MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_017154	TTTA	2	8	3737818	3737825	25 %	75 %	0 %	0 %	384123529
58003	NC_017154	CTT	2	6	3737870	3737875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123530
58004	NC_017154	GCG	2	6	3737906	3737911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123530
58005	NC_017154	CCG	2	6	3737936	3737941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123530
58006	NC_017154	CAT	2	6	3737963	3737968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123530
58007	NC_017154	CGG	2	6	3737979	3737984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123530
58008	NC_017154	GGC	2	6	3738047	3738052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123530
58009	NC_017154	TAA	2	6	3738159	3738164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123530
58010	NC_017154	GCC	3	9	3738178	3738186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123530
58011	NC_017154	TGA	2	6	3738199	3738204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123530
58012	NC_017154	CGC	2	6	3738255	3738260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123530
58013	NC_017154	CAT	2	6	3738284	3738289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123530
58014	NC_017154	TGC	2	6	3738391	3738396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123530
58015	NC_017154	CAT	2	6	3738557	3738562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123530
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58017	NC_017154	ATC	2	6	3738583	3738588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123531
58018	NC_017154	ATT	2	6	3738605	3738610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123531
58019	NC_017154	CAC	2	6	3738616	3738621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123531
58020	NC_017154	CAT	2	6	3738672	3738677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123531
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58022	NC_017154	CGG	2	6	3738722	3738727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123531
58023	NC_017154	CAA	2	6	3738912	3738917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123531
58024	NC_017154	CGT	2	6	3738964	3738969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123531
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58034	NC_017154	GC	3	6	3739426	3739431	0 %	0 %	50 %	50 %	384123531
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58036	NC_017154	TACGAA	2	12	3739470	3739481	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384123531
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58039	NC_017154	CAGGT	2	10	3739592	3739601	20 %	20 %	40 %	20 %	384123531
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58041	NC_017154	ACC	2	6	3739653	3739658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123532
58042	NC_017154	CAC	2	6	3739678	3739683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123532
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58050	NC_017154	GA	3	6	3740270	3740275	50 %	0 %	50 %	0 %	384123533
58051	NC_017154	TAAA	2	8	3740288	3740295	75 %	25 %	0 %	0 %	384123533
58052	NC_017154	TCT	2	6	3740313	3740318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123533
58053	NC_017154	GAT	2	6	3740365	3740370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123533
58054	NC_017154	TCA	2	6	3740397	3740402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123533
58055	NC_017154	TAA	2	6	3740447	3740452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123533
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58059	NC_017154	CAT	2	6	3740650	3740655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123533
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58062	NC_017154	GGAT	2	8	3740790	3740797	25 %	25 %	50 %	0 %	384123533
58063	NC_017154	GTGG	2	8	3740821	3740828	0 %	25 %	75 %	0 %	384123533
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58089	NC_017154	T	6	6	3742279	3742284	0 %	100 %	0 %	0 %	384123536
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58116	NC_017154	CAT	2	6	3744079	3744084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123537
58117	NC_017154	GCA	2	6	3744109	3744114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123537
58118	NC_017154	TGC	2	6	3744123	3744128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123537
58119	NC_017154	TCA	2	6	3744159	3744164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123537
58120	NC_017154	CTGA	2	8	3744220	3744227	25 %	25 %	25 %	25 %	384123537
58121	NC_017154	CTC	2	6	3744291	3744296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384123538
58122	NC_017154	TGG	2	6	3744372	3744377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123538
58123	NC_017154	CAG	2	6	3744449	3744454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123538
58124	NC_017154	TCT	2	6	3744477	3744482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123538
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58128	NC_017154	AATA	2	8	3744756	3744763	75 %	25 %	0 %	0 %	384123538
58129	NC_017154	TCA	2	6	3744788	3744793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123538
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58134	NC_017154	GC	3	6	3745060	3745065	0 %	0 %	50 %	50 %	384123538
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58231	NC_017154	TCA	2	6	3751600	3751605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123543
58232	NC_017154	TTC	2	6	3751632	3751637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123543
58233	NC_017154	TGGT	2	8	3751683	3751690	0 %	50 %	50 %	0 %	384123543
58234	NC_017154	ACC	2	6	3751827	3751832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123543
58235	NC_017154	CGC	2	6	3751842	3751847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123543
58236	NC_017154	TGC	2	6	3751848	3751853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123543
58237	NC_017154	CTG	2	6	3751932	3751937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123543
58238	NC_017154	T	6	6	3752103	3752108	0 %	100 %	0 %	0 %	384123543
58239	NC_017154	CTT	2	6	3752138	3752143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123543
58240	NC_017154	CTG	2	6	3752144	3752149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123543
58241	NC_017154	ACC	3	9	3752176	3752184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123543
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58243	NC_017154	GTT	2	6	3752276	3752281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123543
58244	NC_017154	TGG	2	6	3752337	3752342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123543
58245	NC_017154	GCT	2	6	3752378	3752383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123543
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58248	NC_017154	GGA	2	6	3752500	3752505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384123543
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58252	NC_017154	CTGG	2	8	3753054	3753061	0 %	25 %	50 %	25 %	384123544
58253	NC_017154	GCC	2	6	3753074	3753079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123544
58254	NC_017154	ATC	2	6	3753117	3753122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123544
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58260	NC_017154	T	6	6	3753628	3753633	0 %	100 %	0 %	0 %	384123545
58261	NC_017154	ATC	3	9	3753634	3753642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123545
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58303	NC_017154	GGT	2	6	3756752	3756757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123548
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58319	NC_017154	GCA	2	6	3757723	3757728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123548
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58322	NC_017154	ATG	2	6	3757888	3757893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123548
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58324	NC_017154	GTT	2	6	3758004	3758009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123548
58325	NC_017154	ACG	2	6	3758010	3758015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123548
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58333	NC_017154	CGA	2	6	3758718	3758723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123549
58334	NC_017154	TCA	2	6	3758844	3758849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123549
58335	NC_017154	CT	3	6	3758947	3758952	0 %	50 %	0 %	50 %	384123549
58336	NC_017154	CCG	2	6	3758958	3758963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123549
58337	NC_017154	AGA	2	6	3758991	3758996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123549
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58339	NC_017154	TCA	2	6	3759044	3759049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123549
58340	NC_017154	ACC	2	6	3759092	3759097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123549
58341	NC_017154	TCA	2	6	3759131	3759136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123549
58342	NC_017154	GC	3	6	3759145	3759150	0 %	0 %	50 %	50 %	384123549
58343	NC_017154	GC	3	6	3759254	3759259	0 %	0 %	50 %	50 %	384123549
58344	NC_017154	ATA	2	6	3759260	3759265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123549
58345	NC_017154	CTG	2	6	3759288	3759293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123549
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58348	NC_017154	CAA	2	6	3759923	3759928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123550
58349	NC_017154	GGA	2	6	3760083	3760088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384123550
58350	NC_017154	C	8	8	3760118	3760125	0 %	0 %	0 %	100 %	384123550
58351	NC_017154	CGC	2	6	3760129	3760134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123550
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58446	NC_017154	AT	3	6	3766591	3766596	50 %	50 %	0 %	0 %	384123553
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58449	NC_017154	AT	3	6	3766889	3766894	50 %	50 %	0 %	0 %	384123554
58450	NC_017154	TTCT	2	8	3766924	3766931	0 %	75 %	0 %	25 %	384123554
58451	NC_017154	TAA	2	6	3767054	3767059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123554
58452	NC_017154	AGC	2	6	3767076	3767081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123554
58453	NC_017154	TGA	2	6	3767086	3767091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123554
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58455	NC_017154	TCT	2	6	3767196	3767201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123554
58456	NC_017154	A	6	6	3767227	3767232	100 %	0 %	0 %	0 %	384123554
58457	NC_017154	TCT	2	6	3767319	3767324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123554
58458	NC_017154	C	6	6	3767407	3767412	0 %	0 %	0 %	100 %	384123554
58459	NC_017154	GTT	2	6	3767437	3767442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123554
58460	NC_017154	T	7	7	3767457	3767463	0 %	100 %	0 %	0 %	384123554
58461	NC_017154	TCT	2	6	3767472	3767477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123554
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