MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_003143	AAAC	2	8	2221683	2221690	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9002	NC_003143	A	6	6	2222546	2222551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_003143	ATAA	2	8	2223755	2223762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_003143	TAC	2	6	2223769	2223774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_003143	AGT	2	6	2223781	2223786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_003143	GCA	2	6	2223817	2223822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_003143	GA	3	6	2223855	2223860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_003143	GA	3	6	2223863	2223868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_003143	TAA	2	6	2223898	2223903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_003143	TCC	2	6	2223915	2223920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_003143	CCA	2	6	2223926	2223931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9012	NC_003143	TAA	2	6	2223961	2223966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_003143	CGT	2	6	2223999	2224004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_003143	GTATT	2	10	2224113	2224122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_003143	TATT	2	8	2224136	2224143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_003143	TATT	2	8	2224153	2224160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_003143	GTATT	2	10	2224164	2224173	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_003143	GTC	2	6	2224201	2224206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_003143	AGAT	2	8	2224235	2224242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_003143	TTACC	2	10	2226060	2226069	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9021	NC_003143	TCA	3	9	2226120	2226128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_003143	AAT	2	6	2226152	2226157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_003143	ATAAA	2	10	2226185	2226194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_003143	GTG	2	6	2226236	2226241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_003143	AATT	2	8	2226303	2226310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_003143	ATCAAC	5	30	2227783	2227812	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_003143	CT	3	6	2227868	2227873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9028	NC_003143	T	6	6	2227886	2227891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_003143	TTA	2	6	2227906	2227911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_003143	ATT	2	6	2227919	2227924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_003143	CT	3	6	2227959	2227964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9032	NC_003143	AGA	2	6	2227982	2227987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_003143	TTGA	2	8	2227995	2228002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_003143	A	8	8	2228028	2228035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_003143	ATT	2	6	2228091	2228096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_003143	ATT	2	6	2228108	2228113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_003143	AATA	2	8	2228118	2228125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_003143	GCT	2	6	2228256	2228261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_003143	AT	3	6	2228282	2228287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_003143	G	6	6	2228326	2228331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_003143	TGA	3	9	2228345	2228353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_003143	CTA	2	6	2228364	2228369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_003143	GT	3	6	2232242	2232247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_003143	TTG	2	6	2234657	2234662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_003143	TAA	2	6	2234714	2234719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_003143	ATT	2	6	2234766	2234771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_003143	GAT	2	6	2234773	2234778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_003143	T	8	8	2234787	2234794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_003143	TAAT	2	8	2234891	2234898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_003143	AT	3	6	2234897	2234902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_003143	ATTT	2	8	2234910	2234917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_003143	T	6	6	2234915	2234920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_003143	CT	3	6	2234965	2234970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9054	NC_003143	AAT	2	6	2235008	2235013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_003143	ATTT	2	8	2235018	2235025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_003143	TTTAA	2	10	2235037	2235046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_003143	TAA	2	6	2235057	2235062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_003143	ATT	2	6	2235082	2235087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_003143	AAT	2	6	2235124	2235129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_003143	T	6	6	2235179	2235184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_003143	ATAATG	2	12	2235248	2235259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_003143	T	7	7	2235260	2235266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_003143	ACA	2	6	2235288	2235293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_003143	TAA	2	6	2235464	2235469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_003143	CAA	2	6	2235476	2235481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_003143	TGC	2	6	2235503	2235508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_003143	A	6	6	2235522	2235527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_003143	AAAT	2	8	2235580	2235587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_003143	AAC	2	6	2235633	2235638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_003143	TGG	2	6	2235782	2235787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_003143	CTGGC	2	10	2235832	2235841	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9072	NC_003143	TTC	2	6	2235861	2235866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_003143	GCG	2	6	2236009	2236014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9074	NC_003143	TCA	2	6	2236035	2236040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9075	NC_003143	AGAA	2	8	2236060	2236067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_003143	TGC	2	6	2236079	2236084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9077	NC_003143	GCA	2	6	2236146	2236151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9078	NC_003143	AACG	2	8	2236268	2236275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9079	NC_003143	TGG	2	6	2238174	2238179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_003143	CGT	2	6	2238205	2238210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9081	NC_003143	TACA	2	8	2238226	2238233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9082	NC_003143	CAA	2	6	2238312	2238317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9083	NC_003143	GAT	2	6	2238391	2238396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_003143	GTT	2	6	2238397	2238402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_003143	T	6	6	2238470	2238475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_003143	GTG	2	6	2238623	2238628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_003143	CGC	2	6	2238647	2238652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9088	NC_003143	TGC	2	6	2240780	2240785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9090	NC_003143	GT	3	6	2241777	2241782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_003143	TA	3	6	2241788	2241793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_003143	TAAT	2	8	2241807	2241814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_003143	AGT	2	6	2243811	2243816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_003143	AGTC	2	8	2243852	2243859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9095	NC_003143	TGGTT	2	10	2243954	2243963	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_003143	GTA	2	6	2243966	2243971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_003143	GGC	2	6	2243975	2243980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_003143	CAT	2	6	2245967	2245972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_003143	ATTA	2	8	2245994	2246001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_003143	T	7	7	2246002	2246008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_003143	TATT	2	8	2246010	2246017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_003143	ATC	2	6	2246033	2246038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_003143	TAT	3	9	2246041	2246049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_003143	AGTT	2	8	2246058	2246065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_003143	TAA	2	6	2246141	2246146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_003143	AATG	2	8	2246150	2246157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_003143	GGA	2	6	2246165	2246170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_003143	CT	3	6	2246290	2246295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9109	NC_003143	AGG	3	9	2246353	2246361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_003143	GAAG	2	8	2246374	2246381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_003143	AT	3	6	2246386	2246391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_003143	AAT	2	6	2246410	2246415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_003143	AAT	2	6	2246513	2246518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_003143	GCC	2	6	2246524	2246529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9115	NC_003143	TATC	2	8	2246588	2246595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9116	NC_003143	ATT	2	6	2246609	2246614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_003143	AAC	2	6	2246731	2246736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_003143	GCG	2	6	2246793	2246798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9119	NC_003143	GCA	2	6	2246799	2246804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9120	NC_003143	ATG	2	6	2246809	2246814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_003143	TCCT	2	8	2246837	2246844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9122	NC_003143	TTA	2	6	2246853	2246858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_003143	CGG	2	6	2246899	2246904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_003143	ATG	2	6	2247079	2247084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_003143	GAG	2	6	2247137	2247142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_003143	CGGG	2	8	2247211	2247218	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9127	NC_003143	G	6	6	2247216	2247221	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_003143	ACG	2	6	2247254	2247259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_003143	ATT	2	6	2247320	2247325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_003143	A	6	6	2247341	2247346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_003143	TGG	2	6	2247449	2247454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9132	NC_003143	GGC	2	6	2247483	2247488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9133	NC_003143	GCC	2	6	2247511	2247516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9134	NC_003143	TGA	2	6	2247518	2247523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9136	NC_003143	TGC	2	6	2247599	2247604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9137	NC_003143	GTC	2	6	2250834	2250839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9138	NC_003143	GAT	2	6	2254824	2254829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9141	NC_003143	CTC	2	6	2255511	2255516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9221	NC_003143	G	6	6	2278924	2278929	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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9251	NC_003143	AT	3	6	2285995	2286000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9252	NC_003143	TCAA	2	8	2286031	2286038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9253	NC_003143	TGA	2	6	2287684	2287689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9258	NC_003143	GAT	2	6	2287843	2287848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9259	NC_003143	TAAT	2	8	2289210	2289217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9260	NC_003143	T	6	6	2292421	2292426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9261	NC_003143	TAAT	2	8	2292477	2292484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9262	NC_003143	C	8	8	2293369	2293376	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9263	NC_003143	GTT	2	6	2293397	2293402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9399	NC_003143	ACTG	2	8	2309382	2309389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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