MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_003143	TGC	2	6	3231608	3231613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_003143	AAT	2	6	3231615	3231620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_003143	AAC	2	6	3231651	3231656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_003143	TGAAG	2	10	3231724	3231733	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_003143	A	6	6	3231745	3231750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_003143	T	6	6	3231813	3231818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_003143	GA	3	6	3231894	3231899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_003143	CTC	2	6	3231975	3231980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13509	NC_003143	CAG	2	6	3232022	3232027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_003143	TCT	2	6	3233082	3233087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_003143	ATT	3	9	3234413	3234421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_003143	GCG	2	6	3234463	3234468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_003143	AAT	2	6	3234474	3234479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_003143	A	6	6	3234507	3234512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_003143	CAGT	2	8	3234529	3234536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13516	NC_003143	ATCA	2	8	3237071	3237078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13517	NC_003143	AGG	2	6	3237109	3237114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_003143	GCT	2	6	3237159	3237164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_003143	TGCT	2	8	3237205	3237212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13520	NC_003143	ATA	2	6	3237244	3237249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_003143	T	6	6	3237273	3237278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_003143	GTT	2	6	3237841	3237846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_003143	AG	3	6	3237889	3237894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_003143	CAA	2	6	3237905	3237910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_003143	AGC	2	6	3237929	3237934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_003143	ACA	2	6	3238261	3238266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13527	NC_003143	GTTG	2	8	3238319	3238326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_003143	GCC	2	6	3238381	3238386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13529	NC_003143	ATT	2	6	3238435	3238440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_003143	TA	4	8	3238448	3238455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_003143	GTC	2	6	3238459	3238464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_003143	TAT	2	6	3240814	3240819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_003143	AATT	2	8	3240851	3240858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_003143	T	6	6	3242630	3242635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_003143	CAA	2	6	3242753	3242758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_003143	GGA	2	6	3243332	3243337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_003143	TATT	3	12	3243338	3243349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_003143	A	6	6	3245126	3245131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_003143	GAAT	2	8	3245150	3245157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_003143	ATAA	2	8	3245181	3245188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_003143	GAT	2	6	3245190	3245195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_003143	TCA	2	6	3245196	3245201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13543	NC_003143	TCC	2	6	3247732	3247737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13544	NC_003143	CCT	2	6	3247765	3247770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13545	NC_003143	T	6	6	3247802	3247807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_003143	A	6	6	3247825	3247830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_003143	AGC	2	6	3247847	3247852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_003143	TGT	3	9	3247884	3247892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_003143	T	6	6	3247976	3247981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_003143	ACC	2	6	3248043	3248048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13551	NC_003143	TGG	2	6	3248053	3248058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_003143	AGG	2	6	3248071	3248076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_003143	GCCA	2	8	3248676	3248683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13554	NC_003143	AC	3	6	3248740	3248745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13555	NC_003143	AGA	2	6	3248778	3248783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_003143	GAC	2	6	3248827	3248832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_003143	AAT	2	6	3248921	3248926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_003143	G	6	6	3248948	3248953	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_003143	ATT	2	6	3248984	3248989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_003143	AGG	2	6	3249046	3249051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_003143	GCC	2	6	3249066	3249071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13562	NC_003143	CTAA	2	8	3250344	3250351	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13563	NC_003143	GCA	2	6	3250474	3250479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13564	NC_003143	ATGG	2	8	3250495	3250502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_003143	CA	3	6	3250579	3250584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13566	NC_003143	CCT	2	6	3250601	3250606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13567	NC_003143	TTCA	2	8	3250681	3250688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13568	NC_003143	AGAGA	2	10	3250789	3250798	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_003143	TAT	2	6	3250839	3250844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_003143	TTACAT	2	12	3252148	3252159	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13571	NC_003143	TA	3	6	3252240	3252245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_003143	TAT	3	9	3252279	3252287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_003143	GGC	2	6	3252318	3252323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13574	NC_003143	TGC	2	6	3252367	3252372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13575	NC_003143	GAC	2	6	3252474	3252479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13576	NC_003143	CAT	2	6	3252516	3252521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13577	NC_003143	A	7	7	3252537	3252543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_003143	GC	3	6	3252568	3252573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13579	NC_003143	TGA	2	6	3252615	3252620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_003143	ACA	2	6	3252759	3252764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_003143	GT	3	6	3252784	3252789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13582	NC_003143	CGT	2	6	3252936	3252941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13583	NC_003143	TCA	2	6	3253026	3253031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13584	NC_003143	GTG	2	6	3253046	3253051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_003143	A	10	10	3253055	3253064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_003143	CCG	2	6	3253066	3253071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13587	NC_003143	TTATCC	2	12	3253299	3253310	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_003143	TAA	2	6	3253426	3253431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_003143	TA	3	6	3253468	3253473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_003143	TA	3	6	3253484	3253489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_003143	ATTAT	2	10	3253494	3253503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_003143	A	7	7	3253518	3253524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_003143	AACG	2	8	3253541	3253548	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13594	NC_003143	AAT	2	6	3255598	3255603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_003143	TGGC	2	8	3255635	3255642	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13596	NC_003143	GCC	2	6	3255668	3255673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13597	NC_003143	CA	3	6	3258065	3258070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13598	NC_003143	TGATG	2	10	3259549	3259558	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_003143	TGC	2	6	3259602	3259607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13601	NC_003143	TCC	2	6	3259652	3259657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13602	NC_003143	TTG	2	6	3260231	3260236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_003143	A	7	7	3260354	3260360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_003143	TGC	2	6	3260366	3260371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_003143	T	7	7	3260383	3260389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_003143	GTT	2	6	3260394	3260399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_003143	CAT	3	9	3260416	3260424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_003143	TTA	2	6	3260434	3260439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_003143	CTTG	2	8	3260450	3260457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13610	NC_003143	GT	3	6	3260505	3260510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_003143	TGA	2	6	3260605	3260610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_003143	ATC	2	6	3260621	3260626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_003143	AT	3	6	3260651	3260656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_003143	TGA	2	6	3260666	3260671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_003143	TCA	2	6	3260677	3260682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13617	NC_003143	CTCA	2	8	3260703	3260710	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13618	NC_003143	GTC	2	6	3260715	3260720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_003143	CA	3	6	3260742	3260747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13620	NC_003143	CAT	2	6	3260785	3260790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13621	NC_003143	CAT	2	6	3260809	3260814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13622	NC_003143	TAAA	2	8	3260889	3260896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_003143	TAT	2	6	3260897	3260902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_003143	AT	3	6	3260905	3260910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_003143	TTA	2	6	3260924	3260929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_003143	T	8	8	3260933	3260940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13627	NC_003143	T	6	6	3260947	3260952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_003143	AAT	2	6	3260953	3260958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13630	NC_003143	TAT	2	6	3260972	3260977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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