MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_017154	TGAT	2	8	4113654	4113661	25 %	50 %	25 %	0 %	384123837
64003	NC_017154	GGT	2	6	4113665	4113670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123837
64004	NC_017154	GCT	2	6	4113689	4113694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123837
64005	NC_017154	AAG	2	6	4113708	4113713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123837
64006	NC_017154	TG	3	6	4113763	4113768	0 %	50 %	50 %	0 %	384123837
64007	NC_017154	TAAT	2	8	4113831	4113838	50 %	50 %	0 %	0 %	384123837
64008	NC_017154	AGC	2	6	4113874	4113879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123837
64009	NC_017154	GCA	2	6	4113937	4113942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123837
64010	NC_017154	CTA	2	6	4113949	4113954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123837
64011	NC_017154	TGA	2	6	4113955	4113960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123837
64012	NC_017154	TTC	2	6	4113983	4113988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123837
64013	NC_017154	CAT	2	6	4113992	4113997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123837
64014	NC_017154	A	6	6	4114027	4114032	100 %	0 %	0 %	0 %	384123837
64015	NC_017154	TTG	2	6	4114037	4114042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123837
64016	NC_017154	TTCGGT	2	12	4114055	4114066	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384123837
64017	NC_017154	ATT	2	6	4114132	4114137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123837
64018	NC_017154	ATT	2	6	4114171	4114176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123837
64019	NC_017154	ACC	2	6	4114183	4114188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123837
64020	NC_017154	ACA	2	6	4114189	4114194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123837
64021	NC_017154	TGC	2	6	4114228	4114233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123837
64022	NC_017154	ATG	2	6	4114263	4114268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123837
64023	NC_017154	TCG	2	6	4114296	4114301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123837
64024	NC_017154	GATAAA	2	12	4114323	4114334	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384123837
64025	NC_017154	GGCTG	2	10	4114424	4114433	0 %	20 %	60 %	20 %	384123838
64026	NC_017154	ATT	3	9	4114469	4114477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123838
64027	NC_017154	TGA	2	6	4114702	4114707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123838
64028	NC_017154	TTG	2	6	4114788	4114793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123838
64029	NC_017154	TGC	2	6	4114795	4114800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123838
64030	NC_017154	GTG	2	6	4114986	4114991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123838
64031	NC_017154	CGTT	2	8	4114999	4115006	0 %	50 %	25 %	25 %	384123838
64032	NC_017154	TGC	2	6	4115007	4115012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123838
64033	NC_017154	TGA	2	6	4115076	4115081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123838
64034	NC_017154	ATT	2	6	4115129	4115134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123838
64035	NC_017154	GCGGT	2	10	4115169	4115178	0 %	20 %	60 %	20 %	384123838
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64037	NC_017154	TTA	2	6	4115438	4115443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123838
64038	NC_017154	TGA	2	6	4115497	4115502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123838
64039	NC_017154	GAA	2	6	4115507	4115512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123838
64040	NC_017154	GGT	2	6	4115540	4115545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123838
64041	NC_017154	GAA	2	6	4115615	4115620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123838
64042	NC_017154	GCA	2	6	4115666	4115671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123838
64043	NC_017154	GAC	2	6	4116893	4116898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123839
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64047	NC_017154	TGGA	2	8	4117152	4117159	25 %	25 %	50 %	0 %	384123839
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64050	NC_017154	AGA	2	6	4117302	4117307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123840
64051	NC_017154	A	6	6	4117349	4117354	100 %	0 %	0 %	0 %	384123840
64052	NC_017154	CCG	2	6	4117417	4117422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123840
64053	NC_017154	TC	3	6	4117496	4117501	0 %	50 %	0 %	50 %	384123840
64054	NC_017154	ACC	2	6	4117556	4117561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123840
64055	NC_017154	CAAG	2	8	4117570	4117577	50 %	0 %	25 %	25 %	384123840
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64067	NC_017154	ACGT	2	8	4118211	4118218	25 %	25 %	25 %	25 %	384123840
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64100	NC_017154	AGA	2	6	4119546	4119551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123841
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64102	NC_017154	CT	3	6	4119563	4119568	0 %	50 %	0 %	50 %	384123841
64103	NC_017154	GAA	2	6	4119587	4119592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123841
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64115	NC_017154	CGC	2	6	4120102	4120107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123841
64116	NC_017154	GTG	2	6	4120128	4120133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123841
64117	NC_017154	GTA	2	6	4120151	4120156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123841
64118	NC_017154	GTT	2	6	4120160	4120165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123841
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64120	NC_017154	TCA	2	6	4120347	4120352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123841
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64122	NC_017154	TGA	2	6	4120381	4120386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123841
64123	NC_017154	TTG	2	6	4120388	4120393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123841
64124	NC_017154	CGTA	2	8	4120435	4120442	25 %	25 %	25 %	25 %	384123841
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64128	NC_017154	TGA	2	6	4120588	4120593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123841
64129	NC_017154	CTG	2	6	4120662	4120667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123841
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64219	NC_017154	T	7	7	4127971	4127977	0 %	100 %	0 %	0 %	384123848
64220	NC_017154	T	6	6	4127990	4127995	0 %	100 %	0 %	0 %	384123848
64221	NC_017154	ATC	2	6	4128017	4128022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123848
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64226	NC_017154	CTTT	2	8	4128282	4128289	0 %	75 %	0 %	25 %	384123848
64227	NC_017154	TGCTT	2	10	4128301	4128310	0 %	60 %	20 %	20 %	384123848
64228	NC_017154	TCA	2	6	4128319	4128324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123848
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