	8	3566094	3566101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_003143	T	8	8	3569385	3569392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_003143	ATTT	2	8	3569431	3569438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_003143	TCA	2	6	3569503	3569508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_003143	CGTT	2	8	3576364	3576371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15119	NC_003143	TCAA	2	8	3576405	3576412	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15120	NC_003143	GCA	2	6	3576452	3576457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_003143	TCGG	2	8	3576471	3576478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15122	NC_003143	AAC	2	6	3576490	3576495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_003143	TGA	2	6	3576545	3576550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_003143	TATT	2	8	3576554	3576561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_003143	GTGA	2	8	3576591	3576598	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_003143	TATT	2	8	3576687	3576694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_003143	GTGA	2	8	3576724	3576731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15129	NC_003143	TATT	2	8	3576828	3576835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15258	NC_003143	TGAGT	2	10	3594043	3594052	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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