MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_003143	A	6	6	3119993	3119998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_003143	TGA	2	6	3120049	3120054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_003143	TAG	2	6	3120070	3120075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_003143	CTG	2	6	3120137	3120142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_003143	AT	3	6	3120158	3120163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_003143	A	6	6	3120243	3120248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_003143	GCA	2	6	3120274	3120279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_003143	TAT	2	6	3120292	3120297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_003143	TAT	2	6	3120713	3120718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_003143	GCCA	2	8	3120725	3120732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13011	NC_003143	ATT	2	6	3120743	3120748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_003143	CCA	2	6	3120829	3120834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13013	NC_003143	A	6	6	3120888	3120893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_003143	AAT	2	6	3120958	3120963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_003143	TCT	2	6	3121019	3121024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_003143	TTC	2	6	3121039	3121044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_003143	AAT	2	6	3121050	3121055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_003143	CAA	2	6	3121082	3121087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_003143	CTG	2	6	3121093	3121098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_003143	TTAAC	2	10	3121196	3121205	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13021	NC_003143	TA	3	6	3121212	3121217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_003143	TAA	2	6	3121226	3121231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_003143	TGA	3	9	3121266	3121274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_003143	AGA	2	6	3121284	3121289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_003143	AATGA	2	10	3121351	3121360	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_003143	TGA	2	6	3121362	3121367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_003143	ATGC	2	8	3121372	3121379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13028	NC_003143	ATT	2	6	3121380	3121385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_003143	T	6	6	3121407	3121412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_003143	T	6	6	3121460	3121465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_003143	T	8	8	3121487	3121494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_003143	AT	3	6	3121593	3121598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_003143	CAA	2	6	3121640	3121645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_003143	CTG	2	6	3121745	3121750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_003143	TTG	3	9	3121768	3121776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_003143	T	6	6	3121800	3121805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_003143	TGC	2	6	3121823	3121828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_003143	G	6	6	3121858	3121863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_003143	TTGCTA	2	12	3121909	3121920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13040	NC_003143	AAT	2	6	3121997	3122002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_003143	A	6	6	3122003	3122008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_003143	TA	3	6	3122502	3122507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_003143	A	10	10	3122635	3122644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_003143	ATC	2	6	3122675	3122680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_003143	ATT	2	6	3122688	3122693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_003143	TTA	2	6	3123990	3123995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_003143	A	6	6	3123995	3124000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_003143	CA	3	6	3124332	3124337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13049	NC_003143	ATT	2	6	3124360	3124365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_003143	GTT	2	6	3124374	3124379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_003143	CAA	2	6	3124516	3124521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_003143	AAG	2	6	3124556	3124561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_003143	ACC	2	6	3124583	3124588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13054	NC_003143	ATT	2	6	3124603	3124608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_003143	CAAC	2	8	3124632	3124639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13056	NC_003143	ATTA	2	8	3124753	3124760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_003143	GTC	2	6	3124798	3124803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_003143	A	6	6	3124810	3124815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_003143	TAT	2	6	3124828	3124833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_003143	ATA	2	6	3124899	3124904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_003143	TA	3	6	3124934	3124939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_003143	CCT	2	6	3124945	3124950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_003143	GT	3	6	3124999	3125004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_003143	CAT	2	6	3125029	3125034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_003143	CTG	2	6	3127012	3127017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_003143	ACTC	2	8	3127031	3127038	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13067	NC_003143	TC	3	6	3127140	3127145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13068	NC_003143	CGT	2	6	3127146	3127151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_003143	T	6	6	3127194	3127199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_003143	ATTAA	2	10	3127217	3127226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_003143	A	9	9	3127225	3127233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_003143	TCAG	2	8	3127237	3127244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13073	NC_003143	AAT	2	6	3127260	3127265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_003143	ATTT	2	8	3127341	3127348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_003143	TAT	2	6	3127400	3127405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_003143	TA	3	6	3127421	3127426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13079	NC_003143	TA	3	6	3128099	3128104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_003143	TAT	2	6	3128109	3128114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_003143	GAA	2	6	3128120	3128125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_003143	T	6	6	3128198	3128203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_003143	AAT	2	6	3128207	3128212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_003143	CAA	2	6	3128350	3128355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13091	NC_003143	GCC	2	6	3130084	3130089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13092	NC_003143	CAA	2	6	3130105	3130110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_003143	A	6	6	3132901	3132906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_003143	ACC	2	6	3132983	3132988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13095	NC_003143	AAC	2	6	3133012	3133017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13098	NC_003143	TGCC	2	8	3137216	3137223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_003143	TG	3	6	3137244	3137249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_003143	TGC	2	6	3137262	3137267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_003143	TTG	2	6	3137281	3137286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13103	NC_003143	T	7	7	3137295	3137301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_003143	CCA	2	6	3137344	3137349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13107	NC_003143	AAAT	2	8	3137554	3137561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_003143	AGA	2	6	3138468	3138473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_003143	ATT	2	6	3138478	3138483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_003143	AACG	2	8	3140433	3140440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13111	NC_003143	TGG	2	6	3142342	3142347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_003143	CGT	2	6	3142373	3142378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_003143	A	6	6	3142451	3142456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_003143	C	6	6	3142462	3142467	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13115	NC_003143	CA	3	6	3142518	3142523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13116	NC_003143	AT	3	6	3142549	3142554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_003143	AT	3	6	3142562	3142567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_003143	CA	3	6	3142569	3142574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13119	NC_003143	CCAAA	2	10	3142639	3142648	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13120	NC_003143	TACC	2	8	3142670	3142677	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13121	NC_003143	GC	3	6	3147176	3147181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13122	NC_003143	TGT	2	6	3148766	3148771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13125	NC_003143	TAT	2	6	3148910	3148915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_003143	ATT	2	6	3149182	3149187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_003143	AGG	2	6	3149262	3149267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_003143	TTG	2	6	3149301	3149306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13130	NC_003143	AAT	2	6	3149463	3149468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_003143	TTA	2	6	3149558	3149563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13392	NC_003143	A	8	8	3223040	3223047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13492	NC_003143	GCCGC	2	10	3231063	3231072	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13493	NC_003143	G	6	6	3231106	3231111	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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