MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017168	CGC	2	6	961377	961382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137888
16003	NC_017168	GCA	2	6	961404	961409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137888
16004	NC_017168	CGC	2	6	961411	961416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137888
16005	NC_017168	CGGG	2	8	961462	961469	0 %	0 %	75 %	25 %	384137888
16006	NC_017168	AAC	2	6	961514	961519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137888
16007	NC_017168	TG	3	6	961577	961582	0 %	50 %	50 %	0 %	384137888
16008	NC_017168	CAG	2	6	961600	961605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137888
16009	NC_017168	CAAT	2	8	961709	961716	50 %	25 %	0 %	25 %	384137888
16010	NC_017168	CCA	2	6	961807	961812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137888
16011	NC_017168	ATG	2	6	961888	961893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137888
16012	NC_017168	TC	3	6	961902	961907	0 %	50 %	0 %	50 %	384137888
16013	NC_017168	GGA	2	6	961914	961919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137888
16014	NC_017168	CGC	2	6	961938	961943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137888
16015	NC_017168	CAT	2	6	962082	962087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137888
16016	NC_017168	CGC	2	6	962139	962144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137888
16017	NC_017168	TTC	2	6	962149	962154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137888
16018	NC_017168	TCT	2	6	962177	962182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137888
16019	NC_017168	GTG	2	6	962249	962254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137888
16020	NC_017168	TTA	2	6	962314	962319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137888
16021	NC_017168	GGC	2	6	962392	962397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137888
16022	NC_017168	TCAG	2	8	962458	962465	25 %	25 %	25 %	25 %	384137888
16023	NC_017168	AAG	2	6	962555	962560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137888
16024	NC_017168	CCG	2	6	962591	962596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137888
16025	NC_017168	TGA	2	6	962664	962669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137888
16026	NC_017168	TGCT	2	8	962708	962715	0 %	50 %	25 %	25 %	384137888
16027	NC_017168	ATG	2	6	962770	962775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137888
16028	NC_017168	TGC	2	6	962825	962830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137888
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16030	NC_017168	GGC	2	6	962952	962957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137888
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16033	NC_017168	TGC	2	6	963094	963099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137888
16034	NC_017168	AGT	2	6	963103	963108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137888
16035	NC_017168	GCA	2	6	963110	963115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137888
16036	NC_017168	AGCC	2	8	963215	963222	25 %	0 %	25 %	50 %	384137889
16037	NC_017168	ATA	2	6	963617	963622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137890
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16039	NC_017168	TCT	2	6	963712	963717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137890
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16041	NC_017168	GCTTCT	2	12	963729	963740	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384137890
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16050	NC_017168	CCAG	2	8	964192	964199	25 %	0 %	25 %	50 %	384137891
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16052	NC_017168	C	6	6	964236	964241	0 %	0 %	0 %	100 %	384137891
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16056	NC_017168	AC	3	6	964477	964482	50 %	0 %	0 %	50 %	384137891
16057	NC_017168	CTGG	2	8	964484	964491	0 %	25 %	50 %	25 %	384137891
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16059	NC_017168	ACC	2	6	964529	964534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137891
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16479	NC_017168	GGT	2	6	993370	993375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137913
16480	NC_017168	TTG	2	6	993443	993448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137913
16481	NC_017168	GCT	2	6	993529	993534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137913
16482	NC_017168	TTC	2	6	993586	993591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137913
16483	NC_017168	TAT	2	6	993624	993629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137913
16484	NC_017168	CTGA	2	8	993813	993820	25 %	25 %	25 %	25 %	384137914
16485	NC_017168	CA	3	6	993845	993850	50 %	0 %	0 %	50 %	384137914
16486	NC_017168	C	6	6	993879	993884	0 %	0 %	0 %	100 %	384137914
16487	NC_017168	CAC	3	9	993894	993902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137914
16488	NC_017168	CGC	2	6	993981	993986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137914
16489	NC_017168	CTG	2	6	994053	994058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137914
16490	NC_017168	GCATT	2	10	994088	994097	20 %	40 %	20 %	20 %	384137914
16491	NC_017168	ATT	2	6	994224	994229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137914
16492	NC_017168	CCGATA	2	12	994280	994291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384137914
16493	NC_017168	TAC	2	6	994331	994336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137914
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16495	NC_017168	TTA	2	6	994988	994993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137915
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16497	NC_017168	TTG	2	6	995083	995088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137915
16498	NC_017168	AGAT	2	8	995113	995120	50 %	25 %	25 %	0 %	384137915
16499	NC_017168	AGC	2	6	995446	995451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137916
16500	NC_017168	CCG	2	6	995463	995468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137916

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