MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_017168	ATG	2	6	1095999	1096004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138009
18003	NC_017168	CAT	2	6	1096025	1096030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138009
18004	NC_017168	CA	3	6	1096046	1096051	50 %	0 %	0 %	50 %	384138009
18005	NC_017168	TGC	2	6	1096054	1096059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138009
18006	NC_017168	CCT	2	6	1096120	1096125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384138009
18007	NC_017168	TTGCA	2	10	1096126	1096135	20 %	40 %	20 %	20 %	384138009
18008	NC_017168	GAT	3	9	1096157	1096165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138009
18009	NC_017168	CAA	2	6	1096287	1096292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384138009
18010	NC_017168	ATG	2	6	1096342	1096347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138009
18011	NC_017168	ATC	2	6	1096418	1096423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138009
18012	NC_017168	A	6	6	1096485	1096490	100 %	0 %	0 %	0 %	384138009
18013	NC_017168	AAT	2	6	1096509	1096514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384138009
18014	NC_017168	ATT	2	6	1096589	1096594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138010
18015	NC_017168	CCA	3	9	1096620	1096628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384138010
18016	NC_017168	AAT	2	6	1096661	1096666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384138010
18017	NC_017168	AAG	2	6	1096756	1096761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384138011
18018	NC_017168	ATGGA	2	10	1096781	1096790	40 %	20 %	40 %	0 %	384138011
18019	NC_017168	GCC	2	6	1096822	1096827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384138011
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18021	NC_017168	AAT	2	6	1096885	1096890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384138011
18022	NC_017168	GCA	2	6	1096912	1096917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138011
18023	NC_017168	TTTACC	2	12	1096956	1096967	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384138011
18024	NC_017168	TGA	2	6	1097003	1097008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138011
18025	NC_017168	GCT	2	6	1097044	1097049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138011
18026	NC_017168	CAT	3	9	1097057	1097065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138011
18027	NC_017168	TAA	2	6	1097136	1097141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384138011
18028	NC_017168	CGGG	2	8	1097158	1097165	0 %	0 %	75 %	25 %	384138011
18029	NC_017168	TGC	2	6	1097194	1097199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138011
18030	NC_017168	GCG	2	6	1097234	1097239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384138011
18031	NC_017168	TTG	3	9	1097277	1097285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384138011
18032	NC_017168	GCG	2	6	1097289	1097294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384138011
18033	NC_017168	ATC	2	6	1097466	1097471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138011
18034	NC_017168	CA	3	6	1097478	1097483	50 %	0 %	0 %	50 %	384138011
18035	NC_017168	CAG	2	6	1097516	1097521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138011
18036	NC_017168	CTG	2	6	1097565	1097570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138011
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18038	NC_017168	TG	3	6	1097868	1097873	0 %	50 %	50 %	0 %	384138012
18039	NC_017168	AGC	2	6	1097874	1097879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384138012
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18041	NC_017168	TCT	2	6	1097922	1097927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384138012
18042	NC_017168	GTG	2	6	1098024	1098029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384138012
18043	NC_017168	T	6	6	1098128	1098133	0 %	100 %	0 %	0 %	384138012
18044	NC_017168	TGGG	2	8	1098379	1098386	0 %	25 %	75 %	0 %	384138013
18045	NC_017168	AATA	2	8	1098431	1098438	75 %	25 %	0 %	0 %	384138013
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18049	NC_017168	CAACA	2	10	1098689	1098698	60 %	0 %	0 %	40 %	384138013
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18051	NC_017168	CATT	2	8	1098754	1098761	25 %	50 %	0 %	25 %	384138013
18052	NC_017168	CCG	2	6	1098778	1098783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384138013
18053	NC_017168	ATC	2	6	1098825	1098830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384138013
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18062	NC_017168	AT	4	8	1099194	1099201	50 %	50 %	0 %	0 %	384138013
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18091	NC_017168	TGA	2	6	1101106	1101111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384138014
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18117	NC_017168	CAA	2	6	1101995	1102000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384138014
18118	NC_017168	CAA	3	9	1102010	1102018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384138014
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18222	NC_017168	CT	3	6	1108194	1108199	0 %	50 %	0 %	50 %	384138020
18223	NC_017168	GCT	2	6	1108263	1108268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138020
18224	NC_017168	TTG	2	6	1108456	1108461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384138020
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18230	NC_017168	ATT	2	6	1108777	1108782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384138020
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18233	NC_017168	G	6	6	1109590	1109595	0 %	0 %	100 %	0 %	384138021
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18252	NC_017168	CTG	2	6	1110782	1110787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384138023
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18468	NC_017168	TTG	2	6	1122782	1122787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384138033
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