MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_003143	ATG	2	6	2117414	2117419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_003143	A	6	6	2117428	2117433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_003143	A	6	6	2117466	2117471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_003143	A	7	7	2117509	2117515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_003143	ATAAAA	2	12	2117537	2117548	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_003143	TGA	2	6	2117554	2117559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_003143	AAT	2	6	2117560	2117565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_003143	TTTAT	2	10	2117579	2117588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_003143	T	7	7	2117597	2117603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_003143	TAT	2	6	2117635	2117640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_003143	TTG	2	6	2117641	2117646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_003143	AT	4	8	2117676	2117683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_003143	ATG	2	6	2117709	2117714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_003143	TGG	2	6	2117726	2117731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_003143	ATTTT	2	10	2117744	2117753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_003143	ATTG	2	8	2117840	2117847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_003143	TAA	2	6	2117851	2117856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_003143	CTG	2	6	2117909	2117914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_003143	AT	3	6	2117940	2117945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_003143	T	6	6	2117954	2117959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_003143	ATT	2	6	2117979	2117984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_003143	TAT	2	6	2118015	2118020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_003143	ATG	2	6	2118092	2118097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_003143	ATT	2	6	2118111	2118116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_003143	GTG	2	6	2118137	2118142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_003143	GAT	2	6	2118176	2118181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_003143	CT	3	6	2118195	2118200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8528	NC_003143	CAG	2	6	2118290	2118295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_003143	GTT	2	6	2118368	2118373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_003143	GTG	2	6	2118393	2118398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_003143	T	6	6	2118402	2118407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_003143	T	7	7	2118451	2118457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_003143	AAC	2	6	2118464	2118469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_003143	CTTG	2	8	2118495	2118502	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8535	NC_003143	TAC	2	6	2118514	2118519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_003143	CAG	2	6	2119541	2119546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_003143	CTG	2	6	2119575	2119580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_003143	CAT	2	6	2120160	2120165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_003143	CGT	2	6	2120223	2120228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_003143	CG	4	8	2120241	2120248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8541	NC_003143	TGA	2	6	2120252	2120257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_003143	CT	3	6	2120276	2120281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8543	NC_003143	AG	3	6	2120295	2120300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_003143	TGA	2	6	2120332	2120337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_003143	TTTA	2	8	2121224	2121231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_003143	AAC	2	6	2121289	2121294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_003143	AT	5	10	2121322	2121331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_003143	GTTTG	2	10	2121360	2121369	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_003143	TATTT	2	10	2121381	2121390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_003143	T	6	6	2121388	2121393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_003143	CCACA	2	10	2121394	2121403	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8552	NC_003143	AAT	2	6	2121405	2121410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_003143	AAT	2	6	2121539	2121544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_003143	AATAC	2	10	2121615	2121624	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8555	NC_003143	TATT	2	8	2122609	2122616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_003143	A	7	7	2122665	2122671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_003143	TTG	2	6	2122734	2122739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_003143	GCG	2	6	2122765	2122770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_003143	CAC	2	6	2122821	2122826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8560	NC_003143	TTA	2	6	2123179	2123184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_003143	CTCA	2	8	2123212	2123219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8562	NC_003143	AAG	2	6	2123220	2123225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_003143	CAA	2	6	2124345	2124350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_003143	CGA	2	6	2124579	2124584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8565	NC_003143	TAA	2	6	2124641	2124646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_003143	TCG	2	6	2124725	2124730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_003143	ACG	2	6	2124749	2124754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_003143	TGGC	2	8	2124967	2124974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8569	NC_003143	TG	3	6	2125054	2125059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_003143	CAT	2	6	2125125	2125130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_003143	GAC	2	6	2125257	2125262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_003143	TTC	2	6	2125317	2125322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_003143	GAC	2	6	2125428	2125433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_003143	TTAT	2	8	2125447	2125454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_003143	A	6	6	2125476	2125481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_003143	GTT	2	6	2125519	2125524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_003143	TTA	2	6	2125525	2125530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_003143	TG	3	6	2125610	2125615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_003143	AT	3	6	2125626	2125631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_003143	TTA	2	6	2125632	2125637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_003143	CAT	2	6	2125640	2125645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8582	NC_003143	CAATAA	2	12	2125741	2125752	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8583	NC_003143	TTG	2	6	2125759	2125764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_003143	T	6	6	2125826	2125831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_003143	ATAG	2	8	2125857	2125864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_003143	CTGC	2	8	2125908	2125915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8587	NC_003143	CAGC	2	8	2127052	2127059	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8588	NC_003143	ATT	2	6	2127162	2127167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_003143	AAT	2	6	2127208	2127213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_003143	CA	3	6	2127223	2127228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8591	NC_003143	TTG	2	6	2127230	2127235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_003143	ATA	2	6	2127405	2127410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_003143	T	6	6	2127425	2127430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_003143	TCA	2	6	2127538	2127543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_003143	TGG	2	6	2127550	2127555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_003143	GAG	2	6	2127664	2127669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_003143	TG	3	6	2127753	2127758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_003143	A	6	6	2127835	2127840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_003143	ATA	2	6	2127896	2127901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_003143	ATC	2	6	2127921	2127926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_003143	AGAT	2	8	2127938	2127945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_003143	TGTA	2	8	2128811	2128818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_003143	CCA	2	6	2128819	2128824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8604	NC_003143	ACC	2	6	2128927	2128932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8605	NC_003143	GGCT	2	8	2128989	2128996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8606	NC_003143	GCCATC	3	18	2129008	2129025	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8607	NC_003143	ATC	3	9	2129036	2129044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_003143	ATCA	2	8	2129087	2129094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8609	NC_003143	TCC	2	6	2129107	2129112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8610	NC_003143	TAT	2	6	2129167	2129172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_003143	CAT	2	6	2129224	2129229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_003143	AAT	2	6	2129281	2129286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_003143	AATG	2	8	2129292	2129299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_003143	CTGA	2	8	2130450	2130457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8615	NC_003143	TGA	2	6	2130468	2130473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_003143	GAAAT	2	10	2131776	2131785	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_003143	GAAG	2	8	2133495	2133502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_003143	GAG	2	6	2133503	2133508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_003143	AC	3	6	2133558	2133563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8620	NC_003143	TTA	2	6	2133567	2133572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_003143	TG	3	6	2133608	2133613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_003143	TGC	2	6	2133648	2133653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_003143	GGT	2	6	2133709	2133714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_003143	GTG	2	6	2133738	2133743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_003143	ACA	2	6	2133795	2133800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_003143	AACCG	2	10	2133826	2133835	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8627	NC_003143	TGT	2	6	2133888	2133893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_003143	TGG	2	6	2133919	2133924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_003143	TCAGCG	2	12	2133925	2133936	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8631	NC_003143	TGA	2	6	2133985	2133990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8765	NC_003143	TGG	2	6	2179247	2179252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8768	NC_003143	TCA	2	6	2179383	2179388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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