MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_003143	A	6	6	1398295	1398300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_003143	GTC	2	6	1398346	1398351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_003143	G	6	6	1398364	1398369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_003143	GTT	3	9	1398400	1398408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_003143	ATAA	2	8	1398418	1398425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_003143	GCA	2	6	1398458	1398463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_003143	TGC	2	6	1398506	1398511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_003143	CTG	2	6	1398558	1398563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_003143	T	7	7	1398571	1398577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_003143	TAAT	2	8	1398593	1398600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_003143	AAT	2	6	1398607	1398612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_003143	T	8	8	1398621	1398628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_003143	A	6	6	1398629	1398634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_003143	AAG	2	6	1398703	1398708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_003143	T	7	7	1398726	1398732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_003143	ATT	2	6	1399128	1399133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_003143	A	6	6	1401476	1401481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_003143	AAAT	2	8	1401484	1401491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_003143	TAC	2	6	1402177	1402182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_003143	GGT	3	9	1402232	1402240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_003143	CAG	2	6	1402243	1402248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_003143	TAA	2	6	1402260	1402265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_003143	CTG	2	6	1403824	1403829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_003143	TCTG	2	8	1403943	1403950	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5525	NC_003143	TC	3	6	1403952	1403957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_003143	T	6	6	1404002	1404007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_003143	GT	3	6	1409314	1409319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_003143	GGC	2	6	1409326	1409331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_003143	ATT	2	6	1409352	1409357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_003143	ATT	2	6	1410185	1410190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_003143	TAA	2	6	1410268	1410273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_003143	AAG	2	6	1410310	1410315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_003143	CCG	2	6	1410319	1410324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5534	NC_003143	ATAA	2	8	1410374	1410381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_003143	CTTTT	2	10	1411283	1411292	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5536	NC_003143	CTC	2	6	1411304	1411309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_003143	ATA	2	6	1411328	1411333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_003143	TATT	2	8	1411348	1411355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_003143	AAT	2	6	1411385	1411390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_003143	CA	3	6	1411401	1411406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_003143	TCA	2	6	1411423	1411428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_003143	TGA	2	6	1411442	1411447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_003143	GC	3	6	1411450	1411455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_003143	TTA	2	6	1411494	1411499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_003143	AAG	2	6	1412986	1412991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_003143	CCTT	2	8	1413047	1413054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_003143	ATC	2	6	1413439	1413444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_003143	TGG	2	6	1413447	1413452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_003143	ATA	2	6	1413513	1413518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_003143	A	6	6	1413537	1413542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_003143	AG	3	6	1413544	1413549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_003143	CAC	2	6	1413612	1413617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_003143	TAA	2	6	1413620	1413625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_003143	AGG	2	6	1413636	1413641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_003143	TG	3	6	1413643	1413648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_003143	AGG	2	6	1413656	1413661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_003143	TGA	2	6	1413699	1413704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_003143	GGCTC	2	10	1413707	1413716	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5559	NC_003143	AGC	2	6	1413788	1413793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_003143	TTC	2	6	1413847	1413852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_003143	ATT	2	6	1414109	1414114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_003143	ATT	2	6	1414118	1414123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_003143	AAT	2	6	1414127	1414132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_003143	CGGG	2	8	1415492	1415499	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5565	NC_003143	CAC	2	6	1415521	1415526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_003143	A	6	6	1415535	1415540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_003143	CGG	2	6	1415636	1415641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_003143	GTC	2	6	1415653	1415658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_003143	TTC	2	6	1415719	1415724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_003143	AATACA	2	12	1415751	1415762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5571	NC_003143	GAGT	2	8	1415800	1415807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_003143	GTC	2	6	1415842	1415847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_003143	AGA	2	6	1415881	1415886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_003143	TA	4	8	1415987	1415994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_003143	AACT	2	8	1416020	1416027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5576	NC_003143	ATAA	2	8	1416054	1416061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_003143	CTGG	2	8	1416070	1416077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5578	NC_003143	AACC	2	8	1416539	1416546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_003143	TTG	2	6	1416561	1416566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_003143	TAC	2	6	1416666	1416671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_003143	CTG	2	6	1416678	1416683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_003143	T	6	6	1416715	1416720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_003143	T	6	6	1416736	1416741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_003143	GAA	2	6	1418883	1418888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_003143	A	6	6	1420015	1420020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_003143	CGC	2	6	1420021	1420026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_003143	GCG	2	6	1420031	1420036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_003143	T	6	6	1420037	1420042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_003143	CAA	2	6	1420163	1420168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_003143	GGA	2	6	1420742	1420747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_003143	TATT	2	8	1420748	1420755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_003143	GATG	2	8	1423004	1423011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_003143	TAT	3	9	1423083	1423091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_003143	GCCT	2	8	1423092	1423099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_003143	GTT	2	6	1423151	1423156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_003143	AAC	2	6	1423176	1423181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_003143	GAT	2	6	1423191	1423196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_003143	CCG	2	6	1423204	1423209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_003143	TCC	2	6	1423244	1423249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_003143	CTT	2	6	1423255	1423260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_003143	TGC	2	6	1423389	1423394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_003143	TTCA	2	8	1423395	1423402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_003143	TAT	2	6	1423427	1423432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_003143	ACA	2	6	1423482	1423487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_003143	TTGT	2	8	1424216	1424223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_003143	TTGT	2	8	1424231	1424238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_003143	GGA	2	6	1424313	1424318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_003143	ATGG	2	8	1425564	1425571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_003143	ATGG	2	8	1425580	1425587	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_003143	AGC	2	6	1425716	1425721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_003143	ACTG	2	8	1425792	1425799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5612	NC_003143	T	7	7	1425869	1425875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_003143	CT	3	6	1425898	1425903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_003143	A	6	6	1425925	1425930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_003143	TCA	2	6	1425948	1425953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_003143	ATT	2	6	1425974	1425979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_003143	T	6	6	1426014	1426019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_003143	A	6	6	1426033	1426038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_003143	TTA	2	6	1426138	1426143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_003143	CA	3	6	1426326	1426331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_003143	GGT	2	6	1426445	1426450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_003143	T	6	6	1426469	1426474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_003143	TTG	2	6	1432442	1432447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_003143	GTT	2	6	1433900	1433905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_003143	ATA	2	6	1433936	1433941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_003143	TGT	2	6	1433953	1433958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_003143	ATTT	2	8	1433961	1433968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_003143	CTG	2	6	1433972	1433977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_003143	A	6	6	1434016	1434021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_003143	GAG	2	6	1434031	1434036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_003143	T	7	7	1434044	1434050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5633	NC_003143	ATTA	2	8	1434280	1434287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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