MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_003143	TTA	2	6	2018490	2018495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_003143	T	6	6	2018499	2018504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_003143	GCC	2	6	2018539	2018544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_003143	GGC	2	6	2018549	2018554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_003143	TTCTT	2	10	2020545	2020554	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8006	NC_003143	GTG	2	6	2020628	2020633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_003143	GCAG	2	8	2020647	2020654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8008	NC_003143	GTT	2	6	2020966	2020971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_003143	GATA	2	8	2021008	2021015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_003143	GCTG	2	8	2021027	2021034	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8011	NC_003143	TTTA	2	8	2021044	2021051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_003143	CG	3	6	2022307	2022312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8013	NC_003143	GAA	2	6	2022333	2022338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_003143	GCA	2	6	2022368	2022373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_003143	TCT	2	6	2022381	2022386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_003143	TC	3	6	2022396	2022401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8017	NC_003143	CCG	2	6	2022410	2022415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_003143	AGA	2	6	2022428	2022433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_003143	T	6	6	2022464	2022469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_003143	TAT	2	6	2022503	2022508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_003143	TCCA	2	8	2022551	2022558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_003143	CAT	2	6	2023983	2023988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_003143	TA	3	6	2024015	2024020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_003143	ATC	2	6	2024781	2024786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_003143	GCTG	2	8	2025250	2025257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8026	NC_003143	GTT	2	6	2025280	2025285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_003143	TCAAT	2	10	2025337	2025346	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8028	NC_003143	CT	3	6	2025393	2025398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_003143	TAC	2	6	2025414	2025419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_003143	AAT	2	6	2025438	2025443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_003143	ATG	2	6	2027604	2027609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_003143	GCG	2	6	2027629	2027634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_003143	ATTT	2	8	2027677	2027684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_003143	GTGA	2	8	2027700	2027707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_003143	ACG	2	6	2027717	2027722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_003143	AC	3	6	2027730	2027735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_003143	AT	3	6	2027759	2027764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_003143	AT	4	8	2027780	2027787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_003143	AT	3	6	2027795	2027800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_003143	A	6	6	2027837	2027842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_003143	CCG	2	6	2027844	2027849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_003143	ACGAA	2	10	2027868	2027877	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8043	NC_003143	GAT	3	9	2027902	2027910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_003143	T	6	6	2027931	2027936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_003143	T	6	6	2027958	2027963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_003143	CT	3	6	2028007	2028012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8047	NC_003143	CCCA	2	8	2028036	2028043	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8048	NC_003143	TAA	2	6	2028106	2028111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_003143	ATT	2	6	2028116	2028121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_003143	GTGAG	2	10	2028174	2028183	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_003143	ATC	2	6	2028205	2028210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_003143	TTGA	2	8	2028213	2028220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_003143	GCGG	2	8	2028267	2028274	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_003143	TAA	2	6	2028299	2028304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_003143	GACT	2	8	2029289	2029296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8056	NC_003143	CTT	2	6	2029571	2029576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_003143	ATT	2	6	2029705	2029710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_003143	AAT	2	6	2029758	2029763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_003143	ATG	2	6	2029777	2029782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_003143	TATT	2	8	2029789	2029796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_003143	TTTA	2	8	2029814	2029821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_003143	T	6	6	2029854	2029859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_003143	ATAA	2	8	2029860	2029867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_003143	ATA	2	6	2029908	2029913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_003143	ATT	2	6	2029924	2029929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_003143	ATT	2	6	2029956	2029961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_003143	CGC	2	6	2030491	2030496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8068	NC_003143	TAT	2	6	2030502	2030507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_003143	TGT	2	6	2030523	2030528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_003143	TCCC	2	8	2030535	2030542	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8071	NC_003143	TAA	2	6	2030669	2030674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_003143	GAGT	2	8	2030683	2030690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_003143	TGC	2	6	2030802	2030807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_003143	TGGT	2	8	2030820	2030827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_003143	TTC	2	6	2030837	2030842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_003143	C	6	6	2030842	2030847	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8077	NC_003143	TTTATT	2	12	2032628	2032639	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_003143	TTAA	2	8	2032661	2032668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_003143	ATT	2	6	2032681	2032686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_003143	AAG	2	6	2032733	2032738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_003143	CT	3	6	2032783	2032788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8082	NC_003143	T	7	7	2032836	2032842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_003143	TTA	2	6	2032846	2032851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_003143	TCT	2	6	2032866	2032871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_003143	GGT	2	6	2033056	2033061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_003143	ATT	2	6	2033904	2033909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_003143	TCA	2	6	2033930	2033935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_003143	AT	3	6	2033938	2033943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_003143	AAT	2	6	2034040	2034045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_003143	GTT	2	6	2034048	2034053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_003143	CGT	2	6	2034112	2034117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_003143	GCC	2	6	2034165	2034170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8093	NC_003143	ATT	2	6	2034185	2034190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_003143	GTTG	2	8	2034227	2034234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_003143	CGT	2	6	2034236	2034241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_003143	ACTT	2	8	2034253	2034260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8097	NC_003143	TACT	2	8	2034279	2034286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8098	NC_003143	GCG	2	6	2034317	2034322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_003143	A	6	6	2038193	2038198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_003143	TCA	2	6	2038207	2038212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_003143	GCA	2	6	2038281	2038286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_003143	ACA	2	6	2038295	2038300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_003143	ATT	2	6	2038330	2038335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_003143	ATA	2	6	2038342	2038347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_003143	T	7	7	2038365	2038371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_003143	TAT	2	6	2038433	2038438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_003143	AT	3	6	2038437	2038442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_003143	T	6	6	2038472	2038477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_003143	A	6	6	2038478	2038483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_003143	TAAT	2	8	2038548	2038555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_003143	GTT	2	6	2038612	2038617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_003143	ATG	2	6	2038679	2038684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_003143	TAA	2	6	2038744	2038749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_003143	AAT	2	6	2038750	2038755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_003143	ATT	2	6	2038766	2038771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_003143	ATG	2	6	2038836	2038841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_003143	TAA	2	6	2038906	2038911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_003143	TCAA	2	8	2038925	2038932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8119	NC_003143	AGAA	2	8	2038954	2038961	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_003143	TGC	2	6	2038963	2038968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_003143	AAT	2	6	2038969	2038974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_003143	GAT	2	6	2039017	2039022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_003143	CAGG	2	8	2039049	2039056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8124	NC_003143	CTCA	2	8	2039070	2039077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_003143	TGG	2	6	2039079	2039084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_003143	CT	3	6	2039182	2039187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_003143	TGGC	2	8	2039192	2039199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8128	NC_003143	T	6	6	2039228	2039233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_003143	AC	3	6	2039268	2039273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8130	NC_003143	ACC	2	6	2039361	2039366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8131	NC_003143	ATT	2	6	2039397	2039402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_003143	ATGG	2	8	2039436	2039443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_003143	TCG	2	6	2039447	2039452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8135	NC_003143	GC	3	6	2039500	2039505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8136	NC_003143	G	7	7	2039536	2039542	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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8266	NC_003143	CTTTAA	2	12	2080215	2080226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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8491	NC_003143	GA	3	6	2116792	2116797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8492	NC_003143	AATG	2	8	2116799	2116806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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