MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61502	NC_017154	GCA	2	6	3950639	3950644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123701
61503	NC_017154	CGG	2	6	3950670	3950675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123701
61504	NC_017154	GT	3	6	3950679	3950684	0 %	50 %	50 %	0 %	384123701
61505	NC_017154	ATT	2	6	3950687	3950692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123701
61506	NC_017154	GTG	2	6	3950730	3950735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123701
61507	NC_017154	CGG	2	6	3950762	3950767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123701
61508	NC_017154	TGG	2	6	3950779	3950784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123701
61509	NC_017154	ATT	2	6	3950850	3950855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123701
61510	NC_017154	GGGC	2	8	3950887	3950894	0 %	0 %	75 %	25 %	384123701
61511	NC_017154	TTGA	2	8	3950912	3950919	25 %	50 %	25 %	0 %	384123701
61512	NC_017154	ATT	2	6	3950924	3950929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123701
61513	NC_017154	CTG	2	6	3950954	3950959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123701
61514	NC_017154	ATT	2	6	3951125	3951130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123701
61515	NC_017154	CT	3	6	3951143	3951148	0 %	50 %	0 %	50 %	384123701
61516	NC_017154	AGA	2	6	3951157	3951162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123701
61517	NC_017154	ATG	2	6	3951260	3951265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123701
61518	NC_017154	GCG	2	6	3951270	3951275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123701
61519	NC_017154	ATGCGA	2	12	3951309	3951320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384123701
61520	NC_017154	AGA	2	6	3951343	3951348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123701
61521	NC_017154	ATG	2	6	3951377	3951382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123701
61522	NC_017154	GCT	2	6	3951392	3951397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123701
61523	NC_017154	GGC	2	6	3951427	3951432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123701
61524	NC_017154	AGG	2	6	3951555	3951560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384123701
61525	NC_017154	TGGC	2	8	3951583	3951590	0 %	25 %	50 %	25 %	384123702
61526	NC_017154	GAT	2	6	3951606	3951611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123702
61527	NC_017154	GGC	2	6	3951627	3951632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123702
61528	NC_017154	GC	3	6	3951833	3951838	0 %	0 %	50 %	50 %	384123702
61529	NC_017154	CAT	2	6	3951843	3951848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123702
61530	NC_017154	TGA	2	6	3951876	3951881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123702
61531	NC_017154	TGC	2	6	3951893	3951898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123702
61532	NC_017154	GATC	2	8	3952005	3952012	25 %	25 %	25 %	25 %	384123702
61533	NC_017154	ACA	2	6	3952030	3952035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123702
61534	NC_017154	AGC	2	6	3952160	3952165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123702
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61536	NC_017154	ACTT	2	8	3952358	3952365	25 %	50 %	0 %	25 %	384123703
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61538	NC_017154	CAT	2	6	3952389	3952394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123703
61539	NC_017154	C	6	6	3952422	3952427	0 %	0 %	0 %	100 %	384123703
61540	NC_017154	AGGAT	2	10	3952501	3952510	40 %	20 %	40 %	0 %	384123703
61541	NC_017154	CAAGC	2	10	3952543	3952552	40 %	0 %	20 %	40 %	384123703
61542	NC_017154	TCA	2	6	3952601	3952606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123703
61543	NC_017154	TGC	2	6	3952795	3952800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123703
61544	NC_017154	TGG	2	6	3952876	3952881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123703
61545	NC_017154	CAT	2	6	3952983	3952988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123703
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61550	NC_017154	CGG	2	6	3953185	3953190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123703
61551	NC_017154	TCA	2	6	3953208	3953213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123703
61552	NC_017154	TGC	2	6	3953490	3953495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123704
61553	NC_017154	TCG	2	6	3953522	3953527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123704
61554	NC_017154	ACA	2	6	3953626	3953631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123704
61555	NC_017154	GCA	2	6	3953808	3953813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123704
61556	NC_017154	A	6	6	3953918	3953923	100 %	0 %	0 %	0 %	384123704
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61559	NC_017154	CGT	2	6	3954109	3954114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123704
61560	NC_017154	GC	3	6	3954182	3954187	0 %	0 %	50 %	50 %	384123704
61561	NC_017154	GCA	2	6	3954225	3954230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123704
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61565	NC_017154	AAC	2	6	3954635	3954640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123704
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61583	NC_017154	CTTG	2	8	3955895	3955902	0 %	50 %	25 %	25 %	384123705
61584	NC_017154	CCAG	2	8	3955907	3955914	25 %	0 %	25 %	50 %	384123705
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61587	NC_017154	GTC	2	6	3956031	3956036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123705
61588	NC_017154	TGA	2	6	3956060	3956065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123705
61589	NC_017154	T	6	6	3956085	3956090	0 %	100 %	0 %	0 %	384123705
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61592	NC_017154	GTAA	2	8	3956949	3956956	50 %	25 %	25 %	0 %	384123706
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61599	NC_017154	CCAC	2	8	3958612	3958619	25 %	0 %	0 %	75 %	384123707
61600	NC_017154	ATT	4	12	3958647	3958658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123707
61601	NC_017154	GCC	2	6	3958659	3958664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123707
61602	NC_017154	CGGG	2	8	3958677	3958684	0 %	0 %	75 %	25 %	384123707
61603	NC_017154	GGC	2	6	3958788	3958793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123707
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61606	NC_017154	ACG	2	6	3959393	3959398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123708
61607	NC_017154	GCCGAT	2	12	3959400	3959411	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384123708
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61611	NC_017154	CG	3	6	3959625	3959630	0 %	0 %	50 %	50 %	384123708
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61614	NC_017154	GTG	2	6	3959866	3959871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123708
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