MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_003143	TTA	2	6	2997230	2997235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_003143	CAT	2	6	2997248	2997253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_003143	G	7	7	2997296	2997302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_003143	GCG	2	6	2997310	2997315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_003143	AGTC	2	8	2997511	2997518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12506	NC_003143	CAAG	2	8	2997566	2997573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12507	NC_003143	AGC	2	6	2997578	2997583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_003143	ATCA	2	8	2997587	2997594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12509	NC_003143	GTGA	2	8	2997605	2997612	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_003143	AGC	2	6	2997614	2997619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_003143	ATT	2	6	2998720	2998725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_003143	AAT	2	6	2998778	2998783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_003143	ATT	2	6	2999876	2999881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_003143	T	8	8	2999973	2999980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_003143	TTA	2	6	3000002	3000007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_003143	TAAA	2	8	3000377	3000384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_003143	TAA	2	6	3000392	3000397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_003143	CAT	2	6	3000408	3000413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_003143	TTAC	2	8	3000456	3000463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12520	NC_003143	AAAT	2	8	3000479	3000486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_003143	T	6	6	3000500	3000505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_003143	GCC	2	6	3000511	3000516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12523	NC_003143	TA	3	6	3000541	3000546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_003143	TGAG	2	8	3000576	3000583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_003143	ATG	2	6	3000585	3000590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_003143	TAT	2	6	3000645	3000650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_003143	T	8	8	3000688	3000695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_003143	GTG	2	6	3000710	3000715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_003143	TAC	2	6	3000750	3000755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_003143	ATA	2	6	3000761	3000766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_003143	ATA	2	6	3000777	3000782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_003143	GT	3	6	3000788	3000793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_003143	T	6	6	3000793	3000798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_003143	TGC	2	6	3000833	3000838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_003143	GTGTG	2	10	3000845	3000854	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_003143	TAATT	2	10	3000894	3000903	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_003143	T	8	8	3002208	3002215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_003143	CTC	2	6	3002654	3002659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12539	NC_003143	TATT	2	8	3003125	3003132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_003143	ATA	2	6	3003378	3003383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_003143	TTAT	2	8	3003393	3003400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_003143	CTT	2	6	3003419	3003424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_003143	TCT	2	6	3003447	3003452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_003143	ATGG	2	8	3003466	3003473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_003143	TAA	2	6	3003483	3003488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_003143	TTA	2	6	3003492	3003497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_003143	AC	3	6	3003615	3003620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12548	NC_003143	AAT	2	6	3003623	3003628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_003143	TTTC	2	8	3003668	3003675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12550	NC_003143	CAGC	2	8	3003695	3003702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12551	NC_003143	ATA	2	6	3003707	3003712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_003143	TCT	2	6	3003764	3003769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_003143	ATA	2	6	3003779	3003784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_003143	ATTT	2	8	3003788	3003795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_003143	A	7	7	3003827	3003833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_003143	ATT	2	6	3003914	3003919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_003143	ATTG	2	8	3005888	3005895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_003143	GA	3	6	3008249	3008254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_003143	TAT	2	6	3008690	3008695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_003143	A	7	7	3008738	3008744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_003143	TAAC	2	8	3008756	3008763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12562	NC_003143	ATA	2	6	3008788	3008793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_003143	ATCA	2	8	3008800	3008807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12564	NC_003143	TCC	2	6	3008847	3008852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12565	NC_003143	GCTC	2	8	3008886	3008893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12566	NC_003143	GAT	2	6	3008920	3008925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12569	NC_003143	ATT	2	6	3009119	3009124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_003143	AGT	2	6	3009728	3009733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12572	NC_003143	TTATT	2	10	3011526	3011535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_003143	ATC	2	6	3011674	3011679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12575	NC_003143	T	6	6	3011737	3011742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_003143	TTAAT	2	10	3012068	3012077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_003143	GGT	2	6	3012091	3012096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_003143	TTAA	2	8	3012097	3012104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_003143	CGC	2	6	3012593	3012598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12582	NC_003143	TCT	2	6	3013300	3013305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_003143	TG	3	6	3013316	3013321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_003143	TACT	2	8	3013356	3013363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12585	NC_003143	GCT	2	6	3013377	3013382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_003143	TC	3	6	3013449	3013454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12587	NC_003143	GCC	2	6	3013459	3013464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12588	NC_003143	ATT	2	6	3013479	3013484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12592	NC_003143	TAA	2	6	3017053	3017058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_003143	ATT	2	6	3017073	3017078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_003143	TC	3	6	3019193	3019198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12600	NC_003143	CCT	2	6	3021065	3021070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12601	NC_003143	GTA	2	6	3021074	3021079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_003143	T	6	6	3021080	3021085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_003143	AAC	2	6	3021089	3021094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12604	NC_003143	A	7	7	3021126	3021132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_003143	A	8	8	3021146	3021153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_003143	A	6	6	3021167	3021172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_003143	ACTT	2	8	3021234	3021241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12611	NC_003143	AT	3	6	3021673	3021678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_003143	A	6	6	3021709	3021714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_003143	T	6	6	3021746	3021751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_003143	T	6	6	3021773	3021778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_003143	GGCTGT	2	12	3021779	3021790	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12616	NC_003143	ATA	2	6	3021796	3021801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_003143	T	7	7	3021840	3021846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12621	NC_003143	TGA	2	6	3021945	3021950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_003143	TGA	2	6	3021960	3021965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_003143	TGA	2	6	3021975	3021980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12625	NC_003143	TGG	2	6	3022559	3022564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_003143	TGAA	2	8	3022566	3022573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_003143	ATAAGG	2	12	3022607	3022618	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_003143	CTTTT	2	10	3025123	3025132	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12629	NC_003143	TGA	2	6	3025221	3025226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12631	NC_003143	T	6	6	3026110	3026115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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