MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_017168	CAG	2	6	1124719	1124724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138035
18503	NC_017168	GCA	2	6	1124880	1124885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138035
18504	NC_017168	GCT	2	6	1124887	1124892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138035
18505	NC_017168	ACG	2	6	1124965	1124970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138035
18506	NC_017168	ACAG	2	8	1124982	1124989	50 %	0 %	25 %	25 %	384138035
18507	NC_017168	TAAA	2	8	1125122	1125129	75 %	25 %	0 %	0 %	384138036
18508	NC_017168	G	7	7	1125189	1125195	0 %	0 %	100 %	0 %	384138036
18509	NC_017168	TGG	2	6	1125197	1125202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138036
18510	NC_017168	AAC	2	6	1125203	1125208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384138036
18511	NC_017168	ATG	2	6	1125292	1125297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138036
18512	NC_017168	TGA	2	6	1125309	1125314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138036
18513	NC_017168	TG	3	6	1125319	1125324	0 %	50 %	50 %	0 %	384138036
18514	NC_017168	CAT	2	6	1125327	1125332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138036
18515	NC_017168	TC	3	6	1125455	1125460	0 %	50 %	0 %	50 %	384138036
18516	NC_017168	ATG	2	6	1125524	1125529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138036
18517	NC_017168	GGAT	2	8	1125548	1125555	25 %	25 %	50 %	0 %	384138036
18518	NC_017168	TGA	2	6	1125629	1125634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138036
18519	NC_017168	AT	3	6	1125636	1125641	50 %	50 %	0 %	0 %	384138036
18520	NC_017168	GT	3	6	1125668	1125673	0 %	50 %	50 %	0 %	384138036
18521	NC_017168	TCT	2	6	1125743	1125748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384138036
18522	NC_017168	TGG	2	6	1125780	1125785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138036
18523	NC_017168	TGA	2	6	1125786	1125791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138036
18524	NC_017168	CT	3	6	1125805	1125810	0 %	50 %	0 %	50 %	384138036
18525	NC_017168	ATA	2	6	1125825	1125830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384138036
18526	NC_017168	ATT	2	6	1126240	1126245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138037
18527	NC_017168	ATGTT	2	10	1126266	1126275	20 %	60 %	20 %	0 %	384138037
18528	NC_017168	AAAG	2	8	1126279	1126286	75 %	0 %	25 %	0 %	384138037
18529	NC_017168	TAA	2	6	1126294	1126299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384138037
18530	NC_017168	TTC	2	6	1126306	1126311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384138037
18531	NC_017168	TAT	2	6	1126384	1126389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138037
18532	NC_017168	TGGTG	2	10	1126447	1126456	0 %	40 %	60 %	0 %	384138037
18533	NC_017168	ATC	2	6	1126466	1126471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138037
18534	NC_017168	C	6	6	1126530	1126535	0 %	0 %	0 %	100 %	384138037
18535	NC_017168	TGA	2	6	1126576	1126581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138037
18536	NC_017168	TCAA	2	8	1126637	1126644	50 %	25 %	0 %	25 %	384138037
18537	NC_017168	TTG	2	6	1126659	1126664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384138037
18538	NC_017168	GAA	2	6	1126682	1126687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384138037
18539	NC_017168	AGCCA	2	10	1126711	1126720	40 %	0 %	20 %	40 %	384138037
18540	NC_017168	TAAAGC	2	12	1126741	1126752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384138037
18541	NC_017168	CAGCA	2	10	1126772	1126781	40 %	0 %	20 %	40 %	384138037
18542	NC_017168	A	8	8	1127035	1127042	100 %	0 %	0 %	0 %	384138038
18543	NC_017168	GAT	2	6	1127111	1127116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138038
18544	NC_017168	CAAG	2	8	1127119	1127126	50 %	0 %	25 %	25 %	384138038
18545	NC_017168	C	6	6	1127161	1127166	0 %	0 %	0 %	100 %	384138038
18546	NC_017168	TGG	2	6	1127199	1127204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138038
18547	NC_017168	A	6	6	1127306	1127311	100 %	0 %	0 %	0 %	384138038
18548	NC_017168	TGC	2	6	1127323	1127328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138038
18549	NC_017168	TGA	2	6	1127344	1127349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138038
18550	NC_017168	GAT	2	6	1127531	1127536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138038
18551	NC_017168	GAT	2	6	1127591	1127596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138038
18552	NC_017168	CTG	2	6	1127612	1127617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138038
18553	NC_017168	CAG	2	6	1127721	1127726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138038
18554	NC_017168	GTG	2	6	1127823	1127828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138038
18555	NC_017168	CAT	2	6	1128061	1128066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138039
18556	NC_017168	CTGA	2	8	1128067	1128074	25 %	25 %	25 %	25 %	384138039
18557	NC_017168	TTGG	2	8	1128098	1128105	0 %	50 %	50 %	0 %	384138039
18558	NC_017168	T	6	6	1128117	1128122	0 %	100 %	0 %	0 %	384138039
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18564	NC_017168	CTGGC	2	10	1128370	1128379	0 %	20 %	40 %	40 %	384138039
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18569	NC_017168	ATT	2	6	1128595	1128600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138039
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18591	NC_017168	GGTT	2	8	1129672	1129679	0 %	50 %	50 %	0 %	384138041
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18606	NC_017168	TGG	3	9	1131037	1131045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138042
18607	NC_017168	G	6	6	1131091	1131096	0 %	0 %	100 %	0 %	384138042
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18611	NC_017168	TGG	2	6	1131256	1131261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138042
18612	NC_017168	TAT	2	6	1131314	1131319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138042
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18614	NC_017168	CCA	2	6	1131432	1131437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384138042
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18616	NC_017168	ATTG	2	8	1131548	1131555	25 %	50 %	25 %	0 %	384138042
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