MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Medievalis str. Harbin 35 chromosome

Total Repeats: 70304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017265	CTT	2	6	217466	217471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412921
3502	NC_017265	CCA	2	6	217566	217571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412921
3503	NC_017265	TGT	2	6	217615	217620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412921
3504	NC_017265	CGT	2	6	217749	217754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412921
3505	NC_017265	CG	3	6	217877	217882	0 %	0 %	50 %	50 %	384412922
3506	NC_017265	CAG	2	6	217961	217966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412922
3507	NC_017265	GAC	2	6	218029	218034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412922
3508	NC_017265	GC	3	6	218071	218076	0 %	0 %	50 %	50 %	384412922
3509	NC_017265	TTG	2	6	218090	218095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412922
3510	NC_017265	GCG	2	6	218114	218119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412922
3511	NC_017265	CG	3	6	218126	218131	0 %	0 %	50 %	50 %	384412922
3512	NC_017265	ATC	2	6	218177	218182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412922
3513	NC_017265	CAT	2	6	218303	218308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412922
3514	NC_017265	CAT	2	6	218365	218370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412922
3515	NC_017265	CAA	2	6	218402	218407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412922
3516	NC_017265	TCA	3	9	218436	218444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412922
3517	NC_017265	ACA	2	6	218650	218655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412923
3518	NC_017265	GTTC	2	8	218673	218680	0 %	50 %	25 %	25 %	384412923
3519	NC_017265	TTC	2	6	218685	218690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412923
3520	NC_017265	GCC	2	6	218692	218697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412923
3521	NC_017265	TGC	2	6	218700	218705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412923
3522	NC_017265	ACA	2	6	218708	218713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412923
3523	NC_017265	GAT	3	9	218748	218756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412923
3524	NC_017265	CAG	2	6	218815	218820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412923
3525	NC_017265	CGA	2	6	218925	218930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412923
3526	NC_017265	GCT	2	6	218932	218937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412923
3527	NC_017265	GCA	2	6	219084	219089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412923
3528	NC_017265	CAG	2	6	219095	219100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412923
3529	NC_017265	CTT	2	6	219107	219112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412923
3530	NC_017265	AAGT	2	8	219121	219128	50 %	25 %	25 %	0 %	384412923
3531	NC_017265	AGT	3	9	219126	219134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412923
3532	NC_017265	CTT	2	6	219592	219597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412924
3533	NC_017265	AATA	2	8	219660	219667	75 %	25 %	0 %	0 %	384412924
3534	NC_017265	TGG	2	6	219692	219697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412924
3535	NC_017265	TGC	2	6	219735	219740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412924
3536	NC_017265	AGG	2	6	219814	219819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384412925
3537	NC_017265	ATC	2	6	219832	219837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412925
3538	NC_017265	AAC	2	6	219848	219853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412925
3539	NC_017265	C	6	6	219859	219864	0 %	0 %	0 %	100 %	384412925
3540	NC_017265	ACG	2	6	219865	219870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412925
3541	NC_017265	CT	3	6	219871	219876	0 %	50 %	0 %	50 %	384412925
3542	NC_017265	CTG	2	6	219915	219920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412925
3543	NC_017265	GCC	2	6	219932	219937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412925
3544	NC_017265	AAC	2	6	219999	220004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412925
3545	NC_017265	ACG	2	6	220044	220049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412925
3546	NC_017265	CCGTAC	2	12	220221	220232	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384412925
3547	NC_017265	GCTG	2	8	220240	220247	0 %	25 %	50 %	25 %	384412925
3548	NC_017265	CCAG	2	8	220259	220266	25 %	0 %	25 %	50 %	384412925
3549	NC_017265	GTTG	2	8	220301	220308	0 %	50 %	50 %	0 %	384412925
3550	NC_017265	CTG	2	6	220359	220364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412925
3551	NC_017265	ATT	2	6	220406	220411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412925
3552	NC_017265	AGCG	2	8	220433	220440	25 %	0 %	50 %	25 %	384412925
3553	NC_017265	CAT	2	6	220481	220486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412925
3554	NC_017265	GAG	2	6	220554	220559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384412925
3555	NC_017265	TGA	2	6	220564	220569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412925
3556	NC_017265	GAA	3	9	220734	220742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412925
3557	NC_017265	CTT	2	6	220870	220875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412926
3558	NC_017265	TCA	2	6	220883	220888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412926
3559	NC_017265	TGA	2	6	220916	220921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412926
3560	NC_017265	AAT	2	6	220927	220932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412926
3561	NC_017265	TCA	2	6	220937	220942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412926
3562	NC_017265	TGG	2	6	221415	221420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412927
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3564	NC_017265	TGG	2	6	221464	221469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412927
3565	NC_017265	CT	3	6	221480	221485	0 %	50 %	0 %	50 %	384412927
3566	NC_017265	CT	3	6	221510	221515	0 %	50 %	0 %	50 %	384412927
3567	NC_017265	CTG	2	6	221521	221526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412927
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3572	NC_017265	TGA	2	6	221800	221805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412927
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3607	NC_017265	TTG	2	6	224244	224249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412929
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3985	NC_017265	TTG	2	6	248159	248164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412955
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3987	NC_017265	T	6	6	248182	248187	0 %	100 %	0 %	0 %	384412955
3988	NC_017265	TCA	2	6	248199	248204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412955
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3990	NC_017265	TTG	2	6	248274	248279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412955
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