MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017154	GGT	2	6	939231	939236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121319
15002	NC_017154	GCT	2	6	939267	939272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121319
15003	NC_017154	TCG	2	6	939308	939313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121319
15004	NC_017154	G	6	6	939384	939389	0 %	0 %	100 %	0 %	384121319
15005	NC_017154	TCG	3	9	939567	939575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121319
15006	NC_017154	GA	3	6	939584	939589	50 %	0 %	50 %	0 %	384121319
15007	NC_017154	CCAG	2	8	939590	939597	25 %	0 %	25 %	50 %	384121319
15008	NC_017154	ACA	2	6	939603	939608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121319
15009	NC_017154	GTG	2	6	939659	939664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121319
15010	NC_017154	CAT	2	6	939777	939782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121319
15011	NC_017154	TGA	2	6	939869	939874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121319
15012	NC_017154	AGA	2	6	939918	939923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121319
15013	NC_017154	TGA	2	6	940022	940027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121320
15014	NC_017154	CAGG	2	8	940031	940038	25 %	0 %	50 %	25 %	384121320
15015	NC_017154	TGA	2	6	940045	940050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121320
15016	NC_017154	GTT	2	6	940089	940094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121320
15017	NC_017154	GCA	2	6	940113	940118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121320
15018	NC_017154	TCT	2	6	940123	940128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121320
15019	NC_017154	ATA	2	6	940150	940155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121320
15020	NC_017154	GGC	2	6	940193	940198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121320
15021	NC_017154	TGT	2	6	940207	940212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121320
15022	NC_017154	TGG	2	6	940226	940231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121320
15023	NC_017154	T	6	6	940364	940369	0 %	100 %	0 %	0 %	384121320
15024	NC_017154	GAT	2	6	940412	940417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121320
15025	NC_017154	ATT	2	6	940443	940448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121320
15026	NC_017154	TATT	2	8	940465	940472	25 %	75 %	0 %	0 %	384121320
15027	NC_017154	ATT	2	6	940554	940559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121320
15028	NC_017154	TGG	2	6	940597	940602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121320
15029	NC_017154	GCG	2	6	940701	940706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121320
15030	NC_017154	GCG	2	6	940779	940784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121320
15031	NC_017154	G	6	6	940811	940816	0 %	0 %	100 %	0 %	384121320
15032	NC_017154	TAT	2	6	940838	940843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121320
15033	NC_017154	GGT	2	6	940913	940918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121320
15034	NC_017154	ATC	4	12	940929	940940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121320
15035	NC_017154	TGTT	2	8	941059	941066	0 %	75 %	25 %	0 %	384121321
15036	NC_017154	GTT	2	6	941125	941130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121321
15037	NC_017154	GGC	2	6	941266	941271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121321
15038	NC_017154	TCAG	2	8	941426	941433	25 %	25 %	25 %	25 %	384121321
15039	NC_017154	GCCA	2	8	941488	941495	25 %	0 %	25 %	50 %	384121321
15040	NC_017154	CGG	2	6	941529	941534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121321
15041	NC_017154	GTT	2	6	941623	941628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121321
15042	NC_017154	G	6	6	941671	941676	0 %	0 %	100 %	0 %	384121321
15043	NC_017154	ACC	2	6	941768	941773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121321
15044	NC_017154	GC	3	6	941777	941782	0 %	0 %	50 %	50 %	384121321
15045	NC_017154	GGC	2	6	941826	941831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121321
15046	NC_017154	TGAA	2	8	941912	941919	50 %	25 %	25 %	0 %	384121321
15047	NC_017154	GC	3	6	941922	941927	0 %	0 %	50 %	50 %	384121321
15048	NC_017154	CAG	2	6	941958	941963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121321
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15050	NC_017154	TGC	2	6	942030	942035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121321
15051	NC_017154	CGG	2	6	942062	942067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121321
15052	NC_017154	TGA	2	6	942098	942103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121321
15053	NC_017154	TG	3	6	942275	942280	0 %	50 %	50 %	0 %	384121321
15054	NC_017154	CGC	2	6	942333	942338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121321
15055	NC_017154	TCG	2	6	942356	942361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121321
15056	NC_017154	GGT	2	6	942469	942474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121321
15057	NC_017154	TGA	2	6	942554	942559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121321
15058	NC_017154	GCCACC	2	12	942619	942630	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384121321
15059	NC_017154	ACT	2	6	942637	942642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121321
15060	NC_017154	TTCA	2	8	942715	942722	25 %	50 %	0 %	25 %	384121321
15061	NC_017154	GGA	2	6	942736	942741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121321
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15063	NC_017154	CAT	2	6	942939	942944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121321
15064	NC_017154	TGGC	2	8	943002	943009	0 %	25 %	50 %	25 %	384121321
15065	NC_017154	TGG	2	6	943029	943034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121321
15066	NC_017154	TC	3	6	943066	943071	0 %	50 %	0 %	50 %	384121321
15067	NC_017154	TCT	2	6	943085	943090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121321
15068	NC_017154	TTTAT	2	10	943196	943205	20 %	80 %	0 %	0 %	384121322
15069	NC_017154	CTG	2	6	943256	943261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121322
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15071	NC_017154	TGC	2	6	943416	943421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121322
15072	NC_017154	TTTGC	2	10	943424	943433	0 %	60 %	20 %	20 %	384121322
15073	NC_017154	TGGCT	2	10	943504	943513	0 %	40 %	40 %	20 %	384121322
15074	NC_017154	TGT	2	6	943618	943623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121322
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15080	NC_017154	TGG	2	6	943752	943757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121322
15081	NC_017154	GCTT	2	8	943902	943909	0 %	50 %	25 %	25 %	384121322
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15088	NC_017154	TA	3	6	944164	944169	50 %	50 %	0 %	0 %	384121322
15089	NC_017154	ATACG	2	10	944188	944197	40 %	20 %	20 %	20 %	384121322
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15091	NC_017154	GCG	2	6	944608	944613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121323
15092	NC_017154	TTC	2	6	944618	944623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121323
15093	NC_017154	CGG	2	6	944651	944656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121323
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15102	NC_017154	AACG	2	8	945154	945161	50 %	0 %	25 %	25 %	384121323
15103	NC_017154	TTTTG	2	10	945195	945204	0 %	80 %	20 %	0 %	384121323
15104	NC_017154	AAT	2	6	945210	945215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121323
15105	NC_017154	TTG	2	6	945260	945265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121323
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15107	NC_017154	ATC	2	6	945346	945351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121323
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15124	NC_017154	T	6	6	946758	946763	0 %	100 %	0 %	0 %	384121324
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15246	NC_017154	CT	3	6	953318	953323	0 %	50 %	0 %	50 %	384121329
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15354	NC_017154	GAAAT	2	10	957833	957842	60 %	20 %	20 %	0 %	384121329
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