MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017154	TGG	2	6	819928	819933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121258
13002	NC_017154	GGC	2	6	820050	820055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121258
13003	NC_017154	AG	3	6	820131	820136	50 %	0 %	50 %	0 %	384121258
13004	NC_017154	GGC	2	6	820158	820163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121258
13005	NC_017154	CCA	2	6	820202	820207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121258
13006	NC_017154	GTG	2	6	820225	820230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121258
13007	NC_017154	CAG	2	6	820245	820250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121258
13008	NC_017154	CCGC	2	8	820321	820328	0 %	0 %	25 %	75 %	384121258
13009	NC_017154	GGT	2	6	820347	820352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121258
13010	NC_017154	CGGT	2	8	820381	820388	0 %	25 %	50 %	25 %	384121258
13011	NC_017154	GCCA	2	8	820423	820430	25 %	0 %	25 %	50 %	384121258
13012	NC_017154	CGGTCA	2	12	820472	820483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384121258
13013	NC_017154	TCG	2	6	820489	820494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121258
13014	NC_017154	GCC	2	6	820509	820514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121258
13015	NC_017154	CAG	2	6	820530	820535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121258
13016	NC_017154	TGA	2	6	820550	820555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121258
13017	NC_017154	CGAG	2	8	820580	820587	25 %	0 %	50 %	25 %	384121258
13018	NC_017154	GC	3	6	820592	820597	0 %	0 %	50 %	50 %	384121258
13019	NC_017154	GCG	2	6	820651	820656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121258
13020	NC_017154	CGG	2	6	820661	820666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121258
13021	NC_017154	TGG	3	9	820685	820693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121258
13022	NC_017154	C	6	6	820734	820739	0 %	0 %	0 %	100 %	384121258
13023	NC_017154	TGC	2	6	820808	820813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121258
13024	NC_017154	CAT	2	6	820964	820969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121258
13025	NC_017154	GCC	2	6	821100	821105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121258
13026	NC_017154	GCC	2	6	821115	821120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121258
13027	NC_017154	CTG	2	6	821172	821177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121258
13028	NC_017154	GC	3	6	821186	821191	0 %	0 %	50 %	50 %	384121258
13029	NC_017154	GATCA	2	10	821199	821208	40 %	20 %	20 %	20 %	384121258
13030	NC_017154	GTT	2	6	821259	821264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121258
13031	NC_017154	ATT	2	6	821304	821309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121258
13032	NC_017154	GGT	2	6	821409	821414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121258
13033	NC_017154	TA	3	6	821444	821449	50 %	50 %	0 %	0 %	384121258
13034	NC_017154	AG	3	6	821506	821511	50 %	0 %	50 %	0 %	384121258
13035	NC_017154	GAA	2	6	821593	821598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121258
13036	NC_017154	TTG	2	6	821605	821610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121258
13037	NC_017154	CTG	2	6	821626	821631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121258
13038	NC_017154	TGA	2	6	821651	821656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121258
13039	NC_017154	CTC	2	6	821841	821846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384121258
13040	NC_017154	AATAT	2	10	821902	821911	60 %	40 %	0 %	0 %	384121258
13041	NC_017154	GCT	2	6	821931	821936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121258
13042	NC_017154	ATT	2	6	821973	821978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121258
13043	NC_017154	TCA	2	6	822080	822085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121258
13044	NC_017154	AAT	2	6	822095	822100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121258
13045	NC_017154	TAT	2	6	822104	822109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121258
13046	NC_017154	AAT	2	6	822182	822187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121258
13047	NC_017154	ATT	2	6	822267	822272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121258
13048	NC_017154	GCT	2	6	822435	822440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121258
13049	NC_017154	ATC	2	6	822502	822507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121258
13050	NC_017154	ATG	2	6	822634	822639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121258
13051	NC_017154	GAT	2	6	822684	822689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121258
13052	NC_017154	C	7	7	822726	822732	0 %	0 %	0 %	100 %	384121258
13053	NC_017154	TTG	2	6	822736	822741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121258
13054	NC_017154	ACG	2	6	822743	822748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121258
13055	NC_017154	CAA	2	6	822785	822790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121258
13056	NC_017154	AAAT	2	8	822866	822873	75 %	25 %	0 %	0 %	384121258
13057	NC_017154	GCC	2	6	823576	823581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121259
13058	NC_017154	CAG	2	6	823618	823623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121259
13059	NC_017154	CCGC	2	8	823673	823680	0 %	0 %	25 %	75 %	384121259
13060	NC_017154	TG	3	6	823788	823793	0 %	50 %	50 %	0 %	384121259
13061	NC_017154	GCG	2	6	823795	823800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121259
13062	NC_017154	GGT	2	6	823801	823806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121259
13063	NC_017154	CAG	2	6	824242	824247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121259
13064	NC_017154	CA	3	6	824300	824305	50 %	0 %	0 %	50 %	384121259
13065	NC_017154	TGG	2	6	824328	824333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121259
13066	NC_017154	TGG	2	6	824354	824359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121259
13067	NC_017154	GGC	2	6	824476	824481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121259
13068	NC_017154	AG	3	6	824557	824562	50 %	0 %	50 %	0 %	384121259
13069	NC_017154	GGC	2	6	824584	824589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121259
13070	NC_017154	CCA	2	6	824628	824633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121259
13071	NC_017154	GTG	2	6	824651	824656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121259
13072	NC_017154	CAG	2	6	824671	824676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121259
13073	NC_017154	CCGC	2	8	824747	824754	0 %	0 %	25 %	75 %	384121259
13074	NC_017154	GGT	2	6	824773	824778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121259
13075	NC_017154	CGGT	2	8	824807	824814	0 %	25 %	50 %	25 %	384121259
13076	NC_017154	GCCA	2	8	824849	824856	25 %	0 %	25 %	50 %	384121259
13077	NC_017154	CGGTCA	2	12	824898	824909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384121259
13078	NC_017154	TCG	2	6	824915	824920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121259
13079	NC_017154	GCC	2	6	824935	824940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121259
13080	NC_017154	CAG	2	6	824956	824961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121259
13081	NC_017154	TGA	2	6	824976	824981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121259
13082	NC_017154	GCG	2	6	825077	825082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121259
13083	NC_017154	CGG	2	6	825087	825092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121259
13084	NC_017154	TGG	3	9	825111	825119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121259
13085	NC_017154	C	6	6	825160	825165	0 %	0 %	0 %	100 %	384121259
13086	NC_017154	TGT	2	6	825237	825242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121259
13087	NC_017154	CAT	2	6	825390	825395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121259
13088	NC_017154	GCC	2	6	825526	825531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121259
13089	NC_017154	ATT	2	6	825706	825711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121260
13090	NC_017154	TGC	2	6	825731	825736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121260
13091	NC_017154	CAC	2	6	825795	825800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121260
13092	NC_017154	GGT	2	6	825810	825815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121260
13093	NC_017154	ACT	2	6	825852	825857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121260
13094	NC_017154	GCA	2	6	825862	825867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121260
13095	NC_017154	CTGA	2	8	825906	825913	25 %	25 %	25 %	25 %	384121260
13096	NC_017154	CGG	2	6	825983	825988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121260
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13098	NC_017154	ATT	2	6	826041	826046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121260
13099	NC_017154	TGA	2	6	826052	826057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121260
13100	NC_017154	TGG	2	6	826061	826066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121260
13101	NC_017154	CAT	2	6	826089	826094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121260
13102	NC_017154	GTA	2	6	826194	826199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121260
13103	NC_017154	ATT	2	6	826209	826214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121260
13104	NC_017154	GTC	2	6	826236	826241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121260
13105	NC_017154	TAT	2	6	826421	826426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121260
13106	NC_017154	ATATTG	2	12	826471	826482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384121260
13107	NC_017154	CGC	2	6	826488	826493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384121260
13108	NC_017154	TAT	2	6	826508	826513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121260
13109	NC_017154	T	6	6	826546	826551	0 %	100 %	0 %	0 %	384121260
13110	NC_017154	ATTA	2	8	826560	826567	50 %	50 %	0 %	0 %	384121260
13111	NC_017154	GTT	2	6	826590	826595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121260
13112	NC_017154	GTG	2	6	826648	826653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121260
13113	NC_017154	CAGA	2	8	826700	826707	50 %	0 %	25 %	25 %	384121260
13114	NC_017154	GA	3	6	826801	826806	50 %	0 %	50 %	0 %	384121260
13115	NC_017154	GTT	2	6	826839	826844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121260
13116	NC_017154	GGT	2	6	826947	826952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121260
13117	NC_017154	GAT	2	6	827088	827093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121260
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13119	NC_017154	CAA	2	6	827189	827194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121260
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