MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_003143	TTAC	2	8	1674902	1674909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6502	NC_003143	ATA	2	6	1674955	1674960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_003143	TATTT	2	10	1675094	1675103	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_003143	CTA	2	6	1675168	1675173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_003143	AGA	2	6	1675656	1675661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_003143	AGC	2	6	1675665	1675670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_003143	GA	3	6	1675691	1675696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_003143	TCT	2	6	1675734	1675739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_003143	CG	3	6	1675754	1675759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_003143	CGT	2	6	1675786	1675791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_003143	TCAGT	2	10	1675827	1675836	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6512	NC_003143	T	8	8	1675840	1675847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_003143	TCA	2	6	1675863	1675868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_003143	CTA	2	6	1675905	1675910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_003143	GAT	2	6	1675928	1675933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_003143	ATA	2	6	1675941	1675946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_003143	ATT	2	6	1676006	1676011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_003143	GAA	2	6	1676085	1676090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_003143	T	6	6	1676162	1676167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_003143	TATT	2	8	1676179	1676186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_003143	TTAAA	2	10	1676198	1676207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_003143	GAT	2	6	1676211	1676216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_003143	ATGA	2	8	1676241	1676248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_003143	GAT	2	6	1676253	1676258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_003143	AT	3	6	1676260	1676265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_003143	AAT	2	6	1676268	1676273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_003143	ATT	2	6	1676342	1676347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_003143	TAA	3	9	1676348	1676356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_003143	ATT	2	6	1676362	1676367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_003143	TAT	2	6	1676371	1676376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_003143	TTA	2	6	1676398	1676403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_003143	TTGGT	2	10	1676416	1676425	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_003143	TAAT	2	8	1676464	1676471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_003143	GTG	2	6	1676482	1676487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_003143	A	6	6	1676519	1676524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_003143	ATT	2	6	1676528	1676533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_003143	TCC	2	6	1676645	1676650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_003143	ACC	2	6	1676668	1676673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_003143	CGC	2	6	1676699	1676704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6540	NC_003143	GCTG	2	8	1676717	1676724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6541	NC_003143	CTG	2	6	1676731	1676736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_003143	TCT	2	6	1681307	1681312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_003143	ATC	2	6	1681313	1681318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_003143	C	7	7	1681318	1681324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6545	NC_003143	TAA	2	6	1684514	1684519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_003143	CGCA	2	8	1684545	1684552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6547	NC_003143	TAA	2	6	1684554	1684559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_003143	AT	3	6	1684560	1684565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_003143	T	6	6	1684621	1684626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_003143	ATT	2	6	1684633	1684638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_003143	GCC	2	6	1687557	1687562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6552	NC_003143	AAAAT	2	10	1687567	1687576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_003143	GGA	2	6	1689944	1689949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_003143	GGC	2	6	1690001	1690006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_003143	ATT	2	6	1690024	1690029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_003143	CTG	2	6	1690061	1690066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_003143	AAT	2	6	1690100	1690105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_003143	TGG	2	6	1690774	1690779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_003143	TAA	2	6	1690783	1690788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_003143	ATG	2	6	1690789	1690794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_003143	ATT	2	6	1690813	1690818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_003143	AAAT	2	8	1690844	1690851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_003143	TAT	2	6	1690863	1690868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_003143	ATTT	2	8	1690899	1690906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_003143	TATT	2	8	1690954	1690961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_003143	TG	3	6	1691014	1691019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_003143	GCT	2	6	1691023	1691028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_003143	TGC	2	6	1691070	1691075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_003143	TTG	2	6	1691140	1691145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_003143	ATAA	2	8	1691157	1691164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_003143	ATT	2	6	1691207	1691212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_003143	AT	3	6	1691225	1691230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_003143	CGT	2	6	1691239	1691244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_003143	CTG	2	6	1691321	1691326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_003143	GC	3	6	1691377	1691382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_003143	T	6	6	1691392	1691397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6578	NC_003143	TCA	2	6	1691423	1691428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_003143	GAGC	2	8	1691435	1691442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6581	NC_003143	T	7	7	1693086	1693092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_003143	TAA	3	9	1693109	1693117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_003143	ATA	2	6	1693118	1693123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_003143	AAT	2	6	1693136	1693141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_003143	TTAAT	2	10	1693200	1693209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_003143	ATT	2	6	1693247	1693252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_003143	GTT	2	6	1695190	1695195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6589	NC_003143	AAG	2	6	1697425	1697430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_003143	TA	5	10	1697545	1697554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_003143	GCCAC	2	10	1697587	1697596	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6592	NC_003143	TAT	2	6	1697597	1697602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_003143	TGG	2	6	1697603	1697608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_003143	AT	3	6	1697636	1697641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_003143	TC	3	6	1697678	1697683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6596	NC_003143	CAA	2	6	1697736	1697741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6599	NC_003143	ATT	3	9	1703543	1703551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_003143	TTTA	2	8	1703557	1703564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_003143	TATT	2	8	1703837	1703844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_003143	TTCTT	2	10	1703850	1703859	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6603	NC_003143	T	7	7	1703874	1703880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_003143	T	6	6	1703899	1703904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_003143	AATT	2	8	1703914	1703921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_003143	ATT	2	6	1703927	1703932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6608	NC_003143	TATC	2	8	1703988	1703995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6609	NC_003143	TAA	2	6	1704034	1704039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_003143	CCT	2	6	1704911	1704916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6611	NC_003143	TA	3	6	1706095	1706100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_003143	G	7	7	1706128	1706134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_003143	TGC	2	6	1706194	1706199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_003143	CAT	2	6	1706207	1706212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6617	NC_003143	AT	3	6	1706283	1706288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_003143	TGA	2	6	1707220	1707225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_003143	TAT	2	6	1707236	1707241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_003143	T	6	6	1707245	1707250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_003143	ATG	2	6	1707270	1707275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_003143	CTTT	2	8	1707283	1707290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6623	NC_003143	AGGC	2	8	1707329	1707336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6624	NC_003143	AG	4	8	1708498	1708505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_003143	GAA	2	6	1708561	1708566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_003143	CAT	2	6	1708628	1708633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_003143	AGGG	2	8	1709352	1709359	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_003143	ATG	2	6	1710576	1710581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_003143	ATGT	2	8	1710597	1710604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_003143	GA	3	6	1710654	1710659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6632	NC_003143	GTT	2	6	1710703	1710708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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