MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 73005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_017168	TGAG	2	8	3467038	3467045	25 %	25 %	50 %	0 %	384140148
55502	NC_017168	GCG	2	6	3467052	3467057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384140148
55503	NC_017168	GTT	2	6	3467096	3467101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140148
55504	NC_017168	TAT	2	6	3467162	3467167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384140148
55505	NC_017168	AGC	2	6	3467245	3467250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140148
55506	NC_017168	CTG	2	6	3467253	3467258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140148
55507	NC_017168	CTT	2	6	3467344	3467349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384140148
55508	NC_017168	GGC	2	6	3467363	3467368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384140148
55509	NC_017168	TTAC	2	8	3467508	3467515	25 %	50 %	0 %	25 %	384140149
55510	NC_017168	CA	3	6	3467790	3467795	50 %	0 %	0 %	50 %	384140149
55511	NC_017168	GA	3	6	3468167	3468172	50 %	0 %	50 %	0 %	384140150
55512	NC_017168	TTAC	2	8	3468448	3468455	25 %	50 %	0 %	25 %	384140151
55513	NC_017168	ATC	2	6	3468487	3468492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140151
55514	NC_017168	AACC	2	8	3468606	3468613	50 %	0 %	0 %	50 %	384140151
55515	NC_017168	ACG	2	6	3468649	3468654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140151
55516	NC_017168	CCA	2	6	3468656	3468661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140151
55517	NC_017168	ACC	2	6	3468767	3468772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140151
55518	NC_017168	CTT	2	6	3468831	3468836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384140151
55519	NC_017168	T	6	6	3468886	3468891	0 %	100 %	0 %	0 %	384140151
55520	NC_017168	TGA	2	6	3468897	3468902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140151
55521	NC_017168	CTGG	2	8	3469000	3469007	0 %	25 %	50 %	25 %	384140151
55522	NC_017168	CTT	2	6	3469074	3469079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384140151
55523	NC_017168	GAAT	2	8	3469100	3469107	50 %	25 %	25 %	0 %	384140151
55524	NC_017168	GAA	2	6	3469109	3469114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384140151
55525	NC_017168	ACC	2	6	3469231	3469236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140151
55526	NC_017168	ATCTTC	2	12	3469698	3469709	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384140152
55527	NC_017168	GAA	2	6	3469826	3469831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384140152
55528	NC_017168	TTGA	2	8	3470043	3470050	25 %	50 %	25 %	0 %	384140152
55529	NC_017168	GGCA	2	8	3470055	3470062	25 %	0 %	50 %	25 %	384140152
55530	NC_017168	CAT	2	6	3470075	3470080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140152
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55532	NC_017168	GCT	2	6	3470087	3470092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140152
55533	NC_017168	CAGC	2	8	3470111	3470118	25 %	0 %	25 %	50 %	384140152
55534	NC_017168	CA	3	6	3470162	3470167	50 %	0 %	0 %	50 %	384140152
55535	NC_017168	TTA	2	6	3470176	3470181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384140152
55536	NC_017168	CAG	2	6	3470219	3470224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140153
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55538	NC_017168	ATA	2	6	3470352	3470357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384140153
55539	NC_017168	TCAG	2	8	3470373	3470380	25 %	25 %	25 %	25 %	384140153
55540	NC_017168	CAG	2	6	3470447	3470452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140153
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55542	NC_017168	GTA	2	6	3470530	3470535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140153
55543	NC_017168	CAC	2	6	3470555	3470560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140153
55544	NC_017168	ATT	2	6	3470702	3470707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384140154
55545	NC_017168	CTG	2	6	3470777	3470782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140154
55546	NC_017168	CCG	2	6	3470808	3470813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140154
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55549	NC_017168	CA	3	6	3471015	3471020	50 %	0 %	0 %	50 %	384140154
55550	NC_017168	TATC	2	8	3471022	3471029	25 %	50 %	0 %	25 %	384140154
55551	NC_017168	CCA	2	6	3471202	3471207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140154
55552	NC_017168	AGT	2	6	3471342	3471347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384140154
55553	NC_017168	GCC	2	6	3471468	3471473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384140154
55554	NC_017168	TCA	2	6	3471590	3471595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140155
55555	NC_017168	TACGGT	2	12	3471657	3471668	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384140155
55556	NC_017168	CAG	2	6	3471738	3471743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140155
55557	NC_017168	CG	3	6	3471752	3471757	0 %	0 %	50 %	50 %	384140155
55558	NC_017168	TGC	2	6	3471791	3471796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140155
55559	NC_017168	CCA	2	6	3471816	3471821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384140155
55560	NC_017168	GGT	2	6	3471862	3471867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384140155
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55567	NC_017168	TCA	3	9	3472259	3472267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384140155
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55587	NC_017168	GC	3	6	3473280	3473285	0 %	0 %	50 %	50 %	384140156
55588	NC_017168	AAT	2	6	3473317	3473322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384140156
55589	NC_017168	GCA	2	6	3473371	3473376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384140156
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55606	NC_017168	GTT	2	6	3474689	3474694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384140157
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55613	NC_017168	CG	3	6	3475041	3475046	0 %	0 %	50 %	50 %	384140158
55614	NC_017168	TGC	2	6	3475054	3475059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384140158
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