MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_003143	CTA	2	6	3332987	3332992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_003143	GA	3	6	3333004	3333009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_003143	GTG	2	6	3333013	3333018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_003143	TGA	2	6	3333038	3333043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_003143	ATCT	2	8	3333092	3333099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14006	NC_003143	TGG	2	6	3333126	3333131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_003143	TGA	2	6	3333150	3333155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_003143	CCG	2	6	3333201	3333206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14009	NC_003143	AAC	2	6	3333266	3333271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_003143	CGC	2	6	3333276	3333281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14011	NC_003143	AT	3	6	3333333	3333338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_003143	ATC	2	6	3333346	3333351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_003143	CGT	2	6	3333368	3333373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_003143	CA	3	6	3333385	3333390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14015	NC_003143	AAC	2	6	3333424	3333429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_003143	GCGTA	2	10	3333449	3333458	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14017	NC_003143	GGC	2	6	3334916	3334921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_003143	T	6	6	3334935	3334940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_003143	CAA	2	6	3335058	3335063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_003143	GGA	2	6	3335637	3335642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_003143	TATT	2	8	3335643	3335650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_003143	CAG	2	6	3335662	3335667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_003143	ACA	2	6	3335675	3335680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_003143	CAT	2	6	3335691	3335696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_003143	TTA	2	6	3335702	3335707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_003143	TAT	2	6	3335818	3335823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_003143	GCATG	2	10	3335862	3335871	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14028	NC_003143	CCA	2	6	3335903	3335908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14029	NC_003143	TTGA	2	8	3335920	3335927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_003143	AATT	2	8	3335939	3335946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_003143	AAC	2	6	3335971	3335976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_003143	GCATG	2	10	3336015	3336024	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14033	NC_003143	CCA	2	6	3336056	3336061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14034	NC_003143	T	6	6	3336089	3336094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_003143	CGA	2	6	3336107	3336112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_003143	TGA	2	6	3336226	3336231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_003143	ATT	2	6	3336960	3336965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_003143	TAC	2	6	3337356	3337361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14039	NC_003143	GTG	2	6	3337362	3337367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_003143	TCA	2	6	3339692	3339697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_003143	A	6	6	3339706	3339711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_003143	TTA	2	6	3339745	3339750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_003143	A	6	6	3339768	3339773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_003143	TGT	2	6	3340775	3340780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_003143	GAA	2	6	3340868	3340873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_003143	GAT	2	6	3340875	3340880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_003143	A	6	6	3340996	3341001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_003143	TAA	2	6	3341007	3341012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_003143	TTAC	2	8	3341828	3341835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14050	NC_003143	A	7	7	3342896	3342902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_003143	T	7	7	3342919	3342925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_003143	TAC	2	6	3342946	3342951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_003143	GATT	2	8	3342957	3342964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_003143	ATT	2	6	3342995	3343000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_003143	ACA	2	6	3343067	3343072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_003143	AG	3	6	3343114	3343119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_003143	T	6	6	3343641	3343646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_003143	CAA	2	6	3345971	3345976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_003143	ATA	2	6	3345996	3346001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_003143	TCC	2	6	3346006	3346011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14061	NC_003143	TTG	2	6	3346585	3346590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_003143	A	7	7	3346708	3346714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_003143	TGC	2	6	3346736	3346741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_003143	ATG	2	6	3346747	3346752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_003143	TC	3	6	3346790	3346795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14066	NC_003143	TTA	2	6	3349033	3349038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_003143	TCA	2	6	3352334	3352339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_003143	A	6	6	3352418	3352423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_003143	ATTT	2	8	3352446	3352453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_003143	T	6	6	3352451	3352456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_003143	TCA	2	6	3352460	3352465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_003143	ATT	2	6	3352539	3352544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_003143	TTA	2	6	3356004	3356009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_003143	GCCTC	2	10	3356026	3356035	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14075	NC_003143	TTAA	2	8	3356083	3356090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_003143	TTTA	2	8	3356137	3356144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_003143	GTA	2	6	3356188	3356193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_003143	CT	3	6	3356261	3356266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14079	NC_003143	CAA	3	9	3356463	3356471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_003143	CGC	2	6	3356511	3356516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14081	NC_003143	TTAA	2	8	3356525	3356532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_003143	CTG	2	6	3356640	3356645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_003143	ACC	2	6	3356848	3356853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14084	NC_003143	T	7	7	3356883	3356889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_003143	TACA	2	8	3356931	3356938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14086	NC_003143	AGG	2	6	3356947	3356952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_003143	CT	3	6	3356963	3356968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14088	NC_003143	TTA	3	9	3356969	3356977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_003143	ATC	2	6	3357004	3357009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14091	NC_003143	ATTC	2	8	3357081	3357088	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14092	NC_003143	A	7	7	3357165	3357171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_003143	T	8	8	3357285	3357292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_003143	TGG	2	6	3358598	3358603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_003143	T	7	7	3358604	3358610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_003143	TC	3	6	3358666	3358671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14097	NC_003143	GC	3	6	3358675	3358680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14098	NC_003143	ATT	2	6	3358707	3358712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_003143	AAT	2	6	3358722	3358727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_003143	TAA	2	6	3358741	3358746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_003143	AT	3	6	3358757	3358762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_003143	TAAT	2	8	3358778	3358785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_003143	TATT	2	8	3358787	3358794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_003143	A	6	6	3358841	3358846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_003143	TTA	2	6	3358861	3358866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_003143	TTTA	2	8	3358870	3358877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_003143	TAA	2	6	3358882	3358887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14110	NC_003143	AT	3	6	3358925	3358930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_003143	A	6	6	3358944	3358949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_003143	AAC	2	6	3358976	3358981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_003143	TCCTTT	2	12	3358989	3359000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_003143	T	7	7	3358998	3359004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_003143	ATTT	2	8	3359019	3359026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_003143	C	6	6	3359037	3359042	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14117	NC_003143	ATTC	2	8	3359060	3359067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14118	NC_003143	GA	3	6	3360679	3360684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_003143	CTC	2	6	3360760	3360765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14120	NC_003143	CAG	2	6	3360807	3360812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14121	NC_003143	ATA	2	6	3363176	3363181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_003143	C	7	7	3363191	3363197	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14123	NC_003143	TTA	2	6	3363296	3363301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_003143	CTGCC	2	10	3363318	3363327	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14125	NC_003143	AGA	2	6	3363383	3363388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14128	NC_003143	GAT	2	6	3364763	3364768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_003143	TAT	3	9	3364836	3364844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14131	NC_003143	TTGA	2	8	3364910	3364917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_003143	GGA	2	6	3364958	3364963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14262	NC_003143	GGTT	2	8	3394694	3394701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14263	NC_003143	A	7	7	3394736	3394742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14264	NC_003143	ATC	2	6	3394841	3394846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14266	NC_003143	AAT	2	6	3394924	3394929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14269	NC_003143	TG	3	6	3395094	3395099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14280	NC_003143	AATA	2	8	3400432	3400439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14387	NC_003143	TCA	2	6	3431552	3431557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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