MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017154	GGC	2	6	510641	510646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121012
8002	NC_017154	TGC	2	6	510683	510688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121012
8003	NC_017154	CAT	2	6	510730	510735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121012
8004	NC_017154	AGTC	2	8	510798	510805	25 %	25 %	25 %	25 %	384121012
8005	NC_017154	GGT	2	6	510869	510874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121012
8006	NC_017154	ATT	2	6	510923	510928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121012
8007	NC_017154	CAG	2	6	510977	510982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121012
8008	NC_017154	CAGC	2	8	511007	511014	25 %	0 %	25 %	50 %	384121012
8009	NC_017154	CTT	2	6	511089	511094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121012
8010	NC_017154	CG	3	6	511109	511114	0 %	0 %	50 %	50 %	384121012
8011	NC_017154	ATG	2	6	511179	511184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121012
8012	NC_017154	TGA	2	6	511210	511215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121012
8013	NC_017154	CGG	2	6	511267	511272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121012
8014	NC_017154	CAA	2	6	511373	511378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121012
8015	NC_017154	TGA	2	6	511416	511421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121012
8016	NC_017154	AAC	2	6	511442	511447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384121012
8017	NC_017154	GGC	2	6	511477	511482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121012
8018	NC_017154	GCTG	2	8	511561	511568	0 %	25 %	50 %	25 %	384121012
8019	NC_017154	GAA	2	6	511583	511588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121012
8020	NC_017154	ATT	2	6	511589	511594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121012
8021	NC_017154	TAC	2	6	511601	511606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121012
8022	NC_017154	AAG	2	6	511614	511619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384121012
8023	NC_017154	TAA	2	6	511633	511638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384121012
8024	NC_017154	TAT	2	6	511779	511784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121012
8025	NC_017154	CCGT	2	8	511785	511792	0 %	25 %	25 %	50 %	384121012
8026	NC_017154	GGT	2	6	511810	511815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121012
8027	NC_017154	GGC	2	6	511822	511827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121012
8028	NC_017154	GCT	2	6	511831	511836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121012
8029	NC_017154	CGG	2	6	511872	511877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121012
8030	NC_017154	TACGA	2	10	512060	512069	40 %	20 %	20 %	20 %	384121012
8031	NC_017154	GGT	2	6	512078	512083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121012
8032	NC_017154	ATGC	2	8	512144	512151	25 %	25 %	25 %	25 %	384121012
8033	NC_017154	GC	3	6	512499	512504	0 %	0 %	50 %	50 %	384121013
8034	NC_017154	GGATCA	2	12	512508	512519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384121013
8035	NC_017154	CCA	2	6	512530	512535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384121013
8036	NC_017154	GAT	2	6	512554	512559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121013
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8038	NC_017154	TGAG	2	8	512688	512695	25 %	25 %	50 %	0 %	384121013
8039	NC_017154	TAT	2	6	512712	512717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121013
8040	NC_017154	ACTT	2	8	512727	512734	25 %	50 %	0 %	25 %	384121013
8041	NC_017154	CAG	2	6	512746	512751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121013
8042	NC_017154	CGT	2	6	512896	512901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121013
8043	NC_017154	GGC	2	6	512905	512910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121013
8044	NC_017154	GCG	2	6	512914	512919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121013
8045	NC_017154	A	7	7	512947	512953	100 %	0 %	0 %	0 %	384121013
8046	NC_017154	CGA	2	6	512994	512999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121013
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8049	NC_017154	CAT	2	6	513378	513383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384121014
8050	NC_017154	CAG	2	6	513384	513389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121014
8051	NC_017154	GTG	2	6	513534	513539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121014
8052	NC_017154	GCTG	2	8	513718	513725	0 %	25 %	50 %	25 %	384121014
8053	NC_017154	GTT	2	6	513754	513759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384121014
8054	NC_017154	CGG	3	9	513773	513781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121014
8055	NC_017154	ATTA	2	8	513866	513873	50 %	50 %	0 %	0 %	384121014
8056	NC_017154	TTA	2	6	513915	513920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121014
8057	NC_017154	GGC	2	6	513962	513967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121014
8058	NC_017154	GGT	2	6	514097	514102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121014
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8061	NC_017154	GCT	2	6	514360	514365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121015
8062	NC_017154	GGT	2	6	514444	514449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384121015
8063	NC_017154	CTT	2	6	514504	514509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384121015
8064	NC_017154	TCG	2	6	514524	514529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384121015
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8085	NC_017154	AAAT	2	8	516867	516874	75 %	25 %	0 %	0 %	384121018
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8112	NC_017154	ATAAG	2	10	518186	518195	60 %	20 %	20 %	0 %	384121019
8113	NC_017154	ATCA	2	8	518288	518295	50 %	25 %	0 %	25 %	384121020
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8120	NC_017154	GTA	2	6	518785	518790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121021
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8122	NC_017154	CGG	2	6	518895	518900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384121021
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8482	NC_017154	TC	3	6	542523	542528	0 %	50 %	0 %	50 %	384121038
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8488	NC_017154	GCA	2	6	542888	542893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121039
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8490	NC_017154	GAT	2	6	543174	543179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384121039
8491	NC_017154	ATT	2	6	543205	543210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384121039
8492	NC_017154	CAG	2	6	543294	543299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384121039
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