MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_017154	GGT	2	6	877898	877903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
14003	NC_017154	CCA	3	9	877960	877968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121282
14004	NC_017154	CAA	2	6	878036	878041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121282
14005	NC_017154	AAC	2	6	878061	878066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121282
14006	NC_017154	CCA	2	6	878106	878111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121282
14007	NC_017154	CTG	2	6	878121	878126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14008	NC_017154	CTG	2	6	878171	878176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14009	NC_017154	TTG	2	6	878241	878246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121282
14010	NC_017154	GAC	2	6	878411	878416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14011	NC_017154	GCG	2	6	878434	878439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121282
14012	NC_017154	GGT	2	6	878510	878515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
14013	NC_017154	GCC	2	6	878556	878561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121282
14014	NC_017154	GGT	2	6	878585	878590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
14015	NC_017154	CGCCC	2	10	878618	878627	0 %	0 %	20 %	80 %	384121282
14016	NC_017154	TGC	2	6	878779	878784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14017	NC_017154	CAT	2	6	878803	878808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121282
14018	NC_017154	CGCC	2	8	878884	878891	0 %	0 %	25 %	75 %	384121282
14019	NC_017154	ATA	2	6	879024	879029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121282
14020	NC_017154	GCT	2	6	879131	879136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14021	NC_017154	CGC	2	6	879196	879201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121282
14022	NC_017154	CAC	2	6	879256	879261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121282
14023	NC_017154	GTTCAG	2	12	879293	879304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384121282
14024	NC_017154	GGC	2	6	879407	879412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121282
14025	NC_017154	GCC	2	6	879464	879469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121282
14026	NC_017154	CCCG	2	8	879485	879492	0 %	0 %	25 %	75 %	384121282
14027	NC_017154	CAG	2	6	879542	879547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14028	NC_017154	CGC	2	6	879565	879570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121282
14029	NC_017154	CCG	2	6	879709	879714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121282
14030	NC_017154	GGT	2	6	879719	879724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
14031	NC_017154	CCA	3	9	879781	879789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121282
14032	NC_017154	CCG	2	6	879792	879797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121282
14033	NC_017154	CAA	2	6	879857	879862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121282
14034	NC_017154	AAC	2	6	879882	879887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121282
14035	NC_017154	CTG	2	6	879942	879947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14036	NC_017154	GCC	2	6	879986	879991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121282
14037	NC_017154	CTG	2	6	879992	879997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14038	NC_017154	TTG	2	6	880144	880149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121282
14039	NC_017154	GCACC	2	10	880255	880264	20 %	0 %	20 %	60 %	384121282
14040	NC_017154	GTG	2	6	880317	880322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
14041	NC_017154	GGT	2	6	880328	880333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
14042	NC_017154	GCC	2	6	880374	880379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121282
14043	NC_017154	AGT	2	6	880403	880408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121282
14044	NC_017154	CGCCC	2	10	880436	880445	0 %	0 %	20 %	80 %	384121282
14045	NC_017154	GGT	2	6	880469	880474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
14046	NC_017154	TTC	2	6	880482	880487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121282
14047	NC_017154	TGT	2	6	880537	880542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121282
14048	NC_017154	GTTACT	2	12	880589	880600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384121282
14049	NC_017154	TTA	2	6	880680	880685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121282
14050	NC_017154	AGC	2	6	880752	880757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14051	NC_017154	ACT	2	6	880760	880765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121282
14052	NC_017154	TCG	2	6	880878	880883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14053	NC_017154	AGGT	2	8	880938	880945	25 %	25 %	50 %	0 %	384121282
14054	NC_017154	GGA	2	6	881003	881008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121282
14055	NC_017154	TAT	2	6	881038	881043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121282
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14057	NC_017154	TTA	2	6	881148	881153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121282
14058	NC_017154	TTG	2	6	881205	881210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121282
14059	NC_017154	GGA	2	6	881225	881230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384121282
14060	NC_017154	TGG	3	9	881287	881295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
14061	NC_017154	TAT	2	6	881296	881301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121282
14062	NC_017154	ACC	2	6	881381	881386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121282
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14064	NC_017154	CGC	2	6	881471	881476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121282
14065	NC_017154	GT	3	6	881575	881580	0 %	50 %	50 %	0 %	384121282
14066	NC_017154	GTTAC	2	10	881586	881595	20 %	40 %	20 %	20 %	384121282
14067	NC_017154	GCCA	2	8	881612	881619	25 %	0 %	25 %	50 %	384121282
14068	NC_017154	TCAG	2	8	881664	881671	25 %	25 %	25 %	25 %	384121282
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14071	NC_017154	CGG	2	6	881860	881865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121282
14072	NC_017154	CAT	2	6	881884	881889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121282
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14080	NC_017154	TAT	2	6	882199	882204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121282
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14082	NC_017154	TAT	2	6	882394	882399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121282
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14084	NC_017154	TGG	2	6	882556	882561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
14085	NC_017154	ATAA	2	8	882581	882588	75 %	25 %	0 %	0 %	384121282
14086	NC_017154	GTA	2	6	882668	882673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121282
14087	NC_017154	ACC	2	6	882732	882737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121282
14088	NC_017154	ATCA	2	8	882788	882795	50 %	25 %	0 %	25 %	384121282
14089	NC_017154	AAT	2	6	882857	882862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121282
14090	NC_017154	CTGC	2	8	882901	882908	0 %	25 %	25 %	50 %	384121282
14091	NC_017154	CAG	2	6	882925	882930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121282
14092	NC_017154	T	6	6	882987	882992	0 %	100 %	0 %	0 %	384121282
14093	NC_017154	CTCA	2	8	883091	883098	25 %	25 %	0 %	50 %	384121282
14094	NC_017154	AT	3	6	883152	883157	50 %	50 %	0 %	0 %	384121282
14095	NC_017154	CGT	2	6	884025	884030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121283
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14098	NC_017154	CTG	2	6	884457	884462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121283
14099	NC_017154	A	6	6	884467	884472	100 %	0 %	0 %	0 %	384121283
14100	NC_017154	TGT	2	6	884479	884484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121283
14101	NC_017154	T	7	7	884585	884591	0 %	100 %	0 %	0 %	384121283
14102	NC_017154	T	6	6	884879	884884	0 %	100 %	0 %	0 %	384121284
14103	NC_017154	CA	3	6	884928	884933	50 %	0 %	0 %	50 %	384121284
14104	NC_017154	TA	3	6	884959	884964	50 %	50 %	0 %	0 %	384121284
14105	NC_017154	AT	4	8	885063	885070	50 %	50 %	0 %	0 %	384121284
14106	NC_017154	CAT	2	6	885132	885137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121284
14107	NC_017154	GCAA	2	8	885189	885196	50 %	0 %	25 %	25 %	384121284
14108	NC_017154	ATTT	2	8	885202	885209	25 %	75 %	0 %	0 %	384121284
14109	NC_017154	GA	3	6	885262	885267	50 %	0 %	50 %	0 %	384121284
14110	NC_017154	TAC	2	6	885290	885295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121284
14111	NC_017154	ACA	3	9	885350	885358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121284
14112	NC_017154	GAT	2	6	885424	885429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121284
14113	NC_017154	GA	3	6	885441	885446	50 %	0 %	50 %	0 %	384121284
14114	NC_017154	ATC	2	6	885470	885475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121284
14115	NC_017154	ATTT	2	8	885476	885483	25 %	75 %	0 %	0 %	384121284
14116	NC_017154	A	6	6	885547	885552	100 %	0 %	0 %	0 %	384121284
14117	NC_017154	A	7	7	885586	885592	100 %	0 %	0 %	0 %	384121284
14118	NC_017154	A	6	6	885684	885689	100 %	0 %	0 %	0 %	384121284
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14120	NC_017154	TA	3	6	885704	885709	50 %	50 %	0 %	0 %	384121284
14121	NC_017154	AAT	2	6	885762	885767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121284
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14228	NC_017154	CAGC	2	8	891867	891874	25 %	0 %	25 %	50 %	384121287
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14234	NC_017154	ATT	2	6	892173	892178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121287
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14481	NC_017154	CAC	2	6	906155	906160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121297
14482	NC_017154	CTG	2	6	906169	906174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121297
14483	NC_017154	GTG	2	6	906175	906180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121297
14484	NC_017154	CCG	2	6	906199	906204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121297
14485	NC_017154	GTG	2	6	906214	906219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121297
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