MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_017168	TGC	2	6	3564447	3564452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
57002	NC_017168	C	7	7	3564482	3564488	0 %	0 %	0 %	100 %	384140257
57003	NC_017168	GCT	2	6	3564499	3564504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
57004	NC_017168	CGC	2	6	3564516	3564521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140257
57005	NC_017168	CTT	2	6	3564624	3564629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384140257
57006	NC_017168	ATT	2	6	3564632	3564637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384140257
57007	NC_017168	GTT	2	6	3564694	3564699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140257
57008	NC_017168	GCC	2	6	3564748	3564753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140257
57009	NC_017168	AGC	2	6	3564759	3564764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140257
57010	NC_017168	AACA	2	8	3564794	3564801	75 %	0 %	0 %	25 %	384140257
57011	NC_017168	CTG	2	6	3564832	3564837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
57012	NC_017168	GC	3	6	3564896	3564901	0 %	0 %	50 %	50 %	384140257
57013	NC_017168	ATG	2	6	3564911	3564916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
57014	NC_017168	GTGC	2	8	3564922	3564929	0 %	25 %	50 %	25 %	384140257
57015	NC_017168	GTA	2	6	3564974	3564979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
57016	NC_017168	GAT	2	6	3565047	3565052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
57017	NC_017168	ACTG	2	8	3565068	3565075	25 %	25 %	25 %	25 %	384140257
57018	NC_017168	TGT	2	6	3565092	3565097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140257
57019	NC_017168	GTT	2	6	3565127	3565132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140257
57020	NC_017168	GAT	2	6	3565159	3565164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
57021	NC_017168	GTG	2	6	3565193	3565198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384140257
57022	NC_017168	TTGA	2	8	3565396	3565403	25 %	50 %	25 %	0 %	384140257
57023	NC_017168	TGA	2	6	3565416	3565421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
57024	NC_017168	AAG	2	6	3565430	3565435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384140257
57025	NC_017168	TGT	2	6	3565455	3565460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140257
57026	NC_017168	TGA	2	6	3565548	3565553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
57027	NC_017168	TGG	2	6	3565644	3565649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384140257
57028	NC_017168	GGC	2	6	3565681	3565686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384140257
57029	NC_017168	TTGTAT	2	12	3565690	3565701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384140257
57030	NC_017168	CTG	2	6	3565705	3565710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
57031	NC_017168	GCC	2	6	3565715	3565720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140257
57032	NC_017168	GAC	2	6	3565723	3565728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140257
57033	NC_017168	CAA	2	6	3565768	3565773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140257
57034	NC_017168	GCT	2	6	3565794	3565799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
57035	NC_017168	CG	3	6	3565810	3565815	0 %	0 %	50 %	50 %	384140257
57036	NC_017168	AAC	3	9	3565835	3565843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140257
57037	NC_017168	CT	3	6	3565859	3565864	0 %	50 %	0 %	50 %	384140257
57038	NC_017168	CT	3	6	3565878	3565883	0 %	50 %	0 %	50 %	384140257
57039	NC_017168	CTG	2	6	3565945	3565950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
57040	NC_017168	TATC	2	8	3566154	3566161	25 %	50 %	0 %	25 %	384140257
57041	NC_017168	ACGC	2	8	3566181	3566188	25 %	0 %	25 %	50 %	384140257
57042	NC_017168	GTG	2	6	3566246	3566251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384140257
57043	NC_017168	CTG	2	6	3566263	3566268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140257
57044	NC_017168	TTA	2	6	3566275	3566280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384140257
57045	NC_017168	CATT	2	8	3566287	3566294	25 %	50 %	0 %	25 %	384140257
57046	NC_017168	TGG	2	6	3566316	3566321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384140257
57047	NC_017168	TGA	2	6	3566333	3566338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140257
57048	NC_017168	GTAAA	2	10	3566616	3566625	60 %	20 %	20 %	0 %	384140258
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57050	NC_017168	TGAA	2	8	3566810	3566817	50 %	25 %	25 %	0 %	384140259
57051	NC_017168	ACA	2	6	3566824	3566829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140259
57052	NC_017168	GGT	2	6	3566839	3566844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384140259
57053	NC_017168	AAT	2	6	3566845	3566850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384140259
57054	NC_017168	A	7	7	3566864	3566870	100 %	0 %	0 %	0 %	384140259
57055	NC_017168	ATCA	2	8	3566978	3566985	50 %	25 %	0 %	25 %	384140259
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57058	NC_017168	AG	3	6	3567103	3567108	50 %	0 %	50 %	0 %	384140259
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57060	NC_017168	T	8	8	3567186	3567193	0 %	100 %	0 %	0 %	384140260
57061	NC_017168	CAA	2	6	3567203	3567208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140260
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57066	NC_017168	A	6	6	3567441	3567446	100 %	0 %	0 %	0 %	384140260
57067	NC_017168	AAG	2	6	3567471	3567476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384140260
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57070	NC_017168	CAG	2	6	3567813	3567818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140262
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57072	NC_017168	CAA	2	6	3567904	3567909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384140262
57073	NC_017168	CACC	2	8	3568030	3568037	25 %	0 %	0 %	75 %	384140262
57074	NC_017168	AGGT	2	8	3568057	3568064	25 %	25 %	50 %	0 %	384140262
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57083	NC_017168	AAT	2	6	3568469	3568474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384140262
57084	NC_017168	CCA	2	6	3568477	3568482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140262
57085	NC_017168	CAC	2	6	3568486	3568491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140262
57086	NC_017168	GCA	2	6	3568516	3568521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140262
57087	NC_017168	T	6	6	3568550	3568555	0 %	100 %	0 %	0 %	384140262
57088	NC_017168	GCC	2	6	3568664	3568669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140263
57089	NC_017168	GTGAT	2	10	3568698	3568707	20 %	40 %	40 %	0 %	384140263
57090	NC_017168	AG	3	6	3568754	3568759	50 %	0 %	50 %	0 %	384140263
57091	NC_017168	CCTG	2	8	3568814	3568821	0 %	25 %	25 %	50 %	384140263
57092	NC_017168	TGCC	2	8	3568843	3568850	0 %	25 %	25 %	50 %	384140263
57093	NC_017168	CGC	2	6	3568909	3568914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140263
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57107	NC_017168	CATCC	2	10	3569763	3569772	20 %	20 %	0 %	60 %	384140264
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