MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_017154	GCC	2	6	3800364	3800369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123582
59002	NC_017154	TGG	2	6	3800394	3800399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123582
59003	NC_017154	GCC	2	6	3800427	3800432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123582
59004	NC_017154	CGA	2	6	3800491	3800496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123582
59005	NC_017154	TCA	2	6	3800538	3800543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123582
59006	NC_017154	G	7	7	3800629	3800635	0 %	0 %	100 %	0 %	384123582
59007	NC_017154	ACA	2	6	3800668	3800673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123582
59008	NC_017154	CGG	2	6	3800758	3800763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123582
59009	NC_017154	TAT	2	6	3800764	3800769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123582
59010	NC_017154	CTA	2	6	3800863	3800868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123582
59011	NC_017154	GCTTT	2	10	3800892	3800901	0 %	60 %	20 %	20 %	384123582
59012	NC_017154	ACG	2	6	3800927	3800932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123582
59013	NC_017154	CAA	2	6	3801072	3801077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123583
59014	NC_017154	GAC	2	6	3801133	3801138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123583
59015	NC_017154	ATC	2	6	3801217	3801222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123583
59016	NC_017154	CG	3	6	3801311	3801316	0 %	0 %	50 %	50 %	384123583
59017	NC_017154	GTG	2	6	3801358	3801363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123583
59018	NC_017154	TG	3	6	3801388	3801393	0 %	50 %	50 %	0 %	384123583
59019	NC_017154	ATG	2	6	3801649	3801654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123583
59020	NC_017154	GAT	2	6	3801693	3801698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123583
59021	NC_017154	AGA	2	6	3801759	3801764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123583
59022	NC_017154	CTA	2	6	3801810	3801815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123583
59023	NC_017154	ATT	2	6	3802305	3802310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123584
59024	NC_017154	GCA	2	6	3802451	3802456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123584
59025	NC_017154	TGG	2	6	3802501	3802506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123584
59026	NC_017154	GCT	2	6	3802592	3802597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123584
59027	NC_017154	TGG	2	6	3802632	3802637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123584
59028	NC_017154	GGC	2	6	3802649	3802654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123584
59029	NC_017154	GTG	3	9	3802687	3802695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123584
59030	NC_017154	CAG	2	6	3802730	3802735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123584
59031	NC_017154	GCA	2	6	3802767	3802772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123584
59032	NC_017154	GGGC	2	8	3802780	3802787	0 %	0 %	75 %	25 %	384123584
59033	NC_017154	TA	3	6	3802807	3802812	50 %	50 %	0 %	0 %	384123584
59034	NC_017154	CCTGTG	2	12	3802856	3802867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123584
59035	NC_017154	A	6	6	3803007	3803012	100 %	0 %	0 %	0 %	384123584
59036	NC_017154	CCTAT	2	10	3803036	3803045	20 %	40 %	0 %	40 %	384123584
59037	NC_017154	CTGGC	2	10	3803111	3803120	0 %	20 %	40 %	40 %	384123584
59038	NC_017154	CAGC	2	8	3803158	3803165	25 %	0 %	25 %	50 %	384123584
59039	NC_017154	ATT	2	6	3803296	3803301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123585
59040	NC_017154	TAA	2	6	3803305	3803310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123585
59041	NC_017154	TTC	2	6	3803369	3803374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123585
59042	NC_017154	TAA	2	6	3803379	3803384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123585
59043	NC_017154	CTT	2	6	3803392	3803397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123585
59044	NC_017154	ATTG	2	8	3803422	3803429	25 %	50 %	25 %	0 %	384123585
59045	NC_017154	GCAC	2	8	3803430	3803437	25 %	0 %	25 %	50 %	384123585
59046	NC_017154	CTT	2	6	3803443	3803448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123585
59047	NC_017154	GCTC	2	8	3803497	3803504	0 %	25 %	25 %	50 %	384123585
59048	NC_017154	GCC	2	6	3803520	3803525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123585
59049	NC_017154	TTCA	2	8	3803567	3803574	25 %	50 %	0 %	25 %	384123585
59050	NC_017154	CGG	2	6	3804041	3804046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123586
59051	NC_017154	TCA	2	6	3804079	3804084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123586
59052	NC_017154	CGC	2	6	3804117	3804122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123586
59053	NC_017154	ACC	2	6	3804196	3804201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123586
59054	NC_017154	TGC	2	6	3804315	3804320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59055	NC_017154	GGT	2	6	3804334	3804339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123586
59056	NC_017154	CCAC	2	8	3804341	3804348	25 %	0 %	0 %	75 %	384123586
59057	NC_017154	CGG	2	6	3804392	3804397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123586
59058	NC_017154	TCG	2	6	3804442	3804447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59059	NC_017154	ACA	2	6	3804470	3804475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123586
59060	NC_017154	CAT	2	6	3804482	3804487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123586
59061	NC_017154	CA	3	6	3804503	3804508	50 %	0 %	0 %	50 %	384123586
59062	NC_017154	TG	3	6	3804517	3804522	0 %	50 %	50 %	0 %	384123586
59063	NC_017154	GCATCG	2	12	3804562	3804573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59064	NC_017154	CAG	2	6	3804579	3804584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59065	NC_017154	GCCA	2	8	3804595	3804602	25 %	0 %	25 %	50 %	384123586
59066	NC_017154	CGA	2	6	3804637	3804642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59067	NC_017154	ATC	2	6	3804661	3804666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123586
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59069	NC_017154	CAG	2	6	3804752	3804757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123586
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59071	NC_017154	CTT	2	6	3804872	3804877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123586
59072	NC_017154	CCG	2	6	3805022	3805027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123586
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59074	NC_017154	ATG	2	6	3805117	3805122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123586
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59076	NC_017154	ATG	2	6	3805159	3805164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123586
59077	NC_017154	TG	3	6	3805176	3805181	0 %	50 %	50 %	0 %	384123586
59078	NC_017154	GTC	2	6	3805186	3805191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59079	NC_017154	GTA	2	6	3805303	3805308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123586
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59081	NC_017154	CAGG	2	8	3805460	3805467	25 %	0 %	50 %	25 %	384123586
59082	NC_017154	TGG	2	6	3805487	3805492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123586
59083	NC_017154	TTCAA	2	10	3805561	3805570	40 %	40 %	0 %	20 %	384123586
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59086	NC_017154	ACCAC	2	10	3805735	3805744	40 %	0 %	0 %	60 %	384123586
59087	NC_017154	GTC	2	6	3805773	3805778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59088	NC_017154	ATA	2	6	3805790	3805795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123586
59089	NC_017154	GGA	2	6	3805818	3805823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384123586
59090	NC_017154	T	6	6	3805866	3805871	0 %	100 %	0 %	0 %	384123586
59091	NC_017154	TTC	2	6	3805878	3805883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123586
59092	NC_017154	TTC	2	6	3805942	3805947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123586
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59094	NC_017154	TACGGT	2	12	3806043	3806054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384123586
59095	NC_017154	GATA	2	8	3806080	3806087	50 %	25 %	25 %	0 %	384123586
59096	NC_017154	TCT	2	6	3806152	3806157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123586
59097	NC_017154	CGT	2	6	3806159	3806164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59098	NC_017154	CGC	2	6	3806205	3806210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123586
59099	NC_017154	AGC	2	6	3806284	3806289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59100	NC_017154	AGC	2	6	3806343	3806348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59101	NC_017154	TCA	2	6	3806377	3806382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123586
59102	NC_017154	CAG	2	6	3806406	3806411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59103	NC_017154	TTC	3	9	3806424	3806432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123586
59104	NC_017154	T	6	6	3806446	3806451	0 %	100 %	0 %	0 %	384123586
59105	NC_017154	GCA	2	6	3806512	3806517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123586
59106	NC_017154	TTC	2	6	3806541	3806546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123586
59107	NC_017154	TTAC	2	8	3807122	3807129	25 %	50 %	0 %	25 %	384123587
59108	NC_017154	CA	3	6	3807404	3807409	50 %	0 %	0 %	50 %	384123587
59109	NC_017154	TTG	2	6	3807601	3807606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123587
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59111	NC_017154	TCT	2	6	3807938	3807943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123588
59112	NC_017154	CAC	2	6	3808014	3808019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123588
59113	NC_017154	GCC	2	6	3808100	3808105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123588
59114	NC_017154	CTT	2	6	3808149	3808154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123588
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59116	NC_017154	TG	3	6	3808326	3808331	0 %	50 %	50 %	0 %	384123588
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