MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_003143	ATC	2	6	2546118	2546123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_003143	ATG	2	6	2546252	2546257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_003143	TTG	2	6	2546347	2546352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_003143	GTTA	2	8	2546445	2546452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_003143	AGC	2	6	2546484	2546489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_003143	AGC	3	9	2546532	2546540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_003143	TGA	2	6	2546574	2546579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_003143	GAA	2	6	2546613	2546618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_003143	GGC	2	6	2547654	2547659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_003143	ACA	2	6	2547666	2547671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_003143	AG	3	6	2547829	2547834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_003143	AAC	2	6	2547888	2547893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_003143	TAA	2	6	2547913	2547918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_003143	ACA	3	9	2547921	2547929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_003143	A	6	6	2547952	2547957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_003143	TTA	2	6	2549150	2549155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_003143	GCAA	2	8	2549224	2549231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10518	NC_003143	GTTT	2	8	2549298	2549305	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_003143	T	7	7	2549303	2549309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_003143	AT	3	6	2549315	2549320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_003143	ATA	2	6	2549333	2549338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_003143	C	7	7	2549446	2549452	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10523	NC_003143	CAAATC	2	12	2549461	2549472	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_003143	GAA	2	6	2549476	2549481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_003143	AGC	2	6	2549609	2549614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_003143	AT	3	6	2549715	2549720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_003143	AGG	2	6	2549743	2549748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_003143	TAT	2	6	2549801	2549806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_003143	GTC	2	6	2549871	2549876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_003143	ATC	2	6	2549884	2549889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_003143	ACAA	2	8	2549935	2549942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10532	NC_003143	TCT	2	6	2549950	2549955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_003143	TTA	2	6	2550000	2550005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_003143	CG	3	6	2550009	2550014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10535	NC_003143	AGG	2	6	2550037	2550042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_003143	GGCGA	2	10	2550045	2550054	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10537	NC_003143	CAT	2	6	2550059	2550064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_003143	ATC	2	6	2550074	2550079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_003143	CGA	2	6	2550166	2550171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_003143	TGGT	2	8	2550180	2550187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_003143	C	7	7	2550210	2550216	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10542	NC_003143	TGA	2	6	2550237	2550242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_003143	GCT	2	6	2550257	2550262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_003143	A	6	6	2550289	2550294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_003143	GCA	2	6	2550313	2550318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_003143	TTTA	2	8	2550380	2550387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_003143	A	6	6	2550435	2550440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_003143	TAA	2	6	2551682	2551687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_003143	ATT	2	6	2551698	2551703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_003143	TAT	2	6	2551730	2551735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_003143	CTGT	2	8	2551792	2551799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10552	NC_003143	GTT	2	6	2551888	2551893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_003143	ATCC	2	8	2552573	2552580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10554	NC_003143	TG	3	6	2552595	2552600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_003143	TG	3	6	2552613	2552618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_003143	TG	3	6	2552632	2552637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_003143	ATGT	2	8	2552649	2552656	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_003143	ATGT	2	8	2552667	2552674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_003143	GCT	2	6	2552677	2552682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_003143	CAT	2	6	2552697	2552702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_003143	GTA	2	6	2553954	2553959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_003143	ACA	2	6	2553989	2553994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_003143	AAT	2	6	2554036	2554041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_003143	TCC	2	6	2554357	2554362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10565	NC_003143	TTG	2	6	2555598	2555603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_003143	ACT	2	6	2555773	2555778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_003143	ATT	2	6	2557689	2557694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_003143	TTA	2	6	2557730	2557735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_003143	TAT	2	6	2562048	2562053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_003143	TCT	2	6	2562089	2562094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10571	NC_003143	TAT	2	6	2562119	2562124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_003143	A	6	6	2562131	2562136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_003143	GCC	2	6	2562163	2562168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10574	NC_003143	TCG	2	6	2562179	2562184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_003143	ATG	3	9	2562249	2562257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_003143	CGT	2	6	2562270	2562275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10577	NC_003143	ATG	2	6	2562313	2562318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_003143	GTCA	2	8	2562339	2562346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10579	NC_003143	GTTT	2	8	2562353	2562360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_003143	TGG	2	6	2562363	2562368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_003143	A	6	6	2562410	2562415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_003143	CTGT	2	8	2562423	2562430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10583	NC_003143	TTGTT	2	10	2562462	2562471	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_003143	CTG	2	6	2562784	2562789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10585	NC_003143	TGATTC	2	12	2562799	2562810	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10586	NC_003143	GAT	2	6	2562824	2562829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_003143	TAG	2	6	2562846	2562851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_003143	TAT	2	6	2562921	2562926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_003143	AT	3	6	2562962	2562967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_003143	TCA	2	6	2563009	2563014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_003143	ATGCAG	2	12	2563046	2563057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10592	NC_003143	TGA	2	6	2563292	2563297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_003143	ATTG	2	8	2563315	2563322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_003143	CT	3	6	2564363	2564368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10595	NC_003143	ACC	2	6	2564383	2564388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10596	NC_003143	ATAAA	2	10	2564909	2564918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_003143	CCT	2	6	2564943	2564948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10598	NC_003143	AAT	2	6	2564956	2564961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_003143	TCA	2	6	2564995	2565000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10600	NC_003143	GA	3	6	2565006	2565011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_003143	TAA	2	6	2565012	2565017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_003143	GTT	2	6	2565090	2565095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_003143	A	6	6	2565162	2565167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_003143	CTTC	2	8	2565276	2565283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10605	NC_003143	TCA	2	6	2565311	2565316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10606	NC_003143	TGT	2	6	2565372	2565377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_003143	CTT	2	6	2565405	2565410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_003143	GGC	2	6	2565472	2565477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_003143	GTT	2	6	2565478	2565483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_003143	ACCA	2	8	2565496	2565503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10611	NC_003143	TTG	2	6	2565575	2565580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_003143	GCT	2	6	2565660	2565665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_003143	ATT	2	6	2565700	2565705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_003143	ATT	2	6	2565732	2565737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_003143	ATA	2	6	2567687	2567692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_003143	AAAT	2	8	2567783	2567790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_003143	CGT	2	6	2567916	2567921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10618	NC_003143	CCT	2	6	2569600	2569605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10619	NC_003143	AGC	2	6	2569617	2569622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10620	NC_003143	ATT	2	6	2569624	2569629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_003143	TATT	2	8	2569644	2569651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_003143	GCA	2	6	2569654	2569659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_003143	AGG	2	6	2569682	2569687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_003143	ATT	2	6	2569760	2569765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_003143	T	6	6	2569793	2569798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_003143	TAAA	2	8	2576866	2576873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10628	NC_003143	CAG	2	6	2576929	2576934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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