MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017154	T	7	7	415309	415315	0 %	100 %	0 %	0 %	384120941
6502	NC_017154	GGC	2	6	415323	415328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120941
6503	NC_017154	CCG	2	6	415451	415456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120941
6504	NC_017154	GCC	2	6	415540	415545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120941
6505	NC_017154	ATG	2	6	415609	415614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120941
6506	NC_017154	CTG	2	6	416001	416006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120942
6507	NC_017154	GCT	2	6	416019	416024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120942
6508	NC_017154	CCA	2	6	416091	416096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120942
6509	NC_017154	ACC	2	6	416117	416122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120942
6510	NC_017154	AAC	2	6	416168	416173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120942
6511	NC_017154	CGG	2	6	416184	416189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120942
6512	NC_017154	CGG	3	9	416235	416243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120942
6513	NC_017154	TTC	2	6	416311	416316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120942
6514	NC_017154	CGG	2	6	416365	416370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120942
6515	NC_017154	CGG	2	6	416385	416390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120942
6516	NC_017154	CCA	2	6	416397	416402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120942
6517	NC_017154	CA	3	6	416422	416427	50 %	0 %	0 %	50 %	384120942
6518	NC_017154	TTG	2	6	416453	416458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120942
6519	NC_017154	GCCC	2	8	416463	416470	0 %	0 %	25 %	75 %	384120942
6520	NC_017154	ATA	2	6	416495	416500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120942
6521	NC_017154	TGC	2	6	416525	416530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120942
6522	NC_017154	CAT	2	6	416593	416598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120942
6523	NC_017154	CGA	2	6	416622	416627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120942
6524	NC_017154	TCT	2	6	416679	416684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120942
6525	NC_017154	ATA	2	6	416699	416704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120942
6526	NC_017154	A	7	7	416734	416740	100 %	0 %	0 %	0 %	384120942
6527	NC_017154	AAG	2	6	416751	416756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120942
6528	NC_017154	GCC	2	6	416777	416782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120942
6529	NC_017154	GCACC	2	10	416910	416919	20 %	0 %	20 %	60 %	384120942
6530	NC_017154	AT	3	6	416981	416986	50 %	50 %	0 %	0 %	384120942
6531	NC_017154	TCA	2	6	416997	417002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120942
6532	NC_017154	TCA	2	6	417042	417047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120942
6533	NC_017154	GAG	2	6	417704	417709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384120943
6534	NC_017154	CACCC	2	10	417752	417761	20 %	0 %	0 %	80 %	384120943
6535	NC_017154	TCAG	2	8	417776	417783	25 %	25 %	25 %	25 %	384120943
6536	NC_017154	AGC	2	6	417876	417881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120943
6537	NC_017154	TTA	2	6	417929	417934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120943
6538	NC_017154	ACG	2	6	418004	418009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120943
6539	NC_017154	CGCT	2	8	418031	418038	0 %	25 %	25 %	50 %	384120943
6540	NC_017154	TAG	2	6	418080	418085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120943
6541	NC_017154	TCG	2	6	418110	418115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120943
6542	NC_017154	CAGC	2	8	418132	418139	25 %	0 %	25 %	50 %	384120943
6543	NC_017154	TGC	2	6	418150	418155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120943
6544	NC_017154	ACGTGA	2	12	418168	418179	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384120943
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6546	NC_017154	TCCC	2	8	418240	418247	0 %	25 %	0 %	75 %	384120943
6547	NC_017154	AGCA	2	8	418248	418255	50 %	0 %	25 %	25 %	384120943
6548	NC_017154	GTG	2	6	418350	418355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120943
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6550	NC_017154	TGC	2	6	418420	418425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120943
6551	NC_017154	AATC	2	8	418445	418452	50 %	25 %	0 %	25 %	384120943
6552	NC_017154	TGG	2	6	418479	418484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120943
6553	NC_017154	TCT	2	6	418489	418494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120943
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6555	NC_017154	TGG	3	9	418608	418616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120943
6556	NC_017154	TCAA	2	8	418656	418663	50 %	25 %	0 %	25 %	384120943
6557	NC_017154	AGA	2	6	418729	418734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120943
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6559	NC_017154	CG	3	6	418874	418879	0 %	0 %	50 %	50 %	384120943
6560	NC_017154	GAT	2	6	418975	418980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120943
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6562	NC_017154	GGA	2	6	418990	418995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384120943
6563	NC_017154	CGA	2	6	419062	419067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120943
6564	NC_017154	ATG	2	6	419084	419089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120943
6565	NC_017154	TCA	2	6	419112	419117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120943
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6567	NC_017154	CTG	2	6	419180	419185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120943
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6569	NC_017154	GGC	2	6	419317	419322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120943
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6572	NC_017154	CTG	2	6	419492	419497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120943
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6585	NC_017154	T	6	6	419856	419861	0 %	100 %	0 %	0 %	384120943
6586	NC_017154	TGC	2	6	419940	419945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120943
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6588	NC_017154	CGC	2	6	420192	420197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120944
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6592	NC_017154	TGA	2	6	420363	420368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120944
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6599	NC_017154	GGCT	2	8	421478	421485	0 %	25 %	50 %	25 %	384120945
6600	NC_017154	GATC	2	8	421568	421575	25 %	25 %	25 %	25 %	384120945
6601	NC_017154	ATA	2	6	421582	421587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120945
6602	NC_017154	ATGTTC	2	12	421602	421613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384120945
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6604	NC_017154	GC	3	6	421729	421734	0 %	0 %	50 %	50 %	384120945
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6609	NC_017154	TGAACC	2	12	421959	421970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384120945
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6991	NC_017154	CAG	2	6	448626	448631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120964
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