MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_003143	ATC	2	6	2449087	2449092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_003143	ATT	2	6	2449095	2449100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_003143	TAA	2	6	2449125	2449130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_003143	ATT	2	6	2449273	2449278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_003143	TAT	2	6	2449279	2449284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_003143	TAT	2	6	2449941	2449946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_003143	TC	3	6	2450041	2450046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_003143	TCT	2	6	2450059	2450064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_003143	ATTA	2	8	2450103	2450110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_003143	G	6	6	2450113	2450118	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_003143	ACG	2	6	2450203	2450208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_003143	CCA	2	6	2450234	2450239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_003143	CGTT	2	8	2452141	2452148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10014	NC_003143	AAT	2	6	2452212	2452217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_003143	AAG	2	6	2452227	2452232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_003143	GA	3	6	2452242	2452247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_003143	T	6	6	2452340	2452345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_003143	AC	3	6	2452389	2452394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10019	NC_003143	TA	3	6	2452417	2452422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_003143	AAC	2	6	2452458	2452463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_003143	GCT	2	6	2452533	2452538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_003143	T	6	6	2452556	2452561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_003143	CAA	2	6	2452599	2452604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_003143	TAA	2	6	2455310	2455315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_003143	AGG	2	6	2455451	2455456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_003143	TC	3	6	2455479	2455484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_003143	T	6	6	2455487	2455492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_003143	CATT	2	8	2455589	2455596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10029	NC_003143	T	6	6	2455595	2455600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_003143	GTG	2	6	2455629	2455634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_003143	A	6	6	2455677	2455682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_003143	GGATA	2	10	2455693	2455702	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_003143	CG	3	6	2455762	2455767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10034	NC_003143	GCG	2	6	2455789	2455794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_003143	GGT	2	6	2455824	2455829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_003143	CTTA	2	8	2455851	2455858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10037	NC_003143	ATTTA	2	10	2455882	2455891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_003143	GAC	2	6	2455947	2455952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_003143	AG	4	8	2456009	2456016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_003143	TTA	2	6	2456061	2456066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_003143	TGG	2	6	2456774	2456779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_003143	T	7	7	2456788	2456794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_003143	AAT	2	6	2456834	2456839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_003143	TAA	2	6	2456865	2456870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_003143	AT	3	6	2456898	2456903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_003143	CT	3	6	2456908	2456913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10047	NC_003143	TAA	2	6	2456927	2456932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_003143	GTT	3	9	2456969	2456977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_003143	CAT	2	6	2456988	2456993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_003143	TTTC	2	8	2457091	2457098	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_003143	T	6	6	2457112	2457117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_003143	TTTA	2	8	2457122	2457129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_003143	A	6	6	2457138	2457143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_003143	TAAA	2	8	2457152	2457159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_003143	ATTT	2	8	2457177	2457184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_003143	TGC	2	6	2457208	2457213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_003143	A	6	6	2457304	2457309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_003143	ATT	2	6	2457345	2457350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_003143	ATTT	2	8	2457363	2457370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_003143	CAC	2	6	2457447	2457452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_003143	GTTC	2	8	2457474	2457481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_003143	ATA	2	6	2457544	2457549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_003143	GGCA	2	8	2459216	2459223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_003143	TGG	2	6	2459231	2459236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_003143	GTC	2	6	2459264	2459269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_003143	ATA	2	6	2463205	2463210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_003143	TA	3	6	2463258	2463263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_003143	ACCTC	2	10	2463313	2463322	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10069	NC_003143	GCAA	2	8	2463335	2463342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10070	NC_003143	TTG	3	9	2463390	2463398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_003143	GCC	2	6	2463436	2463441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_003143	ATT	2	6	2463456	2463461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_003143	TA	3	6	2463467	2463472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_003143	ATTAA	2	10	2463495	2463504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_003143	ATTTA	2	10	2463530	2463539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_003143	AATAA	2	10	2463540	2463549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_003143	AATT	2	8	2463570	2463577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_003143	TTAA	2	8	2463636	2463643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_003143	TTA	2	6	2463691	2463696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10081	NC_003143	G	8	8	2463994	2464001	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_003143	GCT	2	6	2464003	2464008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10084	NC_003143	TA	3	6	2464092	2464097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_003143	T	7	7	2464209	2464215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_003143	TG	3	6	2464560	2464565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_003143	T	6	6	2464633	2464638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_003143	TTC	2	6	2464699	2464704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10093	NC_003143	GTT	2	6	2466759	2466764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_003143	TAT	2	6	2466795	2466800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_003143	TAA	2	6	2466803	2466808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_003143	TGTTTT	2	12	2466826	2466837	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_003143	GA	3	6	2466888	2466893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_003143	ATTTT	2	10	2466928	2466937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_003143	TTTA	2	8	2466969	2466976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_003143	TTA	2	6	2466994	2466999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_003143	A	6	6	2467036	2467041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_003143	TAT	2	6	2467049	2467054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_003143	CT	3	6	2467063	2467068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_003143	TTG	2	6	2467069	2467074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_003143	T	7	7	2467092	2467098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_003143	TAA	2	6	2467121	2467126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10108	NC_003143	AATAA	2	10	2467149	2467158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_003143	TAA	2	6	2467194	2467199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_003143	TTA	3	9	2467792	2467800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_003143	TA	3	6	2467915	2467920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_003143	GAT	2	6	2467934	2467939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_003143	TTAA	2	8	2468261	2468268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_003143	A	8	8	2468270	2468277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_003143	TAA	2	6	2468282	2468287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_003143	TAT	3	9	2468306	2468314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_003143	TAA	2	6	2468342	2468347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_003143	A	7	7	2468356	2468362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_003143	T	7	7	2468377	2468383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_003143	CT	4	8	2468422	2468429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10121	NC_003143	CCAA	2	8	2468499	2468506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_003143	TCA	2	6	2468556	2468561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_003143	TAT	2	6	2468571	2468576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_003143	GAT	2	6	2468740	2468745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_003143	AG	3	6	2468749	2468754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_003143	ATA	2	6	2469132	2469137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_003143	GTT	2	6	2469227	2469232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_003143	CAT	2	6	2469247	2469252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_003143	TGC	2	6	2469286	2469291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_003143	GTT	2	6	2471433	2471438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_003143	CTT	2	6	2471535	2471540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_003143	TCTG	2	8	2472016	2472023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10133	NC_003143	GGC	2	6	2472051	2472056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_003143	AATC	2	8	2472638	2472645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10135	NC_003143	CAT	2	6	2472646	2472651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10245	NC_003143	A	7	7	2500201	2500207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10249	NC_003143	GATA	2	8	2500272	2500279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_003143	TAT	2	6	2500359	2500364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10254	NC_003143	TAT	2	6	2501276	2501281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10257	NC_003143	TAA	2	6	2502956	2502961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10259	NC_003143	GTT	2	6	2503004	2503009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10261	NC_003143	A	6	6	2503416	2503421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_003143	A	6	6	2503438	2503443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10389	NC_003143	TATC	2	8	2525831	2525838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10391	NC_003143	TGG	2	6	2525861	2525866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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