MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017154	CTG	2	6	847962	847967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121271
13502	NC_017154	ACA	2	6	847997	848002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121271
13503	NC_017154	TTGAT	2	10	848071	848080	20 %	60 %	20 %	0 %	384121271
13504	NC_017154	CCG	2	6	848111	848116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121271
13505	NC_017154	ATAAG	2	10	848170	848179	60 %	20 %	20 %	0 %	384121271
13506	NC_017154	CACT	2	8	848192	848199	25 %	25 %	0 %	50 %	384121271
13507	NC_017154	CGTGG	2	10	848203	848212	0 %	20 %	60 %	20 %	384121271
13508	NC_017154	CCAGC	2	10	848268	848277	20 %	0 %	20 %	60 %	384121271
13509	NC_017154	TGATC	2	10	848402	848411	20 %	40 %	20 %	20 %	384121271
13510	NC_017154	GTT	2	6	848504	848509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121272
13511	NC_017154	GGC	2	6	848519	848524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121272
13512	NC_017154	C	8	8	848527	848534	0 %	0 %	0 %	100 %	384121272
13513	NC_017154	CTG	2	6	848548	848553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121272
13514	NC_017154	GCC	2	6	848561	848566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121272
13515	NC_017154	ATC	2	6	848603	848608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121272
13516	NC_017154	CTG	3	9	848641	848649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121272
13517	NC_017154	CAA	2	6	848710	848715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121272
13518	NC_017154	GCG	2	6	848726	848731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121272
13519	NC_017154	ACC	2	6	848921	848926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121272
13520	NC_017154	GTT	2	6	848942	848947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121272
13521	NC_017154	CGG	2	6	848982	848987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121272
13522	NC_017154	ACC	2	6	849048	849053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121272
13523	NC_017154	TAA	2	6	849079	849084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121272
13524	NC_017154	ATA	2	6	849107	849112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121272
13525	NC_017154	GTGA	2	8	849164	849171	25 %	25 %	50 %	0 %	384121272
13526	NC_017154	AAT	2	6	849390	849395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121272
13527	NC_017154	GAT	2	6	849422	849427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121272
13528	NC_017154	AGA	2	6	849513	849518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121272
13529	NC_017154	TCA	2	6	849581	849586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121272
13530	NC_017154	AAC	2	6	849608	849613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121272
13531	NC_017154	AC	3	6	849735	849740	50 %	0 %	0 %	50 %	384121272
13532	NC_017154	TCA	2	6	849755	849760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121272
13533	NC_017154	ACGCA	2	10	849769	849778	40 %	0 %	20 %	40 %	384121272
13534	NC_017154	CAG	2	6	849793	849798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121272
13535	NC_017154	ATA	2	6	849919	849924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121272
13536	NC_017154	GCCAC	2	10	849932	849941	20 %	0 %	20 %	60 %	384121272
13537	NC_017154	GCC	2	6	849960	849965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121272
13538	NC_017154	GGC	2	6	850018	850023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121272
13539	NC_017154	CCT	2	6	850041	850046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121272
13540	NC_017154	CAA	2	6	850147	850152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121272
13541	NC_017154	CAC	3	9	850182	850190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121272
13542	NC_017154	GCG	2	6	850215	850220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121272
13543	NC_017154	TGC	2	6	850235	850240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121272
13544	NC_017154	GCGA	2	8	850246	850253	25 %	0 %	50 %	25 %	384121272
13545	NC_017154	T	6	6	850264	850269	0 %	100 %	0 %	0 %	384121272
13546	NC_017154	CCGTTC	2	12	850294	850305	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384121272
13547	NC_017154	GGC	2	6	850310	850315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121272
13548	NC_017154	CAT	2	6	850350	850355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121272
13549	NC_017154	TA	3	6	850386	850391	50 %	50 %	0 %	0 %	384121272
13550	NC_017154	GACA	2	8	850539	850546	50 %	0 %	25 %	25 %	384121272
13551	NC_017154	AAT	2	6	850567	850572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121272
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13553	NC_017154	GCG	2	6	850638	850643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121272
13554	NC_017154	TGT	2	6	850682	850687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121272
13555	NC_017154	AAC	3	9	850688	850696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121272
13556	NC_017154	GCA	2	6	850773	850778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121272
13557	NC_017154	CAGG	2	8	850791	850798	25 %	0 %	50 %	25 %	384121272
13558	NC_017154	ATT	2	6	850819	850824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121272
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13561	NC_017154	CAT	2	6	851100	851105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121272
13562	NC_017154	GTC	2	6	851143	851148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121272
13563	NC_017154	CAA	2	6	851149	851154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121272
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13567	NC_017154	C	6	6	851371	851376	0 %	0 %	0 %	100 %	384121272
13568	NC_017154	CAT	2	6	851517	851522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121272
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13570	NC_017154	CAA	2	6	851565	851570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121272
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13572	NC_017154	GCC	2	6	851795	851800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121272
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13574	NC_017154	TAA	2	6	851819	851824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121272
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13578	NC_017154	CAATC	2	10	852075	852084	40 %	20 %	0 %	40 %	384121272
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13581	NC_017154	AACG	2	8	852107	852114	50 %	0 %	25 %	25 %	384121272
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13586	NC_017154	GCC	2	6	852265	852270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121272
13587	NC_017154	GACA	2	8	852271	852278	50 %	0 %	25 %	25 %	384121272
13588	NC_017154	GA	3	6	852302	852307	50 %	0 %	50 %	0 %	384121272
13589	NC_017154	GAT	2	6	852337	852342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121272
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13592	NC_017154	TCA	2	6	852374	852379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121272
13593	NC_017154	CAC	3	9	852406	852414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121272
13594	NC_017154	GGCT	2	8	852457	852464	0 %	25 %	50 %	25 %	384121272
13595	NC_017154	GCA	3	9	852506	852514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121272
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13599	NC_017154	GAA	2	6	853035	853040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121272
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13601	NC_017154	AAT	2	6	853179	853184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121272
13602	NC_017154	CTG	2	6	853336	853341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121272
13603	NC_017154	ACG	2	6	853453	853458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121272
13604	NC_017154	AAC	2	6	853524	853529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121272
13605	NC_017154	TGT	2	6	853574	853579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121272
13606	NC_017154	TATC	2	8	853635	853642	25 %	50 %	0 %	25 %	384121272
13607	NC_017154	GTT	2	6	853701	853706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121272
13608	NC_017154	CAA	2	6	853753	853758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121272
13609	NC_017154	CGA	2	6	853804	853809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121272
13610	NC_017154	AGC	2	6	853814	853819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121272
13611	NC_017154	CTC	2	6	853825	853830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121272
13612	NC_017154	CAT	2	6	853902	853907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121272
13613	NC_017154	CAAT	2	8	853914	853921	50 %	25 %	0 %	25 %	384121272
13614	NC_017154	AG	3	6	854008	854013	50 %	0 %	50 %	0 %	384121272
13615	NC_017154	ATACGC	2	12	854084	854095	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384121272
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13617	NC_017154	TGA	2	6	854132	854137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121272
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13619	NC_017154	TGC	2	6	854237	854242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121272
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13980	NC_017154	GCG	3	9	876613	876621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121282
13981	NC_017154	GTG	2	6	876678	876683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
13982	NC_017154	GGT	2	6	876689	876694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
13983	NC_017154	GCC	2	6	876735	876740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121282
13984	NC_017154	GGT	2	6	876830	876835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121282
13985	NC_017154	TTC	2	6	876843	876848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121282
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13988	NC_017154	CAT	2	6	876982	876987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121282
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13991	NC_017154	GCT	2	6	877310	877315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121282
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