MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Medievalis str. Harbin 35 plasmid pCD

Total Repeats: 497

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017263	ATC	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412641
2	NC_017263	ATTT	2	8	1659	1666	25 %	75 %	0 %	0 %	384412641
3	NC_017263	AGC	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412641
4	NC_017263	AGCC	2	8	1809	1816	25 %	0 %	25 %	50 %	384412641
5	NC_017263	ATC	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412641
6	NC_017263	GGT	2	6	1899	1904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412641
7	NC_017263	TGC	2	6	1971	1976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412641
8	NC_017263	GCA	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412641
9	NC_017263	TGC	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412641
10	NC_017263	TGG	2	6	2115	2120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412641
11	NC_017263	TGG	2	6	2196	2201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412641
12	NC_017263	GGC	2	6	2202	2207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412641
13	NC_017263	GCAG	2	8	2241	2248	25 %	0 %	50 %	25 %	384412641
14	NC_017263	T	6	6	2392	2397	0 %	100 %	0 %	0 %	384412642
15	NC_017263	TC	3	6	2428	2433	0 %	50 %	0 %	50 %	384412642
16	NC_017263	TAC	2	6	2442	2447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412642
17	NC_017263	ATCTAT	2	12	2471	2482	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384412642
18	NC_017263	GCA	2	6	2491	2496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412642
19	NC_017263	TA	3	6	2528	2533	50 %	50 %	0 %	0 %	384412642
20	NC_017263	TA	3	6	2535	2540	50 %	50 %	0 %	0 %	384412642
21	NC_017263	CAG	2	6	3123	3128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412643
22	NC_017263	CAC	2	6	3260	3265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412643
23	NC_017263	GT	3	6	3286	3291	0 %	50 %	50 %	0 %	384412643
24	NC_017263	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412643
25	NC_017263	GGAT	2	8	3548	3555	25 %	25 %	50 %	0 %	384412644
26	NC_017263	CAT	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412644
27	NC_017263	AGAT	2	8	3610	3617	50 %	25 %	25 %	0 %	384412644
28	NC_017263	TGA	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412644
29	NC_017263	CCG	2	6	3633	3638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412644
30	NC_017263	GTT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412644
31	NC_017263	CGC	2	6	6934	6939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412645
32	NC_017263	CAT	2	6	6961	6966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412645
33	NC_017263	CCA	2	6	7183	7188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412646
34	NC_017263	G	7	7	7199	7205	0 %	0 %	100 %	0 %	384412646
35	NC_017263	TGT	2	6	7206	7211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412646
36	NC_017263	ATG	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412646
37	NC_017263	AGC	2	6	7277	7282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412646
38	NC_017263	AC	3	6	7483	7488	50 %	0 %	0 %	50 %	384412647
39	NC_017263	CCA	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412647
40	NC_017263	AT	3	6	7598	7603	50 %	50 %	0 %	0 %	384412647
41	NC_017263	CA	3	6	7610	7615	50 %	0 %	0 %	50 %	384412647
42	NC_017263	GCCA	2	8	7748	7755	25 %	0 %	25 %	50 %	384412647
43	NC_017263	CAC	2	6	7759	7764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412647
44	NC_017263	CAG	2	6	7786	7791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412647
45	NC_017263	CTG	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412647
46	NC_017263	GCT	2	6	7811	7816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412647
47	NC_017263	GGC	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412647
48	NC_017263	TCA	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412648
49	NC_017263	CTGC	2	8	7997	8004	0 %	25 %	25 %	50 %	384412648
50	NC_017263	TTTCCA	2	12	8018	8029	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384412648
51	NC_017263	CTT	3	9	8111	8119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412648
52	NC_017263	CCGG	2	8	8424	8431	0 %	0 %	50 %	50 %	384412649
53	NC_017263	CTT	2	6	8433	8438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412649
54	NC_017263	GAA	2	6	8465	8470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412649
55	NC_017263	TGTT	2	8	8492	8499	0 %	75 %	25 %	0 %	384412649
56	NC_017263	TG	3	6	8507	8512	0 %	50 %	50 %	0 %	384412649
57	NC_017263	GCC	2	6	8552	8557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412649
58	NC_017263	GTG	2	6	8576	8581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412649
59	NC_017263	CAA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412649
60	NC_017263	GCC	2	6	8669	8674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412649
61	NC_017263	GCA	2	6	8750	8755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412649
62	NC_017263	TCT	2	6	8846	8851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412649
63	NC_017263	G	6	6	8901	8906	0 %	0 %	100 %	0 %	384412649
64	NC_017263	T	6	6	8936	8941	0 %	100 %	0 %	0 %	384412649
65	NC_017263	AAT	2	6	12077	12082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412650
66	NC_017263	TA	3	6	12109	12114	50 %	50 %	0 %	0 %	384412650
67	NC_017263	AAG	2	6	12147	12152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412650
68	NC_017263	ATT	2	6	12158	12163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412650
69	NC_017263	AAT	2	6	12206	12211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412650
70	NC_017263	TAT	2	6	12212	12217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412650
71	NC_017263	TTA	2	6	12220	12225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412650
72	NC_017263	TAA	2	6	12274	12279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412650
73	NC_017263	CCA	2	6	12282	12287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412650
74	NC_017263	TCC	2	6	12305	12310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384412650
75	NC_017263	TA	4	8	12325	12332	50 %	50 %	0 %	0 %	384412650
76	NC_017263	TTG	2	6	12393	12398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412650
77	NC_017263	A	6	6	12400	12405	100 %	0 %	0 %	0 %	384412650
78	NC_017263	AAG	2	6	12427	12432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412650
79	NC_017263	TGC	2	6	12447	12452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412650
80	NC_017263	AAT	2	6	13668	13673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412651
81	NC_017263	AAC	2	6	13682	13687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412651
82	NC_017263	GTC	2	6	13786	13791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412651
83	NC_017263	TAC	2	6	14379	14384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412652
84	NC_017263	CAT	2	6	14392	14397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412652
85	NC_017263	CT	3	6	14498	14503	0 %	50 %	0 %	50 %	384412652
86	NC_017263	GAT	2	6	14566	14571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412652
87	NC_017263	TTA	3	9	14628	14636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412652
88	NC_017263	TTC	2	6	14648	14653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412652
89	NC_017263	ATA	2	6	14708	14713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412652
90	NC_017263	TGG	2	6	14720	14725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412652
91	NC_017263	A	6	6	14743	14748	100 %	0 %	0 %	0 %	384412652
92	NC_017263	AAG	2	6	14766	14771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412652
93	NC_017263	AAT	2	6	14806	14811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412652
94	NC_017263	AAG	2	6	14895	14900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412652
95	NC_017263	TTC	2	6	14924	14929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412652
96	NC_017263	ATT	2	6	14936	14941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412652
97	NC_017263	CAA	2	6	14947	14952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412652
98	NC_017263	T	6	6	14984	14989	0 %	100 %	0 %	0 %	384412652
99	NC_017263	AAG	2	6	15021	15026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412652
100	NC_017263	TTC	2	6	15050	15055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412652
101	NC_017263	ATT	2	6	15062	15067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412652
102	NC_017263	CAG	2	6	15070	15075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412652
103	NC_017263	AGG	2	6	15092	15097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384412652
104	NC_017263	T	6	6	15110	15115	0 %	100 %	0 %	0 %	384412652
105	NC_017263	AAT	2	6	15137	15142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412652
106	NC_017263	AAG	2	6	15147	15152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412652
107	NC_017263	ATT	2	6	15188	15193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412652
108	NC_017263	GGT	2	6	15219	15224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384412652
109	NC_017263	TTA	2	6	15249	15254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412652
110	NC_017263	CT	3	6	15327	15332	0 %	50 %	0 %	50 %	384412652
111	NC_017263	ATT	2	6	15371	15376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412652
112	NC_017263	AGA	2	6	15548	15553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384412652
113	NC_017263	A	6	6	15573	15578	100 %	0 %	0 %	0 %	384412652
114	NC_017263	TAT	2	6	16015	16020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384412653
115	NC_017263	CTG	2	6	16053	16058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412653
116	NC_017263	TTG	2	6	16170	16175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412653
117	NC_017263	A	6	6	16177	16182	100 %	0 %	0 %	0 %	384412653
118	NC_017263	GTT	2	6	17129	17134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412655
119	NC_017263	ACA	2	6	17555	17560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384412656
120	NC_017263	TCAA	2	8	17606	17613	50 %	25 %	0 %	25 %	384412656
121	NC_017263	GCA	2	6	17681	17686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412656
122	NC_017263	CTT	2	6	17700	17705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384412656
123	NC_017263	TGA	2	6	17735	17740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412656
124	NC_017263	AAT	2	6	17834	17839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384412656
125	NC_017263	CT	3	6	17893	17898	0 %	50 %	0 %	50 %	384412656
126	NC_017263	TGC	2	6	17930	17935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384412656
127	NC_017263	GTT	2	6	17952	17957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384412656
128	NC_017263	AGC	2	6	18049	18054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412656
129	NC_017263	ATG	2	6	18056	18061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412656
130	NC_017263	ACC	2	6	18068	18073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384412656
131	NC_017263	ATC	2	6	18083	18088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412656
132	NC_017263	TAG	2	6	18138	18143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412656
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254	NC_017263	CGG	2	6	43929	43934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384412667
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391	NC_017263	CTTA	2	8	59691	59698	25 %	50 %	0 %	25 %	384412683
392	NC_017263	CGC	2	6	60844	60849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412684
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394	NC_017263	TG	3	6	60952	60957	0 %	50 %	50 %	0 %	384412684
395	NC_017263	GAT	2	6	60958	60963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412684
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398	NC_017263	ATC	2	6	61161	61166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412685
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402	NC_017263	CGA	2	6	61462	61467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412685
403	NC_017263	TCA	3	9	61474	61482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384412685
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407	NC_017263	AGT	2	6	61567	61572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412685
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411	NC_017263	TGTC	2	8	61820	61827	0 %	50 %	25 %	25 %	384412685
412	NC_017263	CTGC	2	8	61850	61857	0 %	25 %	25 %	50 %	384412685
413	NC_017263	CGC	2	6	62057	62062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384412685
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