MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_017154	GCGT	2	8	1035925	1035932	0 %	25 %	50 %	25 %	384121393
16502	NC_017154	TAA	2	6	1036139	1036144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121393
16503	NC_017154	ATCC	2	8	1036266	1036273	25 %	25 %	0 %	50 %	384121393
16504	NC_017154	TATT	2	8	1036298	1036305	25 %	75 %	0 %	0 %	384121393
16505	NC_017154	TAA	2	6	1036418	1036423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121393
16506	NC_017154	TAA	2	6	1036460	1036465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121393
16507	NC_017154	TCC	2	6	1036466	1036471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121393
16508	NC_017154	TGA	2	6	1036505	1036510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121393
16509	NC_017154	CTT	2	6	1038164	1038169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121394
16510	NC_017154	ATA	2	6	1038173	1038178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121394
16511	NC_017154	TG	4	8	1038184	1038191	0 %	50 %	50 %	0 %	384121394
16512	NC_017154	GTG	2	6	1038212	1038217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121394
16513	NC_017154	ATG	2	6	1038256	1038261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121394
16514	NC_017154	TTGG	2	8	1038265	1038272	0 %	50 %	50 %	0 %	384121394
16515	NC_017154	A	6	6	1038279	1038284	100 %	0 %	0 %	0 %	384121394
16516	NC_017154	GTA	2	6	1038326	1038331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121394
16517	NC_017154	TAT	2	6	1038355	1038360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121394
16518	NC_017154	A	6	6	1038386	1038391	100 %	0 %	0 %	0 %	384121394
16519	NC_017154	AAT	2	6	1038406	1038411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121394
16520	NC_017154	GAA	2	6	1038424	1038429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121394
16521	NC_017154	AAT	2	6	1038523	1038528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121394
16522	NC_017154	T	6	6	1038547	1038552	0 %	100 %	0 %	0 %	384121394
16523	NC_017154	CGA	2	6	1038585	1038590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121394
16524	NC_017154	TGG	2	6	1038651	1038656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121394
16525	NC_017154	TGT	2	6	1038827	1038832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121394
16526	NC_017154	ATCA	2	8	1038901	1038908	50 %	25 %	0 %	25 %	384121394
16527	NC_017154	GCC	2	6	1038913	1038918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121394
16528	NC_017154	ATT	2	6	1038932	1038937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121394
16529	NC_017154	CT	3	6	1039018	1039023	0 %	50 %	0 %	50 %	384121394
16530	NC_017154	CAA	2	6	1039030	1039035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121394
16531	NC_017154	GCA	2	6	1039066	1039071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121394
16532	NC_017154	TGG	2	6	1039140	1039145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121394
16533	NC_017154	GTTG	2	8	1039202	1039209	0 %	50 %	50 %	0 %	384121394
16534	NC_017154	G	6	6	1039216	1039221	0 %	0 %	100 %	0 %	384121394
16535	NC_017154	TAT	2	6	1039336	1039341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121394
16536	NC_017154	GTC	2	6	1039363	1039368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121394
16537	NC_017154	CT	3	6	1039389	1039394	0 %	50 %	0 %	50 %	384121394
16538	NC_017154	GCCA	2	8	1039395	1039402	25 %	0 %	25 %	50 %	384121394
16539	NC_017154	TGG	2	6	1039448	1039453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121394
16540	NC_017154	CAA	3	9	1039456	1039464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121394
16541	NC_017154	GCT	2	6	1039494	1039499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121394
16542	NC_017154	CGC	2	6	1039514	1039519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121394
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16544	NC_017154	CGC	2	6	1039548	1039553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121394
16545	NC_017154	CAAAA	2	10	1039638	1039647	80 %	0 %	0 %	20 %	384121394
16546	NC_017154	ACA	2	6	1039665	1039670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121394
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16549	NC_017154	A	6	6	1039811	1039816	100 %	0 %	0 %	0 %	384121394
16550	NC_017154	GGC	2	6	1039836	1039841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121394
16551	NC_017154	TGC	2	6	1039884	1039889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121394
16552	NC_017154	TTC	2	6	1039960	1039965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121394
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16554	NC_017154	ATT	2	6	1040075	1040080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121394
16555	NC_017154	AGA	2	6	1040115	1040120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121394
16556	NC_017154	GCC	2	6	1040309	1040314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121395
16557	NC_017154	CAG	2	6	1040421	1040426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121395
16558	NC_017154	GCC	2	6	1040475	1040480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121395
16559	NC_017154	CTGC	2	8	1040520	1040527	0 %	25 %	25 %	50 %	384121395
16560	NC_017154	CAC	2	6	1040549	1040554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121395
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16562	NC_017154	TGAT	2	8	1040587	1040594	25 %	50 %	25 %	0 %	384121395
16563	NC_017154	CGG	2	6	1040601	1040606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121395
16564	NC_017154	GCC	2	6	1040610	1040615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121395
16565	NC_017154	GATT	2	8	1040642	1040649	25 %	50 %	25 %	0 %	384121395
16566	NC_017154	TGA	2	6	1040672	1040677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121395
16567	NC_017154	CAG	2	6	1040775	1040780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121395
16568	NC_017154	TGA	2	6	1040798	1040803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121395
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16570	NC_017154	TGC	2	6	1040869	1040874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121395
16571	NC_017154	TTGGT	2	10	1040896	1040905	0 %	60 %	40 %	0 %	384121395
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16573	NC_017154	GTC	2	6	1040973	1040978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121395
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16577	NC_017154	ATT	2	6	1042093	1042098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121396
16578	NC_017154	GTC	2	6	1042099	1042104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121396
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16580	NC_017154	TAT	2	6	1042209	1042214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121396
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16582	NC_017154	ATTAA	2	10	1042264	1042273	60 %	40 %	0 %	0 %	384121396
16583	NC_017154	A	7	7	1042291	1042297	100 %	0 %	0 %	0 %	384121396
16584	NC_017154	A	6	6	1042349	1042354	100 %	0 %	0 %	0 %	384121396
16585	NC_017154	A	7	7	1042370	1042376	100 %	0 %	0 %	0 %	384121396
16586	NC_017154	GC	3	6	1042756	1042761	0 %	0 %	50 %	50 %	384121397
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16589	NC_017154	CAT	2	6	1043120	1043125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121398
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16592	NC_017154	GTCA	2	8	1043288	1043295	25 %	25 %	25 %	25 %	384121398
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16594	NC_017154	CGCA	2	8	1043464	1043471	25 %	0 %	25 %	50 %	384121399
16595	NC_017154	TGCAT	2	10	1043504	1043513	20 %	40 %	20 %	20 %	384121399
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16597	NC_017154	GATA	2	8	1043706	1043713	50 %	25 %	25 %	0 %	384121399
16598	NC_017154	TGA	2	6	1043740	1043745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121399
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16600	NC_017154	CAG	2	6	1043806	1043811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121399
16601	NC_017154	GCC	2	6	1043878	1043883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121399
16602	NC_017154	TCT	2	6	1043900	1043905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121399
16603	NC_017154	ACC	2	6	1043923	1043928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121399
16604	NC_017154	T	6	6	1043937	1043942	0 %	100 %	0 %	0 %	384121399
16605	NC_017154	ACC	2	6	1043974	1043979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121399
16606	NC_017154	GAT	2	6	1043985	1043990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121399
16607	NC_017154	TTG	2	6	1044503	1044508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121400
16608	NC_017154	AGA	2	6	1044690	1044695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121400
16609	NC_017154	CCG	2	6	1044936	1044941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121400
16610	NC_017154	TGA	3	9	1045087	1045095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121400
16611	NC_017154	CAA	2	6	1045096	1045101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121400
16612	NC_017154	T	6	6	1045205	1045210	0 %	100 %	0 %	0 %	384121400
16613	NC_017154	TAA	2	6	1045243	1045248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121400
16614	NC_017154	A	6	6	1045268	1045273	100 %	0 %	0 %	0 %	384121400
16615	NC_017154	CTTAA	2	10	1045826	1045835	40 %	40 %	0 %	20 %	384121401
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