MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_017154	GC	3	6	1126280	1126285	0 %	0 %	50 %	50 %	384121462
18002	NC_017154	GGC	2	6	1126311	1126316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121462
18003	NC_017154	GATT	2	8	1126361	1126368	25 %	50 %	25 %	0 %	384121462
18004	NC_017154	TTAC	2	8	1126431	1126438	25 %	50 %	0 %	25 %	384121462
18005	NC_017154	AGC	2	6	1126463	1126468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121462
18006	NC_017154	CAG	2	6	1126472	1126477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121462
18007	NC_017154	CGA	2	6	1126536	1126541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121462
18008	NC_017154	GCA	2	6	1126660	1126665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121462
18009	NC_017154	CG	3	6	1126787	1126792	0 %	0 %	50 %	50 %	384121462
18010	NC_017154	TTA	2	6	1126819	1126824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121462
18011	NC_017154	CTG	2	6	1126983	1126988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121463
18012	NC_017154	TCG	2	6	1127089	1127094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121463
18013	NC_017154	ATG	2	6	1127130	1127135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121463
18014	NC_017154	TGGC	2	8	1127155	1127162	0 %	25 %	50 %	25 %	384121463
18015	NC_017154	ATG	2	6	1127301	1127306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121463
18016	NC_017154	CGA	2	6	1127314	1127319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121463
18017	NC_017154	G	6	6	1127349	1127354	0 %	0 %	100 %	0 %	384121463
18018	NC_017154	ATTT	2	8	1127428	1127435	25 %	75 %	0 %	0 %	384121463
18019	NC_017154	GCA	2	6	1127451	1127456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121463
18020	NC_017154	CTT	2	6	1127498	1127503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121463
18021	NC_017154	TCT	2	6	1127516	1127521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121463
18022	NC_017154	G	6	6	1127572	1127577	0 %	0 %	100 %	0 %	384121463
18023	NC_017154	TGG	2	6	1127668	1127673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121463
18024	NC_017154	TGG	2	6	1127686	1127691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121463
18025	NC_017154	GCC	3	9	1127700	1127708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121463
18026	NC_017154	GTT	2	6	1127737	1127742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121463
18027	NC_017154	TCT	2	6	1127779	1127784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121463
18028	NC_017154	GCT	2	6	1127870	1127875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121463
18029	NC_017154	TGG	2	6	1127977	1127982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121463
18030	NC_017154	TGT	2	6	1127999	1128004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121463
18031	NC_017154	GGC	2	6	1128070	1128075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121463
18032	NC_017154	ATGAT	2	10	1128104	1128113	40 %	40 %	20 %	0 %	384121463
18033	NC_017154	GTT	2	6	1129174	1129179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121464
18034	NC_017154	CAA	2	6	1129210	1129215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121464
18035	NC_017154	TAA	2	6	1129424	1129429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121464
18036	NC_017154	GTTT	2	8	1129700	1129707	0 %	75 %	25 %	0 %	384121464
18037	NC_017154	CT	3	6	1129767	1129772	0 %	50 %	0 %	50 %	384121464
18038	NC_017154	TTC	2	6	1129791	1129796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121464
18039	NC_017154	ATC	2	6	1129829	1129834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121464
18040	NC_017154	T	6	6	1129873	1129878	0 %	100 %	0 %	0 %	384121464
18041	NC_017154	AT	3	6	1129911	1129916	50 %	50 %	0 %	0 %	384121464
18042	NC_017154	ATCA	2	8	1129973	1129980	50 %	25 %	0 %	25 %	384121464
18043	NC_017154	CAG	2	6	1130069	1130074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121464
18044	NC_017154	GAT	2	6	1130104	1130109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121464
18045	NC_017154	ATTGC	2	10	1130110	1130119	20 %	40 %	20 %	20 %	384121464
18046	NC_017154	TCT	2	6	1130546	1130551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121465
18047	NC_017154	GCT	2	6	1130629	1130634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121465
18048	NC_017154	TTC	2	6	1130712	1130717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121465
18049	NC_017154	CTT	3	9	1130738	1130746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121465
18050	NC_017154	CAG	2	6	1130763	1130768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121465
18051	NC_017154	GTG	2	6	1130894	1130899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121465
18052	NC_017154	TAGA	2	8	1131015	1131022	50 %	25 %	25 %	0 %	384121465
18053	NC_017154	GAT	3	9	1131896	1131904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121466
18054	NC_017154	GAA	2	6	1132055	1132060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121466
18055	NC_017154	GT	3	6	1132160	1132165	0 %	50 %	50 %	0 %	384121466
18056	NC_017154	GGT	2	6	1132182	1132187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121466
18057	NC_017154	TAC	2	6	1132191	1132196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121466
18058	NC_017154	TGGC	2	8	1132255	1132262	0 %	25 %	50 %	25 %	384121466
18059	NC_017154	GTG	2	6	1132295	1132300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121466
18060	NC_017154	TCG	2	6	1132321	1132326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121466
18061	NC_017154	TGC	2	6	1132342	1132347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121466
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18063	NC_017154	CTC	2	6	1132374	1132379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121466
18064	NC_017154	CCGC	2	8	1132388	1132395	0 %	0 %	25 %	75 %	384121466
18065	NC_017154	GTTAA	2	10	1132413	1132422	40 %	40 %	20 %	0 %	384121466
18066	NC_017154	TCATGC	2	12	1132428	1132439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384121467
18067	NC_017154	AGT	2	6	1132450	1132455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121467
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18069	NC_017154	TAC	2	6	1132577	1132582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121467
18070	NC_017154	TGG	2	6	1132659	1132664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121467
18071	NC_017154	CCG	2	6	1132780	1132785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121467
18072	NC_017154	TGG	2	6	1132803	1132808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121467
18073	NC_017154	TGA	2	6	1132834	1132839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121467
18074	NC_017154	GGC	3	9	1132951	1132959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121467
18075	NC_017154	TGAACG	2	12	1133050	1133061	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384121467
18076	NC_017154	TCG	2	6	1133098	1133103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121467
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18080	NC_017154	GGT	2	6	1133251	1133256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121467
18081	NC_017154	TGC	2	6	1133266	1133271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121467
18082	NC_017154	TTG	2	6	1133342	1133347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121467
18083	NC_017154	TGA	2	6	1133356	1133361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121467
18084	NC_017154	AGCC	2	8	1133374	1133381	25 %	0 %	25 %	50 %	384121467
18085	NC_017154	TGA	2	6	1133410	1133415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121467
18086	NC_017154	GCC	2	6	1133483	1133488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121467
18087	NC_017154	CAGC	2	8	1133566	1133573	25 %	0 %	25 %	50 %	384121467
18088	NC_017154	GCT	2	6	1133575	1133580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121467
18089	NC_017154	TTG	2	6	1133583	1133588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121467
18090	NC_017154	GCTG	2	8	1133680	1133687	0 %	25 %	50 %	25 %	384121467
18091	NC_017154	GAT	2	6	1133690	1133695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121467
18092	NC_017154	GTG	2	6	1133721	1133726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121467
18093	NC_017154	G	6	6	1133782	1133787	0 %	0 %	100 %	0 %	384121467
18094	NC_017154	GAA	2	6	1133855	1133860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121467
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18097	NC_017154	GAT	2	6	1134100	1134105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121467
18098	NC_017154	TGA	2	6	1134124	1134129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121467
18099	NC_017154	TTGA	2	8	1134140	1134147	25 %	50 %	25 %	0 %	384121467
18100	NC_017154	TGC	2	6	1134186	1134191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121467
18101	NC_017154	TGA	2	6	1134210	1134215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121467
18102	NC_017154	TCCA	2	8	1134223	1134230	25 %	25 %	0 %	50 %	384121467
18103	NC_017154	TGC	2	6	1134240	1134245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121467
18104	NC_017154	CAA	2	6	1134322	1134327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121467
18105	NC_017154	AGTC	2	8	1134421	1134428	25 %	25 %	25 %	25 %	384121467
18106	NC_017154	CTG	2	6	1134467	1134472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121467
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18108	NC_017154	ACC	2	6	1134599	1134604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121467
18109	NC_017154	TGG	2	6	1135018	1135023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121468
18110	NC_017154	CGT	2	6	1135053	1135058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121468
18111	NC_017154	AGA	2	6	1135088	1135093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121468
18112	NC_017154	CTG	2	6	1135104	1135109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121468
18113	NC_017154	GGT	2	6	1135137	1135142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121468
18114	NC_017154	TGTTC	2	10	1135154	1135163	0 %	60 %	20 %	20 %	384121468
18115	NC_017154	CCG	2	6	1135277	1135282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121468
18116	NC_017154	TTC	2	6	1135296	1135301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121468
18117	NC_017154	TTTGG	2	10	1135335	1135344	0 %	60 %	40 %	0 %	384121468
18118	NC_017154	GTG	2	6	1135551	1135556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121468
18119	NC_017154	ATC	2	6	1135563	1135568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121468
18120	NC_017154	CAT	2	6	1135646	1135651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121468
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18217	NC_017154	CT	3	6	1141902	1141907	0 %	50 %	0 %	50 %	384121475
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18221	NC_017154	CG	3	6	1142176	1142181	0 %	0 %	50 %	50 %	384121475
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18224	NC_017154	TTA	2	6	1142323	1142328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121475
18225	NC_017154	GAT	3	9	1142481	1142489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121475
18226	NC_017154	AC	3	6	1142525	1142530	50 %	0 %	0 %	50 %	384121475
18227	NC_017154	GGC	2	6	1142683	1142688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121475
18228	NC_017154	GTC	2	6	1142734	1142739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121475
18229	NC_017154	ATT	2	6	1142741	1142746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121475
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18231	NC_017154	AAC	2	6	1142800	1142805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121475
18232	NC_017154	GGC	2	6	1142885	1142890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121475
18233	NC_017154	ATGA	2	8	1143000	1143007	50 %	25 %	25 %	0 %	384121475
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18345	NC_017154	CGC	2	6	1149300	1149305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121478
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18347	NC_017154	TAC	2	6	1149361	1149366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121478
18348	NC_017154	GCC	2	6	1149390	1149395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121478
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18352	NC_017154	TGA	2	6	1149647	1149652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121478
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18456	NC_017154	CAA	2	6	1156694	1156699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121482
18457	NC_017154	GAAC	2	8	1156738	1156745	50 %	0 %	25 %	25 %	384121482
18458	NC_017154	ATT	2	6	1156779	1156784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121482
18459	NC_017154	GTTTG	2	10	1156903	1156912	0 %	60 %	40 %	0 %	384121482
18460	NC_017154	TAC	2	6	1156967	1156972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121482
18461	NC_017154	GGC	2	6	1157068	1157073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121482
18462	NC_017154	ATC	2	6	1157108	1157113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121482
18463	NC_017154	ATG	2	6	1157144	1157149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121482
18464	NC_017154	GGC	2	6	1157187	1157192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121482
18465	NC_017154	TTC	2	6	1157201	1157206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121482
18466	NC_017154	GCA	2	6	1157238	1157243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121482
18467	NC_017154	GTT	2	6	1157347	1157352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121482
18468	NC_017154	ATTG	2	8	1157425	1157432	25 %	50 %	25 %	0 %	384121482
18469	NC_017154	CCG	2	6	1157468	1157473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121482
18470	NC_017154	ACC	2	6	1157477	1157482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121482
18471	NC_017154	TGA	2	6	1157506	1157511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121482
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18473	NC_017154	GCT	2	6	1157630	1157635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121482
18474	NC_017154	GTT	2	6	1157695	1157700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121482
18475	NC_017154	AAT	2	6	1157762	1157767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121482
18476	NC_017154	TGG	2	6	1157960	1157965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121483
18477	NC_017154	T	6	6	1158001	1158006	0 %	100 %	0 %	0 %	384121483
18478	NC_017154	GGC	2	6	1158036	1158041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121483
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18480	NC_017154	GAT	2	6	1158108	1158113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121483
18481	NC_017154	TGA	2	6	1158236	1158241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121483
18482	NC_017154	TTA	2	6	1158244	1158249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121483
18483	NC_017154	TGT	2	6	1158334	1158339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121483
18484	NC_017154	GTG	2	6	1158366	1158371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121483
18485	NC_017154	GTG	2	6	1158492	1158497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121483
18486	NC_017154	TG	4	8	1158575	1158582	0 %	50 %	50 %	0 %	384121483
18487	NC_017154	GCA	2	6	1158589	1158594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121483
18488	NC_017154	A	7	7	1158609	1158615	100 %	0 %	0 %	0 %	384121483
18489	NC_017154	TCGGC	2	10	1158634	1158643	0 %	20 %	40 %	40 %	384121483
18490	NC_017154	TTG	2	6	1158670	1158675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121483
18491	NC_017154	GAA	2	6	1158692	1158697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121483
18492	NC_017154	GAT	2	6	1158698	1158703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121483
18493	NC_017154	GCC	2	6	1158732	1158737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121483
18494	NC_017154	AAT	2	6	1158780	1158785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121484
18495	NC_017154	GTT	2	6	1158865	1158870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121484
18496	NC_017154	TGT	2	6	1158921	1158926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121484
18497	NC_017154	CGG	2	6	1158943	1158948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121484
18498	NC_017154	AGC	2	6	1158963	1158968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121484
18499	NC_017154	T	8	8	1159077	1159084	0 %	100 %	0 %	0 %	384121484
18500	NC_017154	CCT	2	6	1159090	1159095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121484

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