MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017154	CGT	2	6	228572	228577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120789
3502	NC_017154	CAA	2	6	228602	228607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120789
3503	NC_017154	GTC	2	6	228609	228614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120789
3504	NC_017154	GCA	2	6	228623	228628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120789
3505	NC_017154	CA	3	6	228634	228639	50 %	0 %	0 %	50 %	384120789
3506	NC_017154	CAT	2	6	228720	228725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120789
3507	NC_017154	GAC	2	6	228757	228762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120789
3508	NC_017154	ATC	2	6	228821	228826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120789
3509	NC_017154	TTC	2	6	228827	228832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120789
3510	NC_017154	TCT	2	6	228837	228842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120789
3511	NC_017154	CAG	2	6	228873	228878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120789
3512	NC_017154	GAA	2	6	228886	228891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120789
3513	NC_017154	TCGGCA	2	12	229546	229557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384120790
3514	NC_017154	TGC	2	6	229583	229588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120790
3515	NC_017154	CGT	2	6	229686	229691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120790
3516	NC_017154	TCG	2	6	229751	229756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120790
3517	NC_017154	AAT	2	6	229831	229836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120790
3518	NC_017154	AAT	2	6	229848	229853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120791
3519	NC_017154	AAGA	2	8	229887	229894	75 %	0 %	25 %	0 %	384120791
3520	NC_017154	CTT	2	6	229925	229930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120791
3521	NC_017154	CAA	2	6	229932	229937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120791
3522	NC_017154	TTGGG	2	10	229975	229984	0 %	40 %	60 %	0 %	384120791
3523	NC_017154	CAG	2	6	229988	229993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120791
3524	NC_017154	GCA	2	6	230047	230052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120791
3525	NC_017154	GCGCT	2	10	230055	230064	0 %	20 %	40 %	40 %	384120791
3526	NC_017154	CTA	2	6	230135	230140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120791
3527	NC_017154	GTC	2	6	230213	230218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120791
3528	NC_017154	CGT	2	6	230308	230313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120792
3529	NC_017154	CG	3	6	230347	230352	0 %	0 %	50 %	50 %	384120792
3530	NC_017154	AAC	2	6	230375	230380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120792
3531	NC_017154	GTCT	2	8	230411	230418	0 %	50 %	25 %	25 %	384120792
3532	NC_017154	ACT	2	6	230492	230497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120792
3533	NC_017154	AGC	2	6	230505	230510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120792
3534	NC_017154	GTC	2	6	230558	230563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120792
3535	NC_017154	GTT	2	6	230656	230661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120792
3536	NC_017154	CTT	2	6	230669	230674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120792
3537	NC_017154	GCTG	2	8	230751	230758	0 %	25 %	50 %	25 %	384120792
3538	NC_017154	GT	3	6	230810	230815	0 %	50 %	50 %	0 %	384120792
3539	NC_017154	TCG	2	6	230870	230875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120792
3540	NC_017154	ACGC	2	8	230981	230988	25 %	0 %	25 %	50 %	384120793
3541	NC_017154	TAC	2	6	231108	231113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120793
3542	NC_017154	AAG	2	6	231129	231134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120793
3543	NC_017154	ATG	2	6	231267	231272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120793
3544	NC_017154	GCA	2	6	231295	231300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120793
3545	NC_017154	CGTGGT	2	12	231359	231370	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384120793
3546	NC_017154	ATTC	2	8	231392	231399	25 %	50 %	0 %	25 %	384120793
3547	NC_017154	GAA	2	6	231401	231406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120793
3548	NC_017154	GTC	2	6	231423	231428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120793
3549	NC_017154	TAG	2	6	231432	231437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120793
3550	NC_017154	AGC	2	6	231481	231486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120793
3551	NC_017154	CGAT	2	8	231546	231553	25 %	25 %	25 %	25 %	384120793
3552	NC_017154	CCG	2	6	231568	231573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120793
3553	NC_017154	AGA	2	6	231646	231651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120793
3554	NC_017154	CGATC	2	10	231664	231673	20 %	20 %	20 %	40 %	384120793
3555	NC_017154	CTG	2	6	231674	231679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120793
3556	NC_017154	A	6	6	231806	231811	100 %	0 %	0 %	0 %	384120793
3557	NC_017154	TCTT	2	8	231850	231857	0 %	75 %	0 %	25 %	384120793
3558	NC_017154	CCA	2	6	231881	231886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120793
3559	NC_017154	GTC	2	6	231967	231972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120794
3560	NC_017154	CAG	2	6	231986	231991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120794
3561	NC_017154	ATC	2	6	232044	232049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120794
3562	NC_017154	GAC	2	6	232052	232057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120794
3563	NC_017154	CGAAAG	2	12	232063	232074	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384120794
3564	NC_017154	GTT	2	6	232086	232091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120794
3565	NC_017154	TCG	2	6	232133	232138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120794
3566	NC_017154	GGT	2	6	232221	232226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120794
3567	NC_017154	AGTT	2	8	232288	232295	25 %	50 %	25 %	0 %	384120794
3568	NC_017154	TGC	2	6	232301	232306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120794
3569	NC_017154	AGT	2	6	232319	232324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120794
3570	NC_017154	TGC	2	6	232325	232330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120794
3571	NC_017154	TAC	2	6	232841	232846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120795
3572	NC_017154	ATG	2	6	232859	232864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120795
3573	NC_017154	GAAC	2	8	232874	232881	50 %	0 %	25 %	25 %	384120795
3574	NC_017154	TGG	2	6	232885	232890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120795
3575	NC_017154	ATT	2	6	232981	232986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120795
3576	NC_017154	CAT	2	6	233009	233014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120795
3577	NC_017154	AG	3	6	233083	233088	50 %	0 %	50 %	0 %	384120795
3578	NC_017154	TTG	2	6	233122	233127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120795
3579	NC_017154	CGA	2	6	233142	233147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120795
3580	NC_017154	AGA	2	6	233188	233193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120795
3581	NC_017154	TTAA	2	8	233195	233202	50 %	50 %	0 %	0 %	384120795
3582	NC_017154	TG	3	6	233613	233618	0 %	50 %	50 %	0 %	384120796
3583	NC_017154	TAA	2	6	233628	233633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120796
3584	NC_017154	TTC	3	9	233691	233699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120796
3585	NC_017154	TTAAC	2	10	233726	233735	40 %	40 %	0 %	20 %	384120796
3586	NC_017154	TAC	2	6	233805	233810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120796
3587	NC_017154	GTG	2	6	233888	233893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120796
3588	NC_017154	ATA	2	6	233899	233904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120796
3589	NC_017154	GCA	2	6	233938	233943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120796
3590	NC_017154	AAT	2	6	233946	233951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120796
3591	NC_017154	GAA	2	6	234165	234170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120797
3592	NC_017154	TTGG	2	8	234176	234183	0 %	50 %	50 %	0 %	384120797
3593	NC_017154	AAC	2	6	234184	234189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120797
3594	NC_017154	T	6	6	234210	234215	0 %	100 %	0 %	0 %	384120797
3595	NC_017154	ATT	2	6	234229	234234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120797
3596	NC_017154	AAT	2	6	234273	234278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120797
3597	NC_017154	C	6	6	234287	234292	0 %	0 %	0 %	100 %	384120797
3598	NC_017154	GTT	2	6	234310	234315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120797
3599	NC_017154	TGG	2	6	234318	234323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120797
3600	NC_017154	TCA	2	6	234370	234375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120797
3601	NC_017154	TGC	2	6	234481	234486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120797
3602	NC_017154	T	6	6	234561	234566	0 %	100 %	0 %	0 %	384120797
3603	NC_017154	ATA	2	6	234598	234603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120797
3604	NC_017154	TCA	3	9	234610	234618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120797
3605	NC_017154	TTC	2	6	234657	234662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120797
3606	NC_017154	ACC	3	9	234813	234821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120797
3607	NC_017154	ACTC	2	8	234863	234870	25 %	25 %	0 %	50 %	384120797
3608	NC_017154	A	6	6	234903	234908	100 %	0 %	0 %	0 %	384120797
3609	NC_017154	TCA	2	6	234913	234918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120797
3610	NC_017154	AAT	2	6	234927	234932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120797
3611	NC_017154	GCC	2	6	235044	235049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120797
3612	NC_017154	TAG	2	6	235051	235056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120797
3613	NC_017154	CTG	2	6	235064	235069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120797
3614	NC_017154	GTT	2	6	235154	235159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120797
3615	NC_017154	TA	3	6	235221	235226	50 %	50 %	0 %	0 %	384120797
3616	NC_017154	AAT	2	6	235267	235272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120797
3617	NC_017154	GGCA	2	8	235286	235293	25 %	0 %	50 %	25 %	384120797
3618	NC_017154	TCA	2	6	235306	235311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120797
3619	NC_017154	TAC	2	6	235392	235397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120797
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3621	NC_017154	TGCCC	2	10	235507	235516	0 %	20 %	20 %	60 %	384120797
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3989	NC_017154	A	6	6	256028	256033	100 %	0 %	0 %	0 %	384120816
3990	NC_017154	ATATA	2	10	256056	256065	60 %	40 %	0 %	0 %	384120816
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3997	NC_017154	GGCG	2	8	256464	256471	0 %	0 %	75 %	25 %	384120816
3998	NC_017154	AACC	2	8	256474	256481	50 %	0 %	0 %	50 %	384120816
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4000	NC_017154	ATT	2	6	256540	256545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120816

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