MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_017154	ATCA	2	8	966443	966450	50 %	25 %	0 %	25 %	384121336
15503	NC_017154	CTG	2	6	966578	966583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121337
15504	NC_017154	ATGT	2	8	966593	966600	25 %	50 %	25 %	0 %	384121337
15505	NC_017154	TC	3	6	966619	966624	0 %	50 %	0 %	50 %	384121337
15506	NC_017154	GGCA	2	8	966626	966633	25 %	0 %	50 %	25 %	384121337
15507	NC_017154	TGT	2	6	966663	966668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121337
15508	NC_017154	CAG	2	6	966704	966709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121337
15509	NC_017154	AAT	2	6	966716	966721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121337
15510	NC_017154	CCG	2	6	966772	966777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121337
15511	NC_017154	CTG	2	6	966941	966946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121337
15512	NC_017154	GTC	2	6	966947	966952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121337
15513	NC_017154	TAT	2	6	966997	967002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121337
15514	NC_017154	CA	3	6	967075	967080	50 %	0 %	0 %	50 %	384121337
15515	NC_017154	CAG	2	6	967141	967146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121337
15516	NC_017154	TTG	2	6	967262	967267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121337
15517	NC_017154	GCC	2	6	967295	967300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121337
15518	NC_017154	CGG	2	6	967453	967458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121337
15519	NC_017154	CTG	2	6	967517	967522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121337
15520	NC_017154	TGT	3	9	967647	967655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121337
15521	NC_017154	GCG	2	6	967733	967738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121338
15522	NC_017154	GCG	2	6	967770	967775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121338
15523	NC_017154	CAAAT	2	10	967784	967793	60 %	20 %	0 %	20 %	384121338
15524	NC_017154	GAG	2	6	967866	967871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121338
15525	NC_017154	AGA	2	6	968044	968049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121338
15526	NC_017154	GC	3	6	968078	968083	0 %	0 %	50 %	50 %	384121338
15527	NC_017154	ATT	2	6	968282	968287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121338
15528	NC_017154	GTA	2	6	968311	968316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121338
15529	NC_017154	TAAT	2	8	968353	968360	50 %	50 %	0 %	0 %	384121338
15530	NC_017154	TAT	2	6	968365	968370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121338
15531	NC_017154	GAT	2	6	968450	968455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121338
15532	NC_017154	GCA	2	6	968544	968549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121338
15533	NC_017154	TGCT	2	8	968752	968759	0 %	50 %	25 %	25 %	384121339
15534	NC_017154	CGA	2	6	968933	968938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121339
15535	NC_017154	GTT	2	6	968955	968960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121339
15536	NC_017154	CCAT	2	8	968966	968973	25 %	25 %	0 %	50 %	384121339
15537	NC_017154	TGC	2	6	969035	969040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121339
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15539	NC_017154	CTGC	2	8	969227	969234	0 %	25 %	25 %	50 %	384121340
15540	NC_017154	GCC	2	6	969329	969334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121340
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15542	NC_017154	GGT	2	6	969411	969416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121340
15543	NC_017154	ATC	2	6	969418	969423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121340
15544	NC_017154	TAC	2	6	969516	969521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121340
15545	NC_017154	ATG	2	6	969714	969719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121340
15546	NC_017154	CACG	2	8	969933	969940	25 %	0 %	25 %	50 %	384121341
15547	NC_017154	AAT	2	6	969982	969987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121341
15548	NC_017154	CCAAC	2	10	969990	969999	40 %	0 %	0 %	60 %	384121341
15549	NC_017154	GGGC	2	8	970070	970077	0 %	0 %	75 %	25 %	384121341
15550	NC_017154	CTT	2	6	970188	970193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121341
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15552	NC_017154	GCT	2	6	970231	970236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121341
15553	NC_017154	C	6	6	970307	970312	0 %	0 %	0 %	100 %	384121341
15554	NC_017154	GAT	2	6	970333	970338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121341
15555	NC_017154	TGG	2	6	970352	970357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121341
15556	NC_017154	CAC	2	6	970468	970473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121341
15557	NC_017154	TCT	2	6	970487	970492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121341
15558	NC_017154	CGG	2	6	970537	970542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121341
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15560	NC_017154	GCGCT	2	10	970717	970726	0 %	20 %	40 %	40 %	384121341
15561	NC_017154	ATAGC	2	10	970731	970740	40 %	20 %	20 %	20 %	384121341
15562	NC_017154	TCTT	2	8	970751	970758	0 %	75 %	0 %	25 %	384121341
15563	NC_017154	GCA	2	6	970897	970902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121342
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15567	NC_017154	TGAG	2	8	971005	971012	25 %	25 %	50 %	0 %	384121342
15568	NC_017154	AGGG	2	8	971015	971022	25 %	0 %	75 %	0 %	384121342
15569	NC_017154	GGC	2	6	971150	971155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121342
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15571	NC_017154	T	7	7	971182	971188	0 %	100 %	0 %	0 %	384121342
15572	NC_017154	T	6	6	971290	971295	0 %	100 %	0 %	0 %	384121342
15573	NC_017154	AAT	2	6	971436	971441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121342
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15584	NC_017154	CAGG	2	8	972257	972264	25 %	0 %	50 %	25 %	384121343
15585	NC_017154	CG	3	6	972287	972292	0 %	0 %	50 %	50 %	384121343
15586	NC_017154	T	6	6	972305	972310	0 %	100 %	0 %	0 %	384121343
15587	NC_017154	T	6	6	972349	972354	0 %	100 %	0 %	0 %	384121343
15588	NC_017154	GTGACT	2	12	972454	972465	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384121343
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15591	NC_017154	GCA	2	6	972691	972696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121344
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15595	NC_017154	TCA	2	6	972912	972917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121344
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15599	NC_017154	CAC	2	6	973178	973183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121344
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15601	NC_017154	GCA	2	6	973338	973343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121345
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15603	NC_017154	GCT	2	6	973356	973361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121345
15604	NC_017154	T	6	6	973369	973374	0 %	100 %	0 %	0 %	384121345
15605	NC_017154	GAA	2	6	973478	973483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121345
15606	NC_017154	CAG	2	6	973493	973498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121345
15607	NC_017154	CTG	2	6	973510	973515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121345
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15609	NC_017154	CGC	2	6	973613	973618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121345
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15737	NC_017154	CTGAT	2	10	984603	984612	20 %	40 %	20 %	20 %	384121352
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15981	NC_017154	GC	3	6	1001557	1001562	0 %	0 %	50 %	50 %	384121367
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15983	NC_017154	TGA	2	6	1001600	1001605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121367
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