MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68501	NC_017154	ACGG	2	8	4421445	4421452	25 %	0 %	50 %	25 %	384124058
68502	NC_017154	ACA	2	6	4421478	4421483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124058
68503	NC_017154	CAGCCG	2	12	4421522	4421533	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124058
68504	NC_017154	CGG	2	6	4421567	4421572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124058
68505	NC_017154	GC	3	6	4421579	4421584	0 %	0 %	50 %	50 %	384124058
68506	NC_017154	CGT	2	6	4421608	4421613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124058
68507	NC_017154	TAT	3	9	4421638	4421646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124058
68508	NC_017154	TTA	2	6	4421658	4421663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124058
68509	NC_017154	GAGC	2	8	4421668	4421675	25 %	0 %	50 %	25 %	384124058
68510	NC_017154	TCG	2	6	4421938	4421943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124059
68511	NC_017154	CAT	2	6	4421986	4421991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124059
68512	NC_017154	ATT	2	6	4421993	4421998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124059
68513	NC_017154	AGA	2	6	4422007	4422012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124059
68514	NC_017154	CAG	2	6	4422016	4422021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124059
68515	NC_017154	CGC	2	6	4422107	4422112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124059
68516	NC_017154	ATT	3	9	4422197	4422205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124059
68517	NC_017154	CCG	2	6	4422249	4422254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124059
68518	NC_017154	CAC	2	6	4422317	4422322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124059
68519	NC_017154	CTG	2	6	4422357	4422362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124059
68520	NC_017154	TAT	2	6	4422379	4422384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124059
68521	NC_017154	GGT	2	6	4422425	4422430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124059
68522	NC_017154	TTC	2	6	4422483	4422488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124059
68523	NC_017154	GGT	2	6	4422500	4422505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124059
68524	NC_017154	TGT	2	6	4422509	4422514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124059
68525	NC_017154	TCG	2	6	4422532	4422537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124059
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68527	NC_017154	TCG	2	6	4422628	4422633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124059
68528	NC_017154	TTGC	2	8	4422639	4422646	0 %	50 %	25 %	25 %	384124059
68529	NC_017154	ATT	2	6	4422740	4422745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124059
68530	NC_017154	CAGTGT	2	12	4422758	4422769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384124059
68531	NC_017154	CCAA	2	8	4422852	4422859	50 %	0 %	0 %	50 %	384124059
68532	NC_017154	TTA	2	6	4422891	4422896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124059
68533	NC_017154	CAC	2	6	4422928	4422933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124059
68534	NC_017154	ACA	2	6	4422987	4422992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124059
68535	NC_017154	CTTC	2	8	4423185	4423192	0 %	50 %	0 %	50 %	384124059
68536	NC_017154	TTG	2	6	4423237	4423242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124059
68537	NC_017154	TGC	2	6	4423257	4423262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124059
68538	NC_017154	C	6	6	4423262	4423267	0 %	0 %	0 %	100 %	384124059
68539	NC_017154	GAA	2	6	4423307	4423312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124059
68540	NC_017154	CT	3	6	4423452	4423457	0 %	50 %	0 %	50 %	384124059
68541	NC_017154	CCCA	2	8	4423489	4423496	25 %	0 %	0 %	75 %	384124059
68542	NC_017154	TGG	2	6	4423516	4423521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124059
68543	NC_017154	TGA	2	6	4423541	4423546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124059
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68545	NC_017154	GTCA	2	8	4423586	4423593	25 %	25 %	25 %	25 %	384124059
68546	NC_017154	CAT	2	6	4423639	4423644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124059
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68548	NC_017154	GA	3	6	4423770	4423775	50 %	0 %	50 %	0 %	384124059
68549	NC_017154	ATTG	2	8	4423829	4423836	25 %	50 %	25 %	0 %	384124059
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68551	NC_017154	GTC	2	6	4424010	4424015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124059
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68553	NC_017154	CCA	2	6	4424139	4424144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124059
68554	NC_017154	CAT	2	6	4424194	4424199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124059
68555	NC_017154	CAT	2	6	4424248	4424253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124059
68556	NC_017154	CAA	2	6	4424290	4424295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124059
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68559	NC_017154	CATT	2	8	4424458	4424465	25 %	50 %	0 %	25 %	384124059
68560	NC_017154	TTG	2	6	4424526	4424531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124059
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68570	NC_017154	TG	3	6	4425175	4425180	0 %	50 %	50 %	0 %	384124059
68571	NC_017154	CGT	2	6	4425182	4425187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124059
68572	NC_017154	GTA	2	6	4425204	4425209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124059
68573	NC_017154	GCT	2	6	4425221	4425226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124059
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68577	NC_017154	GATC	2	8	4425535	4425542	25 %	25 %	25 %	25 %	384124059
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68581	NC_017154	TTG	2	6	4425870	4425875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124059
68582	NC_017154	TCA	2	6	4425880	4425885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124059
68583	NC_017154	GATT	2	8	4425960	4425967	25 %	50 %	25 %	0 %	384124059
68584	NC_017154	ACG	2	6	4426051	4426056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124059
68585	NC_017154	CAA	2	6	4426087	4426092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124059
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68587	NC_017154	GTC	2	6	4426200	4426205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124059
68588	NC_017154	TGA	2	6	4426211	4426216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124059
68589	NC_017154	CGCCA	2	10	4426262	4426271	20 %	0 %	20 %	60 %	384124059
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68599	NC_017154	ACC	2	6	4426827	4426832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124059
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68603	NC_017154	CGG	2	6	4427119	4427124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124059
68604	NC_017154	TGG	2	6	4427284	4427289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124059
68605	NC_017154	GGT	2	6	4427354	4427359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124059
68606	NC_017154	GTCGCT	2	12	4427435	4427446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124059
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68613	NC_017154	GGT	2	6	4427933	4427938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124059
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