MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_017154	CAG	2	6	1159118	1159123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121484
18502	NC_017154	TCC	2	6	1159143	1159148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121484
18503	NC_017154	ATC	2	6	1159221	1159226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121484
18504	NC_017154	G	6	6	1159422	1159427	0 %	0 %	100 %	0 %	384121485
18505	NC_017154	TAT	2	6	1159428	1159433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121485
18506	NC_017154	AAG	2	6	1159443	1159448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121485
18507	NC_017154	GCC	2	6	1159475	1159480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121485
18508	NC_017154	TGC	2	6	1159499	1159504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121485
18509	NC_017154	TGA	2	6	1159556	1159561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121485
18510	NC_017154	TAA	2	6	1159582	1159587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121485
18511	NC_017154	ATG	2	6	1159800	1159805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121485
18512	NC_017154	CCG	2	6	1159823	1159828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121485
18513	NC_017154	TCT	2	6	1159847	1159852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121485
18514	NC_017154	AAT	2	6	1159853	1159858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121485
18515	NC_017154	ACA	2	6	1159991	1159996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121485
18516	NC_017154	AGCC	2	8	1160011	1160018	25 %	0 %	25 %	50 %	384121485
18517	NC_017154	T	6	6	1160088	1160093	0 %	100 %	0 %	0 %	384121485
18518	NC_017154	AGT	2	6	1160099	1160104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121485
18519	NC_017154	GAT	2	6	1160130	1160135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121485
18520	NC_017154	ATG	2	6	1160209	1160214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121485
18521	NC_017154	AAT	2	6	1160230	1160235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121485
18522	NC_017154	GGGC	2	8	1160258	1160265	0 %	0 %	75 %	25 %	384121485
18523	NC_017154	GTT	2	6	1160297	1160302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121485
18524	NC_017154	ATA	2	6	1160315	1160320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121485
18525	NC_017154	CTG	2	6	1160325	1160330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121485
18526	NC_017154	TAA	2	6	1160340	1160345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121485
18527	NC_017154	TTG	2	6	1160356	1160361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121485
18528	NC_017154	CTG	2	6	1160434	1160439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121485
18529	NC_017154	CGC	2	6	1160488	1160493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121485
18530	NC_017154	CGA	2	6	1160537	1160542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121485
18531	NC_017154	ACC	2	6	1161242	1161247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121486
18532	NC_017154	GCC	3	9	1161273	1161281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121486
18533	NC_017154	AGC	2	6	1161302	1161307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121486
18534	NC_017154	GAG	2	6	1161309	1161314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121486
18535	NC_017154	CCA	2	6	1161341	1161346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121486
18536	NC_017154	GGA	2	6	1161359	1161364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121486
18537	NC_017154	CCG	2	6	1161386	1161391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121486
18538	NC_017154	TGT	2	6	1161406	1161411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121486
18539	NC_017154	GAA	2	6	1161417	1161422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121486
18540	NC_017154	GC	3	6	1161492	1161497	0 %	0 %	50 %	50 %	384121486
18541	NC_017154	GCC	2	6	1161527	1161532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121486
18542	NC_017154	TGA	2	6	1161641	1161646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121486
18543	NC_017154	TTG	2	6	1161798	1161803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121486
18544	NC_017154	GCA	2	6	1161869	1161874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121486
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18550	NC_017154	CT	3	6	1162400	1162405	0 %	50 %	0 %	50 %	384121487
18551	NC_017154	TGAA	2	8	1162411	1162418	50 %	25 %	25 %	0 %	384121487
18552	NC_017154	AT	4	8	1162605	1162612	50 %	50 %	0 %	0 %	384121487
18553	NC_017154	GGAT	2	8	1162644	1162651	25 %	25 %	50 %	0 %	384121487
18554	NC_017154	AAT	2	6	1162702	1162707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121487
18555	NC_017154	CGCC	2	8	1162899	1162906	0 %	0 %	25 %	75 %	384121488
18556	NC_017154	ATG	2	6	1162909	1162914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121488
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18558	NC_017154	AGA	2	6	1162947	1162952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121488
18559	NC_017154	GT	3	6	1162955	1162960	0 %	50 %	50 %	0 %	384121488
18560	NC_017154	GTTG	2	8	1162977	1162984	0 %	50 %	50 %	0 %	384121488
18561	NC_017154	GTG	2	6	1163140	1163145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121488
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18565	NC_017154	ATGC	2	8	1163338	1163345	25 %	25 %	25 %	25 %	384121488
18566	NC_017154	GCA	2	6	1163396	1163401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121488
18567	NC_017154	TGA	2	6	1163402	1163407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121488
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18569	NC_017154	GCA	2	6	1163504	1163509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121488
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18571	NC_017154	TGG	2	6	1163534	1163539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121488
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18589	NC_017154	TTG	2	6	1164224	1164229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121489
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18601	NC_017154	TGGTT	2	10	1165336	1165345	0 %	60 %	40 %	0 %	384121490
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18603	NC_017154	TCA	2	6	1165474	1165479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121490
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18605	NC_017154	CCA	2	6	1165538	1165543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121490
18606	NC_017154	CT	3	6	1165561	1165566	0 %	50 %	0 %	50 %	384121490
18607	NC_017154	GCA	2	6	1165589	1165594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121490
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18614	NC_017154	T	6	6	1165812	1165817	0 %	100 %	0 %	0 %	384121490
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