MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_017154	CCT	2	6	1191865	1191870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121517
19003	NC_017154	CAT	2	6	1191956	1191961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121517
19004	NC_017154	ATT	2	6	1192209	1192214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121518
19005	NC_017154	GCT	2	6	1192259	1192264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121518
19006	NC_017154	GC	3	6	1192335	1192340	0 %	0 %	50 %	50 %	384121518
19007	NC_017154	CAT	2	6	1192360	1192365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121518
19008	NC_017154	TGA	2	6	1192402	1192407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121518
19009	NC_017154	CTCAC	2	10	1192413	1192422	20 %	20 %	0 %	60 %	384121518
19010	NC_017154	AAT	2	6	1192436	1192441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121518
19011	NC_017154	AAG	2	6	1192542	1192547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121518
19012	NC_017154	CTG	2	6	1192556	1192561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121518
19013	NC_017154	TGG	2	6	1192564	1192569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121518
19014	NC_017154	CAGGTT	2	12	1192610	1192621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384121518
19015	NC_017154	GAA	2	6	1192700	1192705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121518
19016	NC_017154	TGC	2	6	1192717	1192722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121518
19017	NC_017154	ATG	2	6	1192767	1192772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121518
19018	NC_017154	TGA	2	6	1192783	1192788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121518
19019	NC_017154	ATG	2	6	1192827	1192832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121518
19020	NC_017154	GAA	2	6	1192861	1192866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121518
19021	NC_017154	CAG	2	6	1192877	1192882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121518
19022	NC_017154	GAA	2	6	1192895	1192900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121518
19023	NC_017154	TG	3	6	1192905	1192910	0 %	50 %	50 %	0 %	384121518
19024	NC_017154	AGA	2	6	1193032	1193037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121518
19025	NC_017154	GAA	2	6	1193069	1193074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121518
19026	NC_017154	ATG	2	6	1193130	1193135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121518
19027	NC_017154	TGG	2	6	1193274	1193279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121518
19028	NC_017154	GGC	2	6	1193476	1193481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121518
19029	NC_017154	TTG	2	6	1193532	1193537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121518
19030	NC_017154	AGCT	2	8	1193607	1193614	25 %	25 %	25 %	25 %	384121518
19031	NC_017154	TGA	2	6	1193629	1193634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121518
19032	NC_017154	ATG	2	6	1193799	1193804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121518
19033	NC_017154	GCTGG	2	10	1193813	1193822	0 %	20 %	60 %	20 %	384121518
19034	NC_017154	CAT	2	6	1193857	1193862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121518
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19036	NC_017154	GC	3	6	1193893	1193898	0 %	0 %	50 %	50 %	384121518
19037	NC_017154	GGA	2	6	1193941	1193946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121518
19038	NC_017154	A	7	7	1193948	1193954	100 %	0 %	0 %	0 %	384121518
19039	NC_017154	TGC	2	6	1193964	1193969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121518
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19041	NC_017154	GTG	2	6	1194276	1194281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121518
19042	NC_017154	CGT	2	6	1194293	1194298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121518
19043	NC_017154	CTG	2	6	1194318	1194323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121518
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19046	NC_017154	GAT	2	6	1194647	1194652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121518
19047	NC_017154	G	6	6	1194733	1194738	0 %	0 %	100 %	0 %	384121518
19048	NC_017154	GCA	2	6	1194854	1194859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121518
19049	NC_017154	TGA	2	6	1194861	1194866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121518
19050	NC_017154	TC	3	6	1194869	1194874	0 %	50 %	0 %	50 %	384121518
19051	NC_017154	GCC	2	6	1194991	1194996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121518
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19054	NC_017154	GTC	2	6	1195239	1195244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121518
19055	NC_017154	TGA	2	6	1195336	1195341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121518
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19057	NC_017154	CTGA	2	8	1195430	1195437	25 %	25 %	25 %	25 %	384121518
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19100	NC_017154	GGC	2	6	1197659	1197664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121521
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19230	NC_017154	CCA	2	6	1206223	1206228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121529
19231	NC_017154	CAATC	2	10	1206281	1206290	40 %	20 %	0 %	40 %	384121529
19232	NC_017154	CGA	2	6	1206298	1206303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121529
19233	NC_017154	ATC	2	6	1206321	1206326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121529
19234	NC_017154	ATA	2	6	1206339	1206344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121529
19235	NC_017154	CAC	2	6	1206368	1206373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121529
19236	NC_017154	TCA	2	6	1206490	1206495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121529
19237	NC_017154	TTG	2	6	1206856	1206861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121530
19238	NC_017154	GA	3	6	1206882	1206887	50 %	0 %	50 %	0 %	384121530
19239	NC_017154	TTA	2	6	1206930	1206935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121530
19240	NC_017154	CATC	2	8	1206966	1206973	25 %	25 %	0 %	50 %	384121530
19241	NC_017154	CGG	2	6	1207007	1207012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121530
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19243	NC_017154	GTG	2	6	1207046	1207051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121530
19244	NC_017154	TGG	2	6	1207068	1207073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121530
19245	NC_017154	TCA	2	6	1207076	1207081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121530
19246	NC_017154	CA	3	6	1207080	1207085	50 %	0 %	0 %	50 %	384121530
19247	NC_017154	GC	3	6	1207110	1207115	0 %	0 %	50 %	50 %	384121530
19248	NC_017154	CTA	2	6	1207188	1207193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121530
19249	NC_017154	ATTC	2	8	1207203	1207210	25 %	50 %	0 %	25 %	384121530
19250	NC_017154	CT	3	6	1207212	1207217	0 %	50 %	0 %	50 %	384121530
19251	NC_017154	GCAAT	2	10	1207257	1207266	40 %	20 %	20 %	20 %	384121530
19252	NC_017154	TGA	2	6	1207285	1207290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121530
19253	NC_017154	GAC	2	6	1207326	1207331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121530
19254	NC_017154	GC	3	6	1207332	1207337	0 %	0 %	50 %	50 %	384121530
19255	NC_017154	GGT	2	6	1207360	1207365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121530
19256	NC_017154	TCA	2	6	1207376	1207381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121530
19257	NC_017154	CTG	2	6	1207534	1207539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121530
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19260	NC_017154	GTTGGT	2	12	1207902	1207913	0 %	50 %	50 %	0 %	384121531
19261	NC_017154	CAAT	2	8	1207917	1207924	50 %	25 %	0 %	25 %	384121531
19262	NC_017154	GAA	2	6	1207951	1207956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121531
19263	NC_017154	ATGG	2	8	1207977	1207984	25 %	25 %	50 %	0 %	384121531
19264	NC_017154	CAT	2	6	1208038	1208043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121531
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19272	NC_017154	TATT	2	8	1214641	1214648	25 %	75 %	0 %	0 %	384121532
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19329	NC_017154	GCA	2	6	1218680	1218685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121536
19330	NC_017154	TCG	2	6	1218696	1218701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121536
19331	NC_017154	TTGAA	2	10	1218719	1218728	40 %	40 %	20 %	0 %	384121536
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19333	NC_017154	A	6	6	1218796	1218801	100 %	0 %	0 %	0 %	384121536
19334	NC_017154	GTA	2	6	1218815	1218820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121536
19335	NC_017154	CAT	2	6	1218895	1218900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121536
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19337	NC_017154	TGG	2	6	1218966	1218971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121536
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19339	NC_017154	ATG	3	9	1219004	1219012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121536
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19343	NC_017154	G	6	6	1219274	1219279	0 %	0 %	100 %	0 %	384121537
19344	NC_017154	CG	3	6	1219288	1219293	0 %	0 %	50 %	50 %	384121537
19345	NC_017154	TGG	2	6	1219318	1219323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121537
19346	NC_017154	T	6	6	1219330	1219335	0 %	100 %	0 %	0 %	384121537
19347	NC_017154	TCA	2	6	1219401	1219406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121537
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19349	NC_017154	TGA	2	6	1219566	1219571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121537
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19464	NC_017154	ATC	2	6	1228193	1228198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121544
19465	NC_017154	GGTG	2	8	1228217	1228224	0 %	25 %	75 %	0 %	384121544
19466	NC_017154	GCG	2	6	1228254	1228259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121544
19467	NC_017154	TGT	2	6	1228269	1228274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121544
19468	NC_017154	TTG	2	6	1228284	1228289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121544
19469	NC_017154	CGT	2	6	1228303	1228308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121544
19470	NC_017154	CCG	2	6	1228312	1228317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121544
19471	NC_017154	ATA	2	6	1228320	1228325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121544
19472	NC_017154	CAA	2	6	1228396	1228401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121544
19473	NC_017154	ATT	2	6	1228458	1228463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121544
19474	NC_017154	GTG	2	6	1228478	1228483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121544
19475	NC_017154	GATT	2	8	1228546	1228553	25 %	50 %	25 %	0 %	384121544
19476	NC_017154	CCA	2	6	1228585	1228590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121544
19477	NC_017154	GCA	2	6	1228594	1228599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121544
19478	NC_017154	TGC	2	6	1228603	1228608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121544
19479	NC_017154	GAT	2	6	1228669	1228674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121544
19480	NC_017154	CAGC	2	8	1228720	1228727	25 %	0 %	25 %	50 %	384121544
19481	NC_017154	TTCT	2	8	1228774	1228781	0 %	75 %	0 %	25 %	384121544
19482	NC_017154	GGCG	2	8	1228784	1228791	0 %	0 %	75 %	25 %	384121544
19483	NC_017154	GGC	2	6	1228829	1228834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121544
19484	NC_017154	ATCAC	2	10	1228839	1228848	40 %	20 %	0 %	40 %	384121544
19485	NC_017154	CCT	2	6	1229816	1229821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121545
19486	NC_017154	CGGCCA	2	12	1229848	1229859	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384121545
19487	NC_017154	GCG	2	6	1229917	1229922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121545
19488	NC_017154	TAA	2	6	1229926	1229931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121545
19489	NC_017154	G	6	6	1229969	1229974	0 %	0 %	100 %	0 %	384121545
19490	NC_017154	GGT	2	6	1230000	1230005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121545
19491	NC_017154	TCAGG	2	10	1230035	1230044	20 %	20 %	40 %	20 %	384121545
19492	NC_017154	GCC	2	6	1230060	1230065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121545
19493	NC_017154	CTT	2	6	1230089	1230094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121545
19494	NC_017154	CAG	2	6	1230258	1230263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121545
19495	NC_017154	CCT	2	6	1230335	1230340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121545
19496	NC_017154	GGCT	2	8	1230368	1230375	0 %	25 %	50 %	25 %	384121545
19497	NC_017154	TTG	2	6	1230394	1230399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121545
19498	NC_017154	GCC	2	6	1230460	1230465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121545
19499	NC_017154	TGCTT	2	10	1230532	1230541	0 %	60 %	20 %	20 %	384121545
19500	NC_017154	CAG	2	6	1230579	1230584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121545

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