MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Medievalis str. Harbin 35 chromosome

Total Repeats: 70304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017265	CTG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412707
2	NC_017265	TTG	2	6	387	392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412707
3	NC_017265	AACC	2	8	443	450	50 %	0 %	0 %	50 %	384412707
4	NC_017265	TGT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412707
5	NC_017265	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412707
6	NC_017265	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412707
7	NC_017265	TCA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412708
8	NC_017265	TTG	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412708
9	NC_017265	CTG	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412708
10	NC_017265	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412708
11	NC_017265	GTG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412708
12	NC_017265	CTT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412708
13	NC_017265	T	6	6	998	1003	0 %	100 %	0 %	0 %	384412708
14	NC_017265	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412708
15	NC_017265	CGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412708
16	NC_017265	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412708
17	NC_017265	GTGC	2	8	1194	1201	0 %	25 %	50 %	25 %	384412708
18	NC_017265	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412708
19	NC_017265	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	384412709
20	NC_017265	ACA	3	9	1457	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412709
21	NC_017265	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412709
22	NC_017265	CATT	2	8	1644	1651	25 %	50 %	0 %	25 %	384412709
23	NC_017265	ATTC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	384412709
24	NC_017265	GCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412709
25	NC_017265	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412709
26	NC_017265	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412709
27	NC_017265	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412709
28	NC_017265	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412709
29	NC_017265	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412709
30	NC_017265	ATCA	2	8	2269	2276	50 %	25 %	0 %	25 %	384412709
31	NC_017265	TGC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412709
32	NC_017265	ACA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412709
33	NC_017265	CTG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412709
34	NC_017265	GCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412710
35	NC_017265	TGG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412710
36	NC_017265	CTG	3	9	2657	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412710
37	NC_017265	TTTA	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	384412710
38	NC_017265	GCC	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412710
39	NC_017265	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412710
40	NC_017265	GTTG	2	8	2815	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	384412710
41	NC_017265	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412710
42	NC_017265	ATG	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412710
43	NC_017265	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412710
44	NC_017265	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412710
45	NC_017265	T	6	6	3067	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	384412710
46	NC_017265	GCG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412710
47	NC_017265	ACTC	2	8	3148	3155	25 %	25 %	0 %	50 %	384412710
48	NC_017265	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412710
49	NC_017265	TGA	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412710
50	NC_017265	CCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384412710
51	NC_017265	CTGG	2	8	3241	3248	0 %	25 %	50 %	25 %	384412710
52	NC_017265	GCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412710
53	NC_017265	TGG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412710
54	NC_017265	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412710
55	NC_017265	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412710
56	NC_017265	TGA	3	9	3540	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412710
57	NC_017265	T	6	6	3627	3632	0 %	100 %	0 %	0 %	384412710
58	NC_017265	TCC	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384412710
59	NC_017265	ATTC	2	8	3772	3779	25 %	50 %	0 %	25 %	384412710
60	NC_017265	GTT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412710
61	NC_017265	A	8	8	3884	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	384412710
62	NC_017265	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412710
63	NC_017265	ACC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412710
64	NC_017265	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412710
65	NC_017265	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412711
66	NC_017265	GTT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412711
67	NC_017265	TTG	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412711
68	NC_017265	TTG	2	6	4061	4066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412711
69	NC_017265	CCA	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412711
70	NC_017265	GCCA	2	8	4113	4120	25 %	0 %	25 %	50 %	384412711
71	NC_017265	GAT	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412711
72	NC_017265	TAAA	2	8	4132	4139	75 %	25 %	0 %	0 %	384412711
73	NC_017265	GTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412711
74	NC_017265	CAG	3	9	4205	4213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412711
75	NC_017265	TGG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412711
76	NC_017265	TGGC	2	8	4262	4269	0 %	25 %	50 %	25 %	384412711
77	NC_017265	ATC	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412711
78	NC_017265	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412711
79	NC_017265	CTGT	2	8	4470	4477	0 %	50 %	25 %	25 %	384412711
80	NC_017265	AGTG	2	8	4538	4545	25 %	25 %	50 %	0 %	384412711
81	NC_017265	TGG	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412711
82	NC_017265	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412711
83	NC_017265	TAA	2	6	4610	4615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412711
84	NC_017265	CAA	2	6	4643	4648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412711
85	NC_017265	TCA	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412711
86	NC_017265	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412711
87	NC_017265	GTA	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412711
88	NC_017265	CTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412711
89	NC_017265	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412711
90	NC_017265	TCAA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	0 %	25 %	384412711
91	NC_017265	TGG	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412711
92	NC_017265	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412711
93	NC_017265	CTG	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412711
94	NC_017265	CAG	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412711
95	NC_017265	GCT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412711
96	NC_017265	CTT	3	9	5266	5274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412711
97	NC_017265	TCA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412711
98	NC_017265	GCG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412711
99	NC_017265	GGA	2	6	5406	5411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384412711
100	NC_017265	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412711
101	NC_017265	TTCT	2	8	5518	5525	0 %	75 %	0 %	25 %	384412711
102	NC_017265	GAT	2	6	5535	5540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412711
103	NC_017265	GA	3	6	5917	5922	50 %	0 %	50 %	0 %	384412712
104	NC_017265	T	6	6	5974	5979	0 %	100 %	0 %	0 %	384412712
105	NC_017265	GTC	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412712
106	NC_017265	AGG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384412712
107	NC_017265	TGG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412712
108	NC_017265	TGG	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412712
109	NC_017265	CTT	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412712
110	NC_017265	CGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412712
111	NC_017265	TAT	2	6	6382	6387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412712
112	NC_017265	T	6	6	6437	6442	0 %	100 %	0 %	0 %	384412712
113	NC_017265	T	6	6	6464	6469	0 %	100 %	0 %	0 %	384412712
114	NC_017265	CGT	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412712
115	NC_017265	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412712
116	NC_017265	TTA	2	6	6614	6619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412712
117	NC_017265	CTT	2	6	6649	6654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412712
118	NC_017265	ACC	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412712
119	NC_017265	ATT	2	6	6797	6802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412712
120	NC_017265	AT	4	8	6830	6837	50 %	50 %	0 %	0 %	384412712
121	NC_017265	GGT	2	6	6868	6873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412712
122	NC_017265	GGC	3	9	6910	6918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412712
123	NC_017265	TCG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412712
124	NC_017265	TTG	2	6	7031	7036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412712
125	NC_017265	ATT	2	6	7075	7080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412712
126	NC_017265	GTTG	2	8	7089	7096	0 %	50 %	50 %	0 %	384412712
127	NC_017265	TAT	3	9	7123	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412712
128	NC_017265	ACC	2	6	7133	7138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412712
129	NC_017265	GAT	2	6	7201	7206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412712
130	NC_017265	CGG	2	6	7248	7253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412712
131	NC_017265	AATG	2	8	7270	7277	50 %	25 %	25 %	0 %	384412712
132	NC_017265	ATT	2	6	7291	7296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412712
133	NC_017265	GTGTT	2	10	7332	7341	0 %	60 %	40 %	0 %	384412712
134	NC_017265	GGT	2	6	7426	7431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412712
135	NC_017265	GAT	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412712
136	NC_017265	CGT	2	6	7521	7526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412712
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138	NC_017265	CCCA	2	8	7645	7652	25 %	0 %	0 %	75 %	384412712
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162	NC_017265	TTA	2	6	9154	9159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412714
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256	NC_017265	ATG	2	6	20144	20149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412721
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258	NC_017265	ATTG	2	8	20220	20227	25 %	50 %	25 %	0 %	384412721
259	NC_017265	GGT	2	6	20290	20295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412721
260	NC_017265	CTG	2	6	20338	20343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412721
261	NC_017265	TGG	2	6	20404	20409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412721
262	NC_017265	AGC	2	6	20432	20437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412721
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264	NC_017265	ACC	2	6	20522	20527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412721
265	NC_017265	CCA	2	6	20532	20537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412721
266	NC_017265	TTG	2	6	20540	20545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412721
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272	NC_017265	GCC	2	6	20725	20730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412721
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