MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
71501	NC_017154	TAA	2	6	4617486	4617491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124201
71502	NC_017154	CAT	2	6	4617502	4617507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124201
71503	NC_017154	CAATA	2	10	4617523	4617532	60 %	20 %	0 %	20 %	384124201
71504	NC_017154	CA	3	6	4617657	4617662	50 %	0 %	0 %	50 %	384124201
71505	NC_017154	GTG	2	6	4617668	4617673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124201
71506	NC_017154	A	6	6	4617723	4617728	100 %	0 %	0 %	0 %	384124201
71507	NC_017154	GAA	2	6	4617754	4617759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124201
71508	NC_017154	CAC	2	6	4617868	4617873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124201
71509	NC_017154	GCC	2	6	4617881	4617886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124201
71510	NC_017154	CAG	2	6	4617919	4617924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124201
71511	NC_017154	GAC	2	6	4617974	4617979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124202
71512	NC_017154	GAT	2	6	4618022	4618027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124202
71513	NC_017154	GTTTCA	2	12	4618077	4618088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384124202
71514	NC_017154	TAA	2	6	4618150	4618155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124202
71515	NC_017154	AT	3	6	4618161	4618166	50 %	50 %	0 %	0 %	384124202
71516	NC_017154	GCA	2	6	4618257	4618262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124202
71517	NC_017154	CGC	2	6	4618282	4618287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124202
71518	NC_017154	CGCA	2	8	4618295	4618302	25 %	0 %	25 %	50 %	384124202
71519	NC_017154	GCCAG	2	10	4618372	4618381	20 %	0 %	40 %	40 %	384124202
71520	NC_017154	AAG	2	6	4618432	4618437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124202
71521	NC_017154	TGGC	2	8	4618449	4618456	0 %	25 %	50 %	25 %	384124202
71522	NC_017154	AAT	2	6	4618473	4618478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124202
71523	NC_017154	CAG	2	6	4618484	4618489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124202
71524	NC_017154	CCA	2	6	4618594	4618599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124202
71525	NC_017154	A	6	6	4618629	4618634	100 %	0 %	0 %	0 %	384124202
71526	NC_017154	CCAA	2	8	4618646	4618653	50 %	0 %	0 %	50 %	384124202
71527	NC_017154	TCAG	2	8	4618677	4618684	25 %	25 %	25 %	25 %	384124202
71528	NC_017154	ATG	2	6	4618685	4618690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124202
71529	NC_017154	CAC	2	6	4618923	4618928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124203
71530	NC_017154	CTG	2	6	4619025	4619030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124203
71531	NC_017154	CAG	2	6	4619134	4619139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124203
71532	NC_017154	CAT	2	6	4619154	4619159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124203
71533	NC_017154	ATC	2	6	4619215	4619220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124203
71534	NC_017154	TCA	2	6	4619402	4619407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124203
71535	NC_017154	GCA	2	6	4619423	4619428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124203
71536	NC_017154	T	6	6	4619440	4619445	0 %	100 %	0 %	0 %	384124203
71537	NC_017154	CCA	2	6	4619547	4619552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124203
71538	NC_017154	G	6	6	4619585	4619590	0 %	0 %	100 %	0 %	384124203
71539	NC_017154	GCTT	2	8	4619624	4619631	0 %	50 %	25 %	25 %	384124203
71540	NC_017154	ATC	2	6	4619635	4619640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124203
71541	NC_017154	T	8	8	4619709	4619716	0 %	100 %	0 %	0 %	384124203
71542	NC_017154	CTG	2	6	4619969	4619974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124204
71543	NC_017154	GCTTTA	2	12	4619999	4620010	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384124204
71544	NC_017154	TGGCT	2	10	4620031	4620040	0 %	40 %	40 %	20 %	384124204
71545	NC_017154	TTC	2	6	4620064	4620069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124204
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71547	NC_017154	TTGA	2	8	4620107	4620114	25 %	50 %	25 %	0 %	384124204
71548	NC_017154	ATC	2	6	4620169	4620174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124204
71549	NC_017154	G	6	6	4620216	4620221	0 %	0 %	100 %	0 %	384124204
71550	NC_017154	GAT	2	6	4620280	4620285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124204
71551	NC_017154	CAC	2	6	4620295	4620300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124204
71552	NC_017154	AAT	2	6	4620361	4620366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124204
71553	NC_017154	AGA	2	6	4620439	4620444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124204
71554	NC_017154	ATT	2	6	4620451	4620456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124204
71555	NC_017154	CTTT	2	8	4620465	4620472	0 %	75 %	0 %	25 %	384124204
71556	NC_017154	AACAT	2	10	4620476	4620485	60 %	20 %	0 %	20 %	384124204
71557	NC_017154	AAT	2	6	4620506	4620511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124204
71558	NC_017154	ATT	2	6	4620922	4620927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124205
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71566	NC_017154	TCA	2	6	4621117	4621122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124205
71567	NC_017154	ATCC	2	8	4621196	4621203	25 %	25 %	0 %	50 %	384124205
71568	NC_017154	CAT	2	6	4621222	4621227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124205
71569	NC_017154	GTTGAT	2	12	4621279	4621290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384124205
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71571	NC_017154	ATG	2	6	4621419	4621424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124205
71572	NC_017154	CA	3	6	4621427	4621432	50 %	0 %	0 %	50 %	384124205
71573	NC_017154	TCA	2	6	4621437	4621442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124205
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71578	NC_017154	TTTA	2	8	4621622	4621629	25 %	75 %	0 %	0 %	384124205
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71583	NC_017154	GCT	2	6	4622026	4622031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124206
71584	NC_017154	GCCC	2	8	4622035	4622042	0 %	0 %	25 %	75 %	384124206
71585	NC_017154	GCT	2	6	4622094	4622099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124206
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71588	NC_017154	TAA	2	6	4622285	4622290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124206
71589	NC_017154	CCGC	2	8	4622302	4622309	0 %	0 %	25 %	75 %	384124206
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71591	NC_017154	TAG	2	6	4622448	4622453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124206
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71596	NC_017154	CAA	2	6	4623069	4623074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124207
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71600	NC_017154	CCCG	2	8	4623247	4623254	0 %	0 %	25 %	75 %	384124207
71601	NC_017154	TGG	3	9	4623262	4623270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124207
71602	NC_017154	CGG	2	6	4623428	4623433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124207
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71604	NC_017154	TAGA	2	8	4623520	4623527	50 %	25 %	25 %	0 %	384124208
71605	NC_017154	TAA	2	6	4623544	4623549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124208
71606	NC_017154	CGG	2	6	4623580	4623585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124208
71607	NC_017154	TTCTGC	2	12	4623599	4623610	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384124208
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