MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Medievalis str. Harbin 35 plasmid pMT

Total Repeats: 1609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017266	GCC	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384416965
2	NC_017266	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384416965
3	NC_017266	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416965
4	NC_017266	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	384416965
5	NC_017266	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	384416965
6	NC_017266	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	384416965
7	NC_017266	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384416965
8	NC_017266	GTTCG	2	10	426	435	0 %	40 %	40 %	20 %	384416965
9	NC_017266	GAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416965
10	NC_017266	CTT	2	6	605	610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416965
11	NC_017266	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384416965
12	NC_017266	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	384416965
13	NC_017266	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	384416965
14	NC_017266	AAGGT	2	10	775	784	40 %	20 %	40 %	0 %	384416965
15	NC_017266	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	384416965
16	NC_017266	AGC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416965
17	NC_017266	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	384416965
18	NC_017266	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416965
19	NC_017266	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416965
20	NC_017266	TGA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416965
21	NC_017266	AGCGC	2	10	1175	1184	20 %	0 %	40 %	40 %	384416966
22	NC_017266	GAA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384416966
23	NC_017266	TCA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416966
24	NC_017266	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384416966
25	NC_017266	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	384416966
26	NC_017266	CAG	3	9	1518	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416966
27	NC_017266	ACG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416966
28	NC_017266	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	384416966
29	NC_017266	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416966
30	NC_017266	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416966
31	NC_017266	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	384416966
32	NC_017266	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384416966
33	NC_017266	TTC	2	6	1664	1669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416966
34	NC_017266	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416966
35	NC_017266	TCAAA	2	10	1813	1822	60 %	20 %	0 %	20 %	384416966
36	NC_017266	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	384416966
37	NC_017266	TTTA	2	8	2017	2024	25 %	75 %	0 %	0 %	384416967
38	NC_017266	TCT	2	6	2040	2045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416967
39	NC_017266	TCA	2	6	2151	2156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416967
40	NC_017266	TTG	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384416967
41	NC_017266	TTC	2	6	2211	2216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416967
42	NC_017266	TCT	2	6	2260	2265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416967
43	NC_017266	CTT	2	6	2269	2274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416967
44	NC_017266	GA	3	6	2323	2328	50 %	0 %	50 %	0 %	384416967
45	NC_017266	GAT	2	6	2413	2418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416967
46	NC_017266	CTT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416967
47	NC_017266	GTC	2	6	2478	2483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416967
48	NC_017266	GGT	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384416967
49	NC_017266	AT	3	6	2553	2558	50 %	50 %	0 %	0 %	384416967
50	NC_017266	CAG	2	6	2573	2578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416967
51	NC_017266	ATAGTG	2	12	2998	3009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416968
52	NC_017266	TG	3	6	3008	3013	0 %	50 %	50 %	0 %	384416968
53	NC_017266	TGAG	2	8	3060	3067	25 %	25 %	50 %	0 %	384416968
54	NC_017266	CAG	2	6	3113	3118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416968
55	NC_017266	ACT	2	6	3150	3155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416968
56	NC_017266	CTG	2	6	3186	3191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416968
57	NC_017266	TG	3	6	3190	3195	0 %	50 %	50 %	0 %	384416968
58	NC_017266	TGT	2	6	3390	3395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384416968
59	NC_017266	GGTT	2	8	3396	3403	0 %	50 %	50 %	0 %	384416968
60	NC_017266	ACA	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384416968
61	NC_017266	ATC	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416968
62	NC_017266	AC	3	6	3530	3535	50 %	0 %	0 %	50 %	384416968
63	NC_017266	GCC	2	6	3550	3555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384416968
64	NC_017266	AC	3	6	3566	3571	50 %	0 %	0 %	50 %	384416968
65	NC_017266	ATG	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416968
66	NC_017266	GGT	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384416968
67	NC_017266	ACT	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416968
68	NC_017266	AT	3	6	3689	3694	50 %	50 %	0 %	0 %	384416968
69	NC_017266	AAC	2	6	3751	3756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384416968
70	NC_017266	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384416968
71	NC_017266	CTG	2	6	3878	3883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416968
72	NC_017266	ACC	2	6	4058	4063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384416968
73	NC_017266	AAT	2	6	4120	4125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384416968
74	NC_017266	AGCC	2	8	4169	4176	25 %	0 %	25 %	50 %	384416968
75	NC_017266	CAA	2	6	4194	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384416968
76	NC_017266	TCCA	2	8	4254	4261	25 %	25 %	0 %	50 %	384416968
77	NC_017266	GCT	2	6	4265	4270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416968
78	NC_017266	GCA	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416968
79	NC_017266	CAA	2	6	4370	4375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384416968
80	NC_017266	CAG	3	9	4424	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416968
81	NC_017266	CTAT	2	8	4477	4484	25 %	50 %	0 %	25 %	384416968
82	NC_017266	ACT	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416968
83	NC_017266	AAC	2	6	4581	4586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384416968
84	NC_017266	CTG	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416968
85	NC_017266	GTT	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384416968
86	NC_017266	TGC	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416968
87	NC_017266	CCG	2	6	4727	4732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384416968
88	NC_017266	GCT	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416968
89	NC_017266	AGC	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416968
90	NC_017266	CAT	2	6	4880	4885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416968
91	NC_017266	GCT	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416968
92	NC_017266	AGC	4	12	4998	5009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416968
93	NC_017266	GAA	2	6	5068	5073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384416968
94	NC_017266	GCA	2	6	5089	5094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416968
95	NC_017266	GCTGAA	2	12	5257	5268	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384416968
96	NC_017266	GC	3	6	5329	5334	0 %	0 %	50 %	50 %	384416968
97	NC_017266	CGA	2	6	5420	5425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416968
98	NC_017266	TCA	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416968
99	NC_017266	TGA	2	6	5591	5596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416968
100	NC_017266	CTTC	2	8	5609	5616	0 %	50 %	0 %	50 %	384416968
101	NC_017266	TTG	2	6	5689	5694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384416968
102	NC_017266	GTGCCA	2	12	5752	5763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384416968
103	NC_017266	CCG	2	6	5900	5905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384416969
104	NC_017266	C	6	6	5917	5922	0 %	0 %	0 %	100 %	384416969
105	NC_017266	CA	3	6	5956	5961	50 %	0 %	0 %	50 %	384416969
106	NC_017266	T	6	6	5975	5980	0 %	100 %	0 %	0 %	384416969
107	NC_017266	TCGT	2	8	5993	6000	0 %	50 %	25 %	25 %	384416969
108	NC_017266	AAC	2	6	6021	6026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384416969
109	NC_017266	TTA	2	6	6084	6089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384416969
110	NC_017266	AGA	2	6	6103	6108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384416969
111	NC_017266	GCT	2	6	6132	6137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416969
112	NC_017266	ATTA	2	8	6242	6249	50 %	50 %	0 %	0 %	384416969
113	NC_017266	ACC	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384416969
114	NC_017266	CAG	2	6	6487	6492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416969
115	NC_017266	ATA	2	6	6513	6518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384416969
116	NC_017266	TTCA	2	8	6562	6569	25 %	50 %	0 %	25 %	384416970
117	NC_017266	TAA	2	6	6644	6649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384416970
118	NC_017266	GATT	2	8	6662	6669	25 %	50 %	25 %	0 %	384416970
119	NC_017266	TC	3	6	6680	6685	0 %	50 %	0 %	50 %	384416970
120	NC_017266	AT	3	6	6691	6696	50 %	50 %	0 %	0 %	384416970
121	NC_017266	CTG	2	6	6697	6702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416970
122	NC_017266	TCC	2	6	6758	6763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384416970
123	NC_017266	TAG	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416970
124	NC_017266	CTG	2	6	6836	6841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416970
125	NC_017266	GCA	2	6	6953	6958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416970
126	NC_017266	GTT	2	6	6979	6984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384416970
127	NC_017266	CTGC	2	8	7025	7032	0 %	25 %	25 %	50 %	384416970
128	NC_017266	CTGC	2	8	7185	7192	0 %	25 %	25 %	50 %	384416970
129	NC_017266	CGC	2	6	7257	7262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384416970
130	NC_017266	GCA	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416970
131	NC_017266	CTT	2	6	7303	7308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416970
132	NC_017266	TGC	2	6	7334	7339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416970
133	NC_017266	CG	3	6	7418	7423	0 %	0 %	50 %	50 %	384416970
134	NC_017266	AGC	2	6	7441	7446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416970
135	NC_017266	CAGAG	2	10	7495	7504	40 %	0 %	40 %	20 %	384416970
136	NC_017266	TCT	2	6	7628	7633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416970
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138	NC_017266	GTG	2	6	7775	7780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384416970
139	NC_017266	TCG	2	6	7850	7855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416970
140	NC_017266	TTGTC	2	10	7893	7902	0 %	60 %	20 %	20 %	384416970
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142	NC_017266	TCG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416970
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148	NC_017266	CGT	2	6	8406	8411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416970
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150	NC_017266	TGTT	2	8	8546	8553	0 %	75 %	25 %	0 %	384416970
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152	NC_017266	AGC	2	6	8600	8605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416970
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155	NC_017266	GTG	2	6	8777	8782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384416970
156	NC_017266	GGC	2	6	8785	8790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384416970
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158	NC_017266	AG	3	6	8918	8923	50 %	0 %	50 %	0 %	384416970
159	NC_017266	GGC	2	6	8936	8941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384416970
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161	NC_017266	GTT	2	6	9100	9105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384416970
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247	NC_017266	GTC	2	6	14442	14447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416975
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250	NC_017266	TGA	2	6	14848	14853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416975
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252	NC_017266	CCA	2	6	14872	14877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384416975
253	NC_017266	TGA	2	6	15022	15027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416975
254	NC_017266	ATC	2	6	15057	15062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416975
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256	NC_017266	GTC	2	6	15098	15103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416975
257	NC_017266	ATC	2	6	15147	15152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384416975
258	NC_017266	TGA	2	6	15160	15165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416975
259	NC_017266	TGG	2	6	15205	15210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384416975
260	NC_017266	GA	3	6	15218	15223	50 %	0 %	50 %	0 %	384416975
261	NC_017266	GCCG	2	8	15305	15312	0 %	0 %	50 %	50 %	384416975
262	NC_017266	CTTC	2	8	15334	15341	0 %	50 %	0 %	50 %	384416975
263	NC_017266	GCT	3	9	15390	15398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416975
264	NC_017266	GCG	2	6	15426	15431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384416975
265	NC_017266	GCA	2	6	15438	15443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416975
266	NC_017266	TCG	2	6	15450	15455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416975
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268	NC_017266	GAT	2	6	15527	15532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416975
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271	NC_017266	CGC	2	6	15704	15709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384416975
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280	NC_017266	CTT	2	6	16102	16107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416975
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285	NC_017266	CTG	2	6	16280	16285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416975
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293	NC_017266	GA	3	6	16901	16906	50 %	0 %	50 %	0 %	384416975
294	NC_017266	AGG	2	6	16951	16956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384416975
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370	NC_017266	CGACA	2	10	21796	21805	40 %	0 %	20 %	40 %	384416982
371	NC_017266	CGA	2	6	21852	21857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384416982
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376	NC_017266	GCT	2	6	22286	22291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416983
377	NC_017266	TTC	3	9	22406	22414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384416983
378	NC_017266	TGC	2	6	22462	22467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416984
379	NC_017266	T	6	6	22609	22614	0 %	100 %	0 %	0 %	384416984
380	NC_017266	GTTACG	2	12	22691	22702	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384416984
381	NC_017266	TGAA	2	8	22857	22864	50 %	25 %	25 %	0 %	384416984
382	NC_017266	ACGG	2	8	22922	22929	25 %	0 %	50 %	25 %	384416984
383	NC_017266	AAGC	2	8	22976	22983	50 %	0 %	25 %	25 %	384416984
384	NC_017266	GAT	2	6	22989	22994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384416984
385	NC_017266	CTG	2	6	22996	23001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384416984
386	NC_017266	GCTC	2	8	23004	23011	0 %	25 %	25 %	50 %	384416984
387	NC_017266	CGGCA	2	10	23043	23052	20 %	0 %	40 %	40 %	384416984
388	NC_017266	GCG	2	6	23209	23214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384416985
389	NC_017266	AG	3	6	23239	23244	50 %	0 %	50 %	0 %	384416985
390	NC_017266	CAA	2	6	23303	23308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384416985
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