MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017154	AAT	3	9	385776	385784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120918
6002	NC_017154	GGC	2	6	385785	385790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120918
6003	NC_017154	ATA	3	9	385804	385812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120918
6004	NC_017154	GGT	2	6	385815	385820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120918
6005	NC_017154	GCC	2	6	385832	385837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120918
6006	NC_017154	GAT	2	6	385845	385850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120918
6007	NC_017154	A	6	6	385869	385874	100 %	0 %	0 %	0 %	384120918
6008	NC_017154	GTG	2	6	385906	385911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120918
6009	NC_017154	TGT	2	6	385964	385969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120918
6010	NC_017154	TGT	2	6	385973	385978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120918
6011	NC_017154	AAG	2	6	386014	386019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120918
6012	NC_017154	GTG	2	6	386026	386031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120918
6013	NC_017154	GCCTG	2	10	386069	386078	0 %	20 %	40 %	40 %	384120918
6014	NC_017154	CGTG	2	8	386129	386136	0 %	25 %	50 %	25 %	384120918
6015	NC_017154	ACAG	2	8	386274	386281	50 %	0 %	25 %	25 %	384120918
6016	NC_017154	GTG	2	6	386290	386295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120918
6017	NC_017154	GAA	2	6	386373	386378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120918
6018	NC_017154	GCT	2	6	386430	386435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120918
6019	NC_017154	AGA	2	6	386444	386449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120918
6020	NC_017154	TGA	2	6	386465	386470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120918
6021	NC_017154	TGC	2	6	386477	386482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120918
6022	NC_017154	AAC	2	6	386494	386499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120918
6023	NC_017154	AGA	2	6	386573	386578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120918
6024	NC_017154	TGC	2	6	386644	386649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120918
6025	NC_017154	AAT	2	6	386754	386759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120918
6026	NC_017154	TGC	2	6	386785	386790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120918
6027	NC_017154	TGC	2	6	386801	386806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120918
6028	NC_017154	TAA	2	6	386807	386812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120918
6029	NC_017154	CAA	2	6	386822	386827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120918
6030	NC_017154	CAG	2	6	386861	386866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120918
6031	NC_017154	CAA	2	6	386868	386873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120918
6032	NC_017154	GA	3	6	386969	386974	50 %	0 %	50 %	0 %	384120918
6033	NC_017154	T	6	6	386993	386998	0 %	100 %	0 %	0 %	384120919
6034	NC_017154	TCG	2	6	387004	387009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120919
6035	NC_017154	CTTCG	2	10	387029	387038	0 %	40 %	20 %	40 %	384120919
6036	NC_017154	AGA	2	6	387050	387055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120919
6037	NC_017154	TGC	2	6	387073	387078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120919
6038	NC_017154	GTGATA	2	12	387097	387108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120919
6039	NC_017154	GAA	2	6	387230	387235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120919
6040	NC_017154	TTG	2	6	387244	387249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120919
6041	NC_017154	GGT	3	9	387303	387311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120919
6042	NC_017154	CTG	2	6	387333	387338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120919
6043	NC_017154	GAT	2	6	387489	387494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120919
6044	NC_017154	CTG	2	6	387505	387510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120919
6045	NC_017154	GGC	2	6	387569	387574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120919
6046	NC_017154	CTG	2	6	387622	387627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120919
6047	NC_017154	CGT	2	6	387681	387686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120919
6048	NC_017154	TGCG	2	8	387721	387728	0 %	25 %	50 %	25 %	384120919
6049	NC_017154	GTG	2	6	387790	387795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120919
6050	NC_017154	TGCG	2	8	387874	387881	0 %	25 %	50 %	25 %	384120919
6051	NC_017154	CAG	2	6	387896	387901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120919
6052	NC_017154	TTC	2	6	387939	387944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120919
6053	NC_017154	CGT	3	9	388469	388477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120920
6054	NC_017154	CTG	2	6	388524	388529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120920
6055	NC_017154	TGT	2	6	388547	388552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120920
6056	NC_017154	TTC	2	6	388612	388617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120920
6057	NC_017154	CAT	2	6	388658	388663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120920
6058	NC_017154	TGA	2	6	388696	388701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120920
6059	NC_017154	GC	3	6	388722	388727	0 %	0 %	50 %	50 %	384120920
6060	NC_017154	GTG	2	6	388822	388827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120920
6061	NC_017154	TAC	2	6	388841	388846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120920
6062	NC_017154	CGC	2	6	388887	388892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120920
6063	NC_017154	GAAA	2	8	388943	388950	75 %	0 %	25 %	0 %	384120920
6064	NC_017154	TAC	2	6	388983	388988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120920
6065	NC_017154	GCG	2	6	388995	389000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120920
6066	NC_017154	GAT	2	6	389022	389027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120920
6067	NC_017154	TTG	2	6	389079	389084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120920
6068	NC_017154	ACC	2	6	389187	389192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120920
6069	NC_017154	GCAA	2	8	389332	389339	50 %	0 %	25 %	25 %	384120920
6070	NC_017154	CGT	2	6	389373	389378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120920
6071	NC_017154	CTGG	2	8	389380	389387	0 %	25 %	50 %	25 %	384120920
6072	NC_017154	GTGCA	2	10	389410	389419	20 %	20 %	40 %	20 %	384120920
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6078	NC_017154	TC	3	6	390234	390239	0 %	50 %	0 %	50 %	384120921
6079	NC_017154	AATC	2	8	390259	390266	50 %	25 %	0 %	25 %	384120921
6080	NC_017154	TGG	2	6	390310	390315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120921
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6084	NC_017154	CGT	2	6	390959	390964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120922
6085	NC_017154	TGCG	2	8	390966	390973	0 %	25 %	50 %	25 %	384120922
6086	NC_017154	CGT	2	6	391004	391009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120922
6087	NC_017154	ATGGCT	2	12	391071	391082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384120922
6088	NC_017154	GAT	2	6	391106	391111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120922
6089	NC_017154	TC	3	6	391117	391122	0 %	50 %	0 %	50 %	384120922
6090	NC_017154	GCAGA	2	10	391124	391133	40 %	0 %	40 %	20 %	384120922
6091	NC_017154	GTC	2	6	391157	391162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120922
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6093	NC_017154	CGTG	2	8	391213	391220	0 %	25 %	50 %	25 %	384120922
6094	NC_017154	CCAG	2	8	391236	391243	25 %	0 %	25 %	50 %	384120922
6095	NC_017154	GTC	2	6	391299	391304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120922
6096	NC_017154	CAG	2	6	391326	391331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120922
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6099	NC_017154	GAA	2	6	391550	391555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120922
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6101	NC_017154	GAA	2	6	391648	391653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120922
6102	NC_017154	GGC	2	6	391658	391663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120922
6103	NC_017154	TTA	2	6	391699	391704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120922
6104	NC_017154	TGC	2	6	391785	391790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120922
6105	NC_017154	GC	4	8	392048	392055	0 %	0 %	50 %	50 %	384120922
6106	NC_017154	GGGA	2	8	392062	392069	25 %	0 %	75 %	0 %	384120922
6107	NC_017154	AGA	2	6	392083	392088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120922
6108	NC_017154	ATG	2	6	392148	392153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120922
6109	NC_017154	CGG	2	6	392196	392201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120922
6110	NC_017154	GAA	2	6	392222	392227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120922
6111	NC_017154	GTT	2	6	392233	392238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120922
6112	NC_017154	GT	3	6	392286	392291	0 %	50 %	50 %	0 %	384120922
6113	NC_017154	GGGC	2	8	392317	392324	0 %	0 %	75 %	25 %	384120922
6114	NC_017154	ATT	2	6	392343	392348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120922
6115	NC_017154	GATG	2	8	392356	392363	25 %	25 %	50 %	0 %	384120922
6116	NC_017154	TGC	2	6	392391	392396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120922
6117	NC_017154	TTTGG	2	10	392455	392464	0 %	60 %	40 %	0 %	384120922
6118	NC_017154	CTT	2	6	392471	392476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120922
6119	NC_017154	TCACC	2	10	392486	392495	20 %	20 %	0 %	60 %	384120922
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6489	NC_017154	GA	3	6	414561	414566	50 %	0 %	50 %	0 %	384120939
6490	NC_017154	ATTT	2	8	414637	414644	25 %	75 %	0 %	0 %	384120939
6491	NC_017154	ATGAA	2	10	414724	414733	60 %	20 %	20 %	0 %	384120939
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6493	NC_017154	ATG	2	6	414849	414854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120939
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6496	NC_017154	A	6	6	414944	414949	100 %	0 %	0 %	0 %	384120940
6497	NC_017154	GCTCTT	2	12	414990	415001	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384120940
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