MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_003143	T	7	7	1527962	1527968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_003143	TAT	3	9	1527994	1528002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_003143	GCCTC	2	10	1529801	1529810	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6004	NC_003143	GCC	2	6	1529817	1529822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_003143	AGC	2	6	1529826	1529831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_003143	GTG	2	6	1530901	1530906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_003143	T	6	6	1530942	1530947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_003143	AGA	2	6	1534194	1534199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_003143	ATAAA	2	10	1534249	1534258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_003143	GTC	2	6	1534266	1534271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_003143	TGGC	2	8	1534370	1534377	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_003143	GTG	2	6	1534385	1534390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_003143	TTC	2	6	1534811	1534816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_003143	T	7	7	1534890	1534896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_003143	GGC	2	6	1534901	1534906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_003143	GATA	2	8	1534935	1534942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_003143	GGCA	2	8	1535007	1535014	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6018	NC_003143	ATT	2	6	1535344	1535349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_003143	CAA	2	6	1537904	1537909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_003143	GGA	2	6	1538483	1538488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_003143	TATT	2	8	1538489	1538496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_003143	AGG	2	6	1538517	1538522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_003143	TTAT	2	8	1538645	1538652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_003143	ATAA	2	8	1538654	1538661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_003143	TCA	2	6	1538735	1538740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_003143	AAG	2	6	1539048	1539053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_003143	CAG	2	6	1539937	1539942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_003143	GCG	2	6	1543616	1543621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_003143	CTTA	2	8	1543622	1543629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_003143	TTGC	2	8	1543668	1543675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6031	NC_003143	TGAG	2	8	1543735	1543742	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_003143	GAG	2	6	1543752	1543757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_003143	AAT	2	6	1543788	1543793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_003143	A	7	7	1543822	1543828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_003143	CGC	2	6	1543845	1543850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_003143	T	6	6	1543880	1543885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_003143	CAA	2	6	1543906	1543911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_003143	A	6	6	1543937	1543942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_003143	ATA	2	6	1545013	1545018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_003143	A	7	7	1545047	1545053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_003143	CAAA	2	8	1545055	1545062	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_003143	TGT	2	6	1545065	1545070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_003143	T	7	7	1545077	1545083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_003143	TATT	2	8	1545097	1545104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_003143	A	7	7	1545196	1545202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_003143	T	6	6	1545279	1545284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_003143	T	6	6	1545291	1545296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_003143	A	8	8	1545301	1545308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_003143	GAA	2	6	1545309	1545314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_003143	GGC	2	6	1545327	1545332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_003143	TG	3	6	1545336	1545341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_003143	CTT	2	6	1545371	1545376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_003143	CAT	2	6	1545410	1545415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_003143	GC	3	6	1545433	1545438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_003143	ACA	2	6	1545529	1545534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_003143	G	6	6	1545538	1545543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_003143	CTG	2	6	1545549	1545554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_003143	TAA	2	6	1545587	1545592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_003143	GACA	2	8	1545618	1545625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_003143	AAC	2	6	1545637	1545642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_003143	GTT	2	6	1545678	1545683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_003143	AG	3	6	1545741	1545746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_003143	GTT	2	6	1546329	1546334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_003143	C	6	6	1550382	1550387	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6065	NC_003143	TGA	2	6	1550417	1550422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6067	NC_003143	ACT	2	6	1552474	1552479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_003143	GTT	2	6	1552489	1552494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_003143	CGT	2	6	1552506	1552511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_003143	TTC	2	6	1552516	1552521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_003143	CAGC	2	8	1552566	1552573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_003143	TGA	2	6	1552580	1552585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_003143	GCT	2	6	1552620	1552625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_003143	GTCAA	2	10	1552640	1552649	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6075	NC_003143	CTTTT	2	10	1554069	1554078	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6076	NC_003143	T	7	7	1554075	1554081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_003143	GCCA	2	8	1554098	1554105	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_003143	TCCC	2	8	1554156	1554163	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6079	NC_003143	T	6	6	1554179	1554184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_003143	ATG	2	6	1554197	1554202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_003143	AT	3	6	1555420	1555425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_003143	CGC	2	6	1555433	1555438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_003143	GGC	2	6	1555458	1555463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_003143	GTT	2	6	1555465	1555470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_003143	CTT	2	6	1556280	1556285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_003143	TGT	2	6	1556310	1556315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_003143	TCA	2	6	1556441	1556446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_003143	T	6	6	1556474	1556479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_003143	TAA	2	6	1556486	1556491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_003143	CTCAG	2	10	1556533	1556542	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6091	NC_003143	ATC	2	6	1556706	1556711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_003143	TC	3	6	1556861	1556866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_003143	CATT	2	8	1556897	1556904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6094	NC_003143	A	6	6	1556925	1556930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_003143	GT	3	6	1556977	1556982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_003143	AT	3	6	1557032	1557037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_003143	ATT	2	6	1557053	1557058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_003143	TAATG	2	10	1557083	1557092	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_003143	ATA	2	6	1557149	1557154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_003143	T	6	6	1557183	1557188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_003143	TGAA	2	8	1557989	1557996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_003143	TGT	2	6	1558027	1558032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_003143	CT	4	8	1561256	1561263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_003143	TAA	2	6	1561272	1561277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_003143	AGTTT	2	10	1561339	1561348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_003143	T	6	6	1561363	1561368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_003143	TAT	2	6	1561385	1561390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_003143	A	7	7	1561406	1561412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_003143	A	6	6	1561428	1561433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_003143	TATT	2	8	1561525	1561532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_003143	T	7	7	1561545	1561551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_003143	A	7	7	1561561	1561567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_003143	T	7	7	1561608	1561614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_003143	TATT	2	8	1561648	1561655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_003143	TAA	2	6	1561658	1561663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_003143	CAA	2	6	1561674	1561679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_003143	T	8	8	1561742	1561749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_003143	TAAT	2	8	1563828	1563835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_003143	GTA	2	6	1563851	1563856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_003143	T	6	6	1564909	1564914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_003143	ATTC	2	8	1564983	1564990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6122	NC_003143	AAT	2	6	1564998	1565003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_003143	TAA	2	6	1565046	1565051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_003143	AATGG	2	10	1565073	1565082	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_003143	AAT	2	6	1565130	1565135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_003143	CGT	2	6	1568139	1568144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_003143	TTA	2	6	1568172	1568177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_003143	GCCTC	2	10	1568194	1568203	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6129	NC_003143	AGC	2	6	1568219	1568224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_003143	CAG	2	6	1568240	1568245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_003143	ATAA	2	8	1568285	1568292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_003143	TC	3	6	1568376	1568381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6134	NC_003143	GCA	2	6	1568419	1568424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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