MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65501	NC_017154	CTA	2	6	4219339	4219344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123904
65502	NC_017154	CGCC	2	8	4219422	4219429	0 %	0 %	25 %	75 %	384123904
65503	NC_017154	ATAG	2	8	4219433	4219440	50 %	25 %	25 %	0 %	384123904
65504	NC_017154	GTT	2	6	4219456	4219461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123904
65505	NC_017154	T	6	6	4219586	4219591	0 %	100 %	0 %	0 %	384123904
65506	NC_017154	CTG	2	6	4219670	4219675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123904
65507	NC_017154	CATC	2	8	4219717	4219724	25 %	25 %	0 %	50 %	384123904
65508	NC_017154	GAAA	2	8	4219751	4219758	75 %	0 %	25 %	0 %	384123904
65509	NC_017154	AAG	2	6	4219759	4219764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123904
65510	NC_017154	CTG	2	6	4220011	4220016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123905
65511	NC_017154	TGG	2	6	4220026	4220031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123905
65512	NC_017154	AAT	2	6	4220083	4220088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123905
65513	NC_017154	GTG	2	6	4220139	4220144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123905
65514	NC_017154	CAT	2	6	4220158	4220163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123905
65515	NC_017154	TCA	2	6	4220187	4220192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123905
65516	NC_017154	CAT	2	6	4220246	4220251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123905
65517	NC_017154	ACC	2	6	4220292	4220297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123905
65518	NC_017154	TGG	2	6	4220321	4220326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123905
65519	NC_017154	CAA	2	6	4220338	4220343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123905
65520	NC_017154	GGT	2	6	4220418	4220423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123905
65521	NC_017154	AT	3	6	4220565	4220570	50 %	50 %	0 %	0 %	384123905
65522	NC_017154	CAC	2	6	4220627	4220632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123905
65523	NC_017154	CAC	2	6	4220775	4220780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123905
65524	NC_017154	CAC	3	9	4220797	4220805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123905
65525	NC_017154	TAAT	2	8	4220824	4220831	50 %	50 %	0 %	0 %	384123905
65526	NC_017154	CTG	2	6	4220849	4220854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123905
65527	NC_017154	GTG	2	6	4220923	4220928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123905
65528	NC_017154	TCT	2	6	4220934	4220939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123905
65529	NC_017154	CAG	2	6	4220943	4220948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123905
65530	NC_017154	AAT	2	6	4221120	4221125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123905
65531	NC_017154	TCT	2	6	4221153	4221158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123905
65532	NC_017154	CCCCAT	2	12	4221161	4221172	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384123905
65533	NC_017154	ACA	2	6	4221205	4221210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123905
65534	NC_017154	CCA	2	6	4221255	4221260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123905
65535	NC_017154	GGCT	2	8	4221312	4221319	0 %	25 %	50 %	25 %	384123905
65536	NC_017154	C	6	6	4221334	4221339	0 %	0 %	0 %	100 %	384123905
65537	NC_017154	CGG	2	6	4221397	4221402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123905
65538	NC_017154	TATT	2	8	4221654	4221661	25 %	75 %	0 %	0 %	384123906
65539	NC_017154	ATT	2	6	4221799	4221804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123906
65540	NC_017154	G	7	7	4221859	4221865	0 %	0 %	100 %	0 %	384123906
65541	NC_017154	GATAA	2	10	4221945	4221954	60 %	20 %	20 %	0 %	384123906
65542	NC_017154	ATT	2	6	4221993	4221998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123906
65543	NC_017154	TGT	2	6	4222060	4222065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123906
65544	NC_017154	TCA	2	6	4222256	4222261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123907
65545	NC_017154	AAC	2	6	4222331	4222336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123907
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65547	NC_017154	ACA	2	6	4222460	4222465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123907
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65551	NC_017154	C	7	7	4222584	4222590	0 %	0 %	0 %	100 %	384123907
65552	NC_017154	TAG	2	6	4222634	4222639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123907
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65555	NC_017154	CAT	2	6	4222812	4222817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123907
65556	NC_017154	AATC	2	8	4222836	4222843	50 %	25 %	0 %	25 %	384123907
65557	NC_017154	GTCA	2	8	4222885	4222892	25 %	25 %	25 %	25 %	384123907
65558	NC_017154	ACGC	2	8	4222923	4222930	25 %	0 %	25 %	50 %	384123907
65559	NC_017154	T	6	6	4222984	4222989	0 %	100 %	0 %	0 %	384123907
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65563	NC_017154	GAA	2	6	4223099	4223104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123907
65564	NC_017154	TTG	2	6	4223110	4223115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123907
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65570	NC_017154	AATA	2	8	4223434	4223441	75 %	25 %	0 %	0 %	384123908
65571	NC_017154	CAA	2	6	4223457	4223462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123908
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65583	NC_017154	CTGA	2	8	4223891	4223898	25 %	25 %	25 %	25 %	384123909
65584	NC_017154	TCA	2	6	4223916	4223921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123909
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65600	NC_017154	CTG	2	6	4224562	4224567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123910
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65606	NC_017154	CAC	2	6	4224921	4224926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123910
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65611	NC_017154	GA	4	8	4225139	4225146	50 %	0 %	50 %	0 %	384123910
65612	NC_017154	GAAT	2	8	4225149	4225156	50 %	25 %	25 %	0 %	384123910
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