MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 chromosome

Total Repeats: 19685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_003143	ATAAA	2	10	1140226	1140235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_003143	AAT	2	6	1140236	1140241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_003143	ATA	2	6	1140254	1140259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_003143	CTT	2	6	1140276	1140281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_003143	TA	3	6	1140289	1140294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_003143	ATC	2	6	1140308	1140313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_003143	TAA	2	6	1142445	1142450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_003143	TTTATG	2	12	1142523	1142534	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_003143	TGG	2	6	1147841	1147846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_003143	CGT	2	6	1147872	1147877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_003143	CAT	2	6	1147949	1147954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_003143	AAC	2	6	1148023	1148028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_003143	GGCA	2	8	1148036	1148043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_003143	GTAT	2	8	1149526	1149533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_003143	ATA	2	6	1149602	1149607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_003143	TTG	2	6	1153038	1153043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_003143	CAATA	2	10	1153050	1153059	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4518	NC_003143	GCC	3	9	1161716	1161724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_003143	T	6	6	1163143	1163148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_003143	AT	4	8	1163185	1163192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_003143	GTAT	2	8	1163198	1163205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_003143	TAA	2	6	1163206	1163211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_003143	TGA	2	6	1163237	1163242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_003143	T	7	7	1163280	1163286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_003143	GTTT	2	8	1163288	1163295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_003143	T	6	6	1163293	1163298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_003143	GTT	2	6	1163311	1163316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_003143	AAT	2	6	1164596	1164601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_003143	ACGAGG	2	12	1164657	1164668	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4530	NC_003143	A	7	7	1164759	1164765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_003143	ATG	2	6	1164784	1164789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_003143	CGA	2	6	1164834	1164839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_003143	CGA	2	6	1164857	1164862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_003143	GCT	2	6	1164871	1164876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_003143	CGTC	2	8	1164885	1164892	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_003143	CTG	2	6	1164989	1164994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_003143	GGTT	2	8	1165007	1165014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_003143	CGA	2	6	1165034	1165039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_003143	CGA	2	6	1165057	1165062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_003143	GCT	2	6	1165071	1165076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_003143	AGT	2	6	1165127	1165132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_003143	T	6	6	1165159	1165164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_003143	TTTTCT	2	12	1165187	1165198	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4544	NC_003143	T	7	7	1165217	1165223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_003143	CTGC	2	8	1165224	1165231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_003143	T	6	6	1166570	1166575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_003143	TAT	2	6	1166585	1166590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_003143	TTA	2	6	1166598	1166603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_003143	TTGT	2	8	1167933	1167940	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_003143	TTC	2	6	1167957	1167962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_003143	TGC	2	6	1167999	1168004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_003143	GCA	2	6	1168051	1168056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_003143	GAT	2	6	1169420	1169425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_003143	TG	3	6	1169436	1169441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_003143	GA	3	6	1169520	1169525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_003143	ACA	2	6	1169537	1169542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_003143	GGT	2	6	1169547	1169552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_003143	CAA	3	9	1169555	1169563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_003143	A	8	8	1169590	1169597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_003143	TGC	2	6	1169616	1169621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_003143	GACA	2	8	1169636	1169643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_003143	A	7	7	1169664	1169670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_003143	TAGCT	2	10	1169675	1169684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4564	NC_003143	ACA	2	6	1169717	1169722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_003143	CAC	3	9	1169724	1169732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_003143	TAA	2	6	1169864	1169869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_003143	TGA	2	6	1169889	1169894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_003143	A	6	6	1169906	1169911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_003143	ATG	2	6	1170929	1170934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_003143	CAT	2	6	1172519	1172524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_003143	GA	3	6	1172575	1172580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_003143	GTA	2	6	1172617	1172622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4580	NC_003143	GCT	2	6	1173697	1173702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4583	NC_003143	CAG	2	6	1175179	1175184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_003143	TCTT	2	8	1175222	1175229	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4585	NC_003143	T	7	7	1175228	1175234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_003143	GC	3	6	1175275	1175280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_003143	TGA	2	6	1176139	1176144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_003143	GA	3	6	1176143	1176148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_003143	GCC	2	6	1176236	1176241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_003143	TTA	2	6	1176827	1176832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_003143	TC	3	6	1176854	1176859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_003143	TTCT	2	8	1176886	1176893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4593	NC_003143	CAT	2	6	1176976	1176981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4596	NC_003143	TGG	2	6	1177183	1177188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_003143	T	6	6	1177352	1177357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_003143	CAA	2	6	1177475	1177480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_003143	GGA	2	6	1178054	1178059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_003143	TATT	2	8	1178060	1178067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_003143	T	7	7	1178070	1178076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_003143	TGT	2	6	1178081	1178086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_003143	T	6	6	1179319	1179324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_003143	TAT	2	6	1180311	1180316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_003143	A	7	7	1180361	1180367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_003143	GGT	2	6	1180373	1180378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4609	NC_003143	A	6	6	1181351	1181356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_003143	TAA	2	6	1181364	1181369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4613	NC_003143	TTA	2	6	1184969	1184974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_003143	TAA	2	6	1185009	1185014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4618	NC_003143	GC	3	6	1185124	1185129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_003143	ATGAAT	2	12	1185152	1185163	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4621	NC_003143	TTA	2	6	1186113	1186118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_003143	G	6	6	1186144	1186149	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_003143	GCC	2	6	1187088	1187093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_003143	ATT	2	6	1187174	1187179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_003143	GCT	2	6	1187220	1187225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_003143	ATT	2	6	1187254	1187259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_003143	CTG	2	6	1187261	1187266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_003143	ACA	2	6	1187275	1187280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_003143	TTA	2	6	1188019	1188024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4631	NC_003143	GCCA	2	8	1188109	1188116	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4763	NC_003143	ACA	2	6	1222392	1222397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4764	NC_003143	GA	4	8	1222416	1222423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4765	NC_003143	CGT	2	6	1222431	1222436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4795	NC_003143	TTCC	2	8	1231735	1231742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4882	NC_003143	TTA	2	6	1252751	1252756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4883	NC_003143	TCA	2	6	1252774	1252779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4884	NC_003143	GTT	2	6	1252921	1252926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4887	NC_003143	TG	3	6	1253180	1253185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4888	NC_003143	TAA	2	6	1253193	1253198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4889	NC_003143	GCC	2	6	1253219	1253224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4890	NC_003143	CCCA	2	8	1253349	1253356	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4891	NC_003143	GGA	2	6	1253362	1253367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4892	NC_003143	ATA	2	6	1253374	1253379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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