MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_017168	GCC	2	6	1281552	1281557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384138173
21002	NC_017168	ACCGC	2	10	1281561	1281570	20 %	0 %	20 %	60 %	384138173
21003	NC_017168	AAC	2	6	1281634	1281639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384138173
21004	NC_017168	CCA	2	6	1281712	1281717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384138173
21005	NC_017168	GC	3	6	1281772	1281777	0 %	0 %	50 %	50 %	384138173
21006	NC_017168	CCA	2	6	1282045	1282050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384138173
21007	NC_017168	CAG	2	6	1282068	1282073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138173
21008	NC_017168	GC	3	6	1282103	1282108	0 %	0 %	50 %	50 %	384138173
21009	NC_017168	CCGC	2	8	1282109	1282116	0 %	0 %	25 %	75 %	384138173
21010	NC_017168	AGA	3	9	1282121	1282129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384138173
21011	NC_017168	TAT	2	6	1282200	1282205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138173
21012	NC_017168	GAAACA	2	12	1282211	1282222	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384138173
21013	NC_017168	TGA	2	6	1282241	1282246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138173
21014	NC_017168	GTG	2	6	1282278	1282283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138173
21015	NC_017168	GTG	2	6	1282299	1282304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138173
21016	NC_017168	ATG	2	6	1282339	1282344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138173
21017	NC_017168	CTT	2	6	1282370	1282375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384138173
21018	NC_017168	TTTG	2	8	1282379	1282386	0 %	75 %	25 %	0 %	384138173
21019	NC_017168	GC	3	6	1282431	1282436	0 %	0 %	50 %	50 %	384138173
21020	NC_017168	TGGA	2	8	1282458	1282465	25 %	25 %	50 %	0 %	384138173
21021	NC_017168	GTAG	2	8	1282473	1282480	25 %	25 %	50 %	0 %	384138173
21022	NC_017168	GGC	2	6	1282551	1282556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384138173
21023	NC_017168	ACC	2	6	1282587	1282592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384138173
21024	NC_017168	CAT	2	6	1282620	1282625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138173
21025	NC_017168	ACT	2	6	1282799	1282804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138173
21026	NC_017168	GGC	2	6	1282805	1282810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384138173
21027	NC_017168	GGC	2	6	1282823	1282828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384138173
21028	NC_017168	GTT	2	6	1282829	1282834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384138173
21029	NC_017168	A	6	6	1282935	1282940	100 %	0 %	0 %	0 %	384138173
21030	NC_017168	TTA	2	6	1283024	1283029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138173
21031	NC_017168	CGG	2	6	1283056	1283061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384138173
21032	NC_017168	GAA	3	9	1283079	1283087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384138173
21033	NC_017168	TCCT	2	8	1283115	1283122	0 %	50 %	0 %	50 %	384138173
21034	NC_017168	ACA	2	6	1283125	1283130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384138173
21035	NC_017168	TAT	2	6	1283263	1283268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138174
21036	NC_017168	GGC	2	6	1283406	1283411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384138174
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21038	NC_017168	A	6	6	1283502	1283507	100 %	0 %	0 %	0 %	384138174
21039	NC_017168	GTG	2	6	1283523	1283528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138174
21040	NC_017168	GGC	2	6	1283567	1283572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384138174
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21042	NC_017168	GAT	2	6	1283628	1283633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138174
21043	NC_017168	TTA	2	6	1283694	1283699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138174
21044	NC_017168	TGG	2	6	1283722	1283727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138174
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21046	NC_017168	A	6	6	1283782	1283787	100 %	0 %	0 %	0 %	384138174
21047	NC_017168	A	6	6	1283799	1283804	100 %	0 %	0 %	0 %	384138174
21048	NC_017168	TGG	2	6	1283827	1283832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138174
21049	NC_017168	ATG	2	6	1283842	1283847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138174
21050	NC_017168	CCCG	2	8	1283865	1283872	0 %	0 %	25 %	75 %	384138174
21051	NC_017168	CCA	2	6	1283881	1283886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384138174
21052	NC_017168	GTG	3	9	1283892	1283900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138174
21053	NC_017168	TGGC	2	8	1283926	1283933	0 %	25 %	50 %	25 %	384138174
21054	NC_017168	GGC	2	6	1283945	1283950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384138174
21055	NC_017168	CGC	3	9	1283998	1284006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384138174
21056	NC_017168	TGCC	2	8	1284125	1284132	0 %	25 %	25 %	50 %	384138175
21057	NC_017168	ATC	2	6	1284143	1284148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138175
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21059	NC_017168	TGC	2	6	1284218	1284223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138175
21060	NC_017168	CGGT	2	8	1284272	1284279	0 %	25 %	50 %	25 %	384138175
21061	NC_017168	ATCT	2	8	1284301	1284308	25 %	50 %	0 %	25 %	384138175
21062	NC_017168	GGT	2	6	1284349	1284354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138175
21063	NC_017168	CTGGCA	2	12	1284365	1284376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384138175
21064	NC_017168	TAT	2	6	1284387	1284392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138175
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21066	NC_017168	ATT	2	6	1284442	1284447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138175
21067	NC_017168	ATA	2	6	1284461	1284466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384138175
21068	NC_017168	TCA	2	6	1284467	1284472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138175
21069	NC_017168	GCC	2	6	1284481	1284486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384138175
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21071	NC_017168	GCC	2	6	1284619	1284624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384138175
21072	NC_017168	GTGG	2	8	1284661	1284668	0 %	25 %	75 %	0 %	384138175
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21081	NC_017168	ATA	2	6	1285012	1285017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384138175
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21083	NC_017168	CTG	2	6	1285080	1285085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138175
21084	NC_017168	AAT	2	6	1285166	1285171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384138175
21085	NC_017168	TAT	2	6	1285257	1285262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138175
21086	NC_017168	TGAC	2	8	1285282	1285289	25 %	25 %	25 %	25 %	384138175
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21088	NC_017168	TTTA	2	8	1285653	1285660	25 %	75 %	0 %	0 %	384138176
21089	NC_017168	TTGC	2	8	1285736	1285743	0 %	50 %	25 %	25 %	384138176
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21101	NC_017168	GCC	2	6	1286483	1286488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384138176
21102	NC_017168	TCA	2	6	1286548	1286553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138176
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21104	NC_017168	GCTGA	2	10	1286742	1286751	20 %	20 %	40 %	20 %	384138176
21105	NC_017168	ATC	2	6	1286792	1286797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138176
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21107	NC_017168	TCA	2	6	1286998	1287003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138176
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21109	NC_017168	GC	3	6	1287323	1287328	0 %	0 %	50 %	50 %	384138177
21110	NC_017168	TGA	3	9	1287357	1287365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138177
21111	NC_017168	CA	3	6	1287367	1287372	50 %	0 %	0 %	50 %	384138177
21112	NC_017168	TG	3	6	1287493	1287498	0 %	50 %	50 %	0 %	384138177
21113	NC_017168	TTC	2	6	1287500	1287505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384138177
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21115	NC_017168	CCA	2	6	1287634	1287639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384138177
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21117	NC_017168	TG	4	8	1288433	1288440	0 %	50 %	50 %	0 %	384138178
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